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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000741; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00002054-RA_Salv SmilChr05G000741 ARF XP_057764423.1 MP00021 TTGTCGGAAA

可能结合的靶基因

9812 个结合位点 7629 个候选靶基因 第 80 / 153 下载 TSV

上一页 80 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002885 Chr03 NC_080389.1:45513344-45513353promoter 内 478-487 bp - 3514 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 45516867-45517284(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr03G004049 Chr03 NC_080389.1:59458698-59458707promoter 内 474-483 bp - 3518 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 59462225-59464669(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr04G003982 Chr04 NC_080390.1:55257023-55257032promoter 内 468-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 55260556-55264399(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCGCCGACAA
SmilChr05G002087 Chr05 NC_080391.1:21856961-21856970promoter 内 463-472 bp - 3529 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 21860499-21869548(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGTCCGACAC
SmilChr04G002658 Chr04 NC_080390.1:41984678-41984687promoter 内 451-460 bp - 3541 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 41974289-41981137(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr03G003173 Chr03 NC_080389.1:49120308-49120317promoter 内 438-447 bp + 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 49111047-49116754(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr02G002983 Chr02 NC_080388.1:50425168-50425177promoter 内 429-438 bp + 3563 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50415867-50421605(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr04G003005 Chr04 NC_080390.1:46433022-46433031promoter 内 394-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 46436629-46440366(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr02G002643 Chr02 NC_080388.1:45828544-45828553promoter 内 377-386 bp - 3615 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 45832168-45832240(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGTCCGACAC
SmilChr02G004220 Chr02 NC_080388.1:64411438-64411447promoter 内 374-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 64415065-64415801(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr04G001962 Chr04 NC_080390.1:31818583-31818592promoter 内 374-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31810581-31814965(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCGCCGACAA
SmilChr04G000789 Chr04 NC_080390.1:9719123-9719132promoter 内 370-379 bp + 3622 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 9708781-9715501(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr01G004556 Chr01 NC_080387.1:63656048-63656057promoter 内 369-378 bp + 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 63651415-63652425(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr01G003140 Chr01 NC_080387.1:50230396-50230405promoter 内 368-377 bp + 3624 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 50234029-50239713(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr04G003211 Chr04 NC_080390.1:48956686-48956695promoter 内 334-343 bp + 3658 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 48949281-48953028(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr04G000691 Chr04 NC_080390.1:8041716-8041725promoter 内 329-338 bp + 3663 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 8045388-8050027(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr02G000544 Chr02 NC_080388.1:7496633-7496642promoter 内 308-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 7500326-7500844(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr02G001119 Chr02 NC_080388.1:20152486-20152495promoter 内 307-316 bp + 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 20156180-20156251(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr03G002759 Chr03 NC_080389.1:43878735-43878744promoter 内 300-309 bp - 3692 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 43872477-43875043(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr02G000060 Chr02 NC_080388.1:777337-777346promoter 内 299-308 bp + 3693 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 772169-773644(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr01G003666 Chr01 NC_080387.1:55091637-55091646promoter 内 289-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 55080249-55087934(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr02G004619 Chr02 NC_080388.1:68697217-68697226promoter 内 286-295 bp - 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 68700932-68727977(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr01G000149 Chr01 NC_080387.1:2551122-2551131promoter 内 283-292 bp - 3709 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 2554840-2563158(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CGTCCGACAC
SmilChr04G003767 Chr04 NC_080390.1:53894821-53894830promoter 内 246-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 53898576-53900830(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr02G004807 Chr02 NC_080388.1:70244050-70244059promoter 内 242-251 bp - 3750 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 70236589-70240300(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGCGG
SmilChr02G003731 Chr02 NC_080388.1:58951907-58951916promoter 内 240-249 bp + 3752 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 58942849-58948155(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCGCCGACAA
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SmilChr04G002236 Chr04 NC_080390.1:36087250-36087259promoter 内 213-222 bp + 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 36091038-36091898(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr03G002052 Chr03 NC_080389.1:31102973-31102982promoter 内 187-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31099063-31099168(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr05G002130 Chr05 NC_080391.1:22405973-22405982promoter 内 178-187 bp - 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 22398914-22402159(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr05G002363 Chr05 NC_080391.1:25791879-25791888promoter 内 163-172 bp + 3829 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 25785768-25788050(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
SmilChr01G001739 Chr01 NC_080387.1:32023404-32023413promoter 内 158-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 32015658-32019570(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 GTGTCGGACG
SmilChr02G001464 Chr02 NC_080388.1:27365183-27365192promoter 内 154-163 bp + 3838 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 27360610-27361345(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 CCGCCGACAA
SmilChr04G002474 Chr04 NC_080390.1:39533724-39533733promoter 内 127-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 39537598-39538475(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr01G001710 Chr01 NC_080387.1:31571254-31571263promoter 内 123-132 bp - 3869 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 31575132-31576792(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AATCCGACAA
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SmilChr02G005532 Chr02 NC_080388.1:75373894-75373903promoter 内 35-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 75367749-75369937(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
SmilChr04G002359 Chr04 NC_080390.1:38081674-38081683promoter 内 33-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.2/ 100 1 38085642-38088567(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGATT
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SmilChr03G003434 Chr03 NC_080389.1:52696983-52696992promoter 内 2354-2363 bp - 1638 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 52698630-52700360(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 AGCCCGACAA
SmilChr03G003433 Chr03 NC_080389.1:52696983-52696992promoter 内 1496-1505 bp - 2496 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 3 52693821-52694487(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G000465 Chr03 NC_080389.1:4973697-4973706promoter 内 3844-3853 bp - 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 4970292-4973549(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr02G003452 Chr02 NC_080388.1:55806371-55806380promoter 内 3225-3234 bp - 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 55802597-55805604(-) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr03G004571 Chr03 NC_080389.1:63617433-63617442promoter 内 2999-3008 bp + 993 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 63618435-63621305(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
SmilChr04G000201 Chr04 NC_080390.1:1790573-1790582promoter 内 1903-1912 bp + 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 2 1792671-1795130(+) SMil_00002054-RA_Salv MP00021 TTGTCGGGCT
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