转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00007215-RA_Salv SmilChr01G003955 WRKY XP_057779712.1 MP00450 AGCGTTGACTTTTT

可能结合的靶基因

9901 个结合位点 8044 个候选靶基因 第 82 / 161 下载 TSV

上一页 82 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001756 Chr01 NC_080387.1:32283090-32283103promoter 内 2360-2373 bp + 1628 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 32284731-32285862(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TTATTTGACTTTTT
SmilChr01G003044 Chr01 NC_080387.1:49426914-49426927promoter 内 1979-1992 bp - 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 49421625-49424905(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGCGTTGACTTGAC
SmilChr01G006003 Chr01 NC_080387.1:75606747-75606760promoter 内 1899-1912 bp + 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 75601814-75604658(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATCAAGTCAACGCA
SmilChr05G003362 Chr05 NC_080391.1:44429284-44429297promoter 内 1514-1527 bp + 2474 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 44424122-44426810(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAAAAGTCAAACTC
SmilChr06G002444 Chr06 NC_080392.1:35163202-35163215promoter 内 1433-1446 bp - 2555 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 35165770-35179223(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAATAA
SmilChr03G002482 Chr03 NC_080389.1:39405851-39405864promoter 内 1363-1376 bp - 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 39408489-39409055(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAGTAGTCAACGAC
SmilChr05G004167 Chr05 NC_080391.1:55575143-55575156promoter 内 1191-1204 bp - 2797 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 55571328-55572346(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAATTTGACTTTTG
SmilChr05G001649 Chr05 NC_080391.1:15480529-15480542promoter 内 1172-1185 bp + 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 15483358-15488300(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGCGTTGACTACTT
SmilChr02G004758 Chr02 NC_080388.1:69776154-69776167promoter 内 1170-1183 bp - 2818 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 69760159-69773336(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TTGTTTGACTTTTT
SmilChr04G000592 Chr04 NC_080390.1:6617698-6617711promoter 内 973-986 bp + 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 6612261-6614683(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GATAAGTCAACCAG
SmilChr07G003709 Chr07 NC_080393.1:44811386-44811399promoter 内 287-300 bp - 3701 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 44815100-44816339(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AGGAAGTCAACTAA
SmilChr02G000328 Chr02 NC_080388.1:4176149-4176162promoter 内 185-198 bp + 3803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 4179965-4180783(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TACTTTGACTTTGA
SmilChr07G002405 Chr07 NC_080393.1:22404822-22404835promoter 内 135-148 bp + 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 22408688-22409723(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAGTTTGACTTTTC
SmilChr06G000980 Chr06 NC_080392.1:9566602-9566615promoter 内 113-126 bp - 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 9561641-9562727(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGAGTTGACTTCCA
SmilChr01G005857 Chr01 NC_080387.1:74510630-74510643promoter 内 82-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 74497938-74506724(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATATTTGACTTTTC
SmilChr02G004759 Chr02 NC_080388.1:69776154-69776167promoter 内 35-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 2 69780120-69781536(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAACAA
SmilChr08G000143 Chr08 NC_080394.1:921577-921590promoter 内 3966-3979 bp - 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 921612-958452(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCAAAGTCAAAGTA
SmilChr02G002180 Chr02 NC_080388.1:39017802-39017815promoter 内 3932-3945 bp + 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 39014425-39017746(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAAAAGTCAAACTC
SmilChr08G000141 Chr08 NC_080394.1:909236-909249promoter 内 3929-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 909308-917061(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCAAAGTCAAAGTA
SmilChr04G002512 Chr04 NC_080390.1:40119072-40119085promoter 内 3924-3937 bp + 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40116596-40119008(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCAAAGTCAAAGTA
SmilChr07G002530 Chr07 NC_080393.1:23971670-23971683promoter 内 3924-3937 bp - 64 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 23971747-23975987(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TAAAAGTCAAATCA
SmilChr05G003173 Chr05 NC_080391.1:40592015-40592028promoter 内 3912-3925 bp - 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 40592104-40593572(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAATTT
SmilChr06G000072 Chr06 NC_080392.1:554730-554743promoter 内 3907-3920 bp - 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 551631-554649(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GATGTTGACTTTAA
SmilChr08G000251 Chr08 NC_080394.1:1737306-1737319promoter 内 3877-3890 bp + 111 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1734226-1737195(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TCAAAGTCAAAGTA
SmilChr05G002314 Chr05 NC_080391.1:24973901-24973914promoter 内 3853-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 24974049-24975455(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ACAATGTCAACGCA
SmilChr02G000725 Chr02 NC_080388.1:11785404-11785417promoter 内 3851-3864 bp - 137 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 11784668-11785267(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GCCTTTGACTTATG
SmilChr06G001744 Chr06 NC_080392.1:20183530-20183543promoter 内 3847-3860 bp - 141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 20183684-20186825(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 GAAAAGTCAAATAT
SmilChr04G000167 Chr04 NC_080390.1:1502441-1502454promoter 内 3814-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 1501725-1502267(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAATAA
SmilChr02G005391 Chr02 NC_080388.1:74529629-74529642promoter 内 3809-3822 bp - 179 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 74529821-74531940(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAACTT
SmilChr02G005386 Chr02 NC_080388.1:74514678-74514691promoter 内 3795-3808 bp + 193 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 74512208-74514485(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAATTT
SmilChr07G002327 Chr07 NC_080393.1:21588977-21588990promoter 内 3776-3789 bp + 212 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21589202-21591767(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATGTTTGACTTTTC
SmilChr04G000386 Chr04 NC_080390.1:3917448-3917461promoter 内 3751-3764 bp - 237 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 3917698-3918165(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAAAAGTCAAATAA
SmilChr01G005865 Chr01 NC_080387.1:74594944-74594957promoter 内 3674-3687 bp - 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 74591958-74594630(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATATTTGACTTTTC
SmilChr05G001352 Chr05 NC_080391.1:12026266-12026279promoter 内 3661-3674 bp - 327 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 12024797-12025939(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATTGTTGACTTTAA
SmilChr05G000682 Chr05 NC_080391.1:5185761-5185774promoter 内 3623-3636 bp - 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 5186139-5191450(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAACTT
SmilChr04G001005 Chr04 NC_080390.1:14006514-14006527promoter 内 3591-3604 bp - 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 14006924-14011746(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATAAAGTCAACATG
SmilChr02G005089 Chr02 NC_080388.1:72491195-72491208promoter 内 3572-3585 bp - 416 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 72485185-72490779(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATAGTTGACTATTT
SmilChr04G000992 Chr04 NC_080390.1:13605216-13605229promoter 内 3537-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 13605680-13610438(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATAAAGTCAACATG
SmilChr02G004194 Chr02 NC_080388.1:64279648-64279661promoter 内 3533-3546 bp + 455 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 64280116-64286842(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATTGTTGACTTTAA
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SmilChr06G003030 Chr06 NC_080392.1:43130816-43130829promoter 内 3429-3442 bp - 559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 43131388-43132938(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAATTT
SmilChr03G001635 Chr03 NC_080389.1:21044294-21044307promoter 内 3401-3414 bp + 587 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 21042730-21043707(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 AAATAGTCAACTAT
SmilChr03G004615 Chr03 NC_080389.1:63860037-63860050promoter 内 3381-3394 bp - 607 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63860657-63864305(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CAAAAGTCAAACTT
SmilChr01G002124 Chr01 NC_080387.1:37240504-37240517promoter 内 3364-3377 bp - 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 37236574-37239880(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 TGATTTGACTTTTA
SmilChr01G004508 Chr01 NC_080387.1:63176389-63176402promoter 内 3348-3361 bp - 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 63172594-63175749(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATATTTGACTTTTC
SmilChr04G004115 Chr04 NC_080390.1:56058000-56058013promoter 内 3207-3220 bp - 781 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 56052787-56057219(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 CGCGTTGACCTATG
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SmilChr01G001572 Chr01 NC_080387.1:29764190-29764203promoter 内 3124-3137 bp + 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 29765067-29765138(+) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATATTTGACTTTTC
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SmilChr01G005860 Chr01 NC_080387.1:74527165-74527178promoter 内 3106-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.9/ 100 1 74524119-74526283(-) SMil_00007215-RA_Salv MP00450 ATATTTGACTTTTC