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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G004447; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027346-RA_Salv SmilChr02G004447 HD-ZIP XP_057797242.1 MP00200 AAAAGTAATGATTAC

可能结合的靶基因

9930 个结合位点 6661 个候选靶基因 第 9 / 134 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004126 Chr01 NC_080387.1:59755467-59755481promoter 内 2793-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 59756675-59758001(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATGAG
SmilChr02G001206 Chr02 NC_080388.1:22233192-22233206promoter 内 2619-2633 bp + 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 22234574-22237833(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAGATAATGATGAT
SmilChr03G000640 Chr03 NC_080389.1:7048821-7048835promoter 内 1906-1920 bp - 2081 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 7043582-7046740(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTGCAATGATTAC
SmilChr03G002657 Chr03 NC_080389.1:42244274-42244288promoter 内 1893-1907 bp - 2094 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 42240966-42242180(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AGCCGTAATGATGAC
SmilChr01G003802 Chr01 NC_080387.1:56409137-56409151promoter 内 1634-1648 bp + 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 56402452-56406784(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATAATT
SmilChr01G003872 Chr01 NC_080387.1:56966903-56966917promoter 内 1633-1647 bp - 2354 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 56969271-56973593(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATAATT
SmilChr01G004755 Chr01 NC_080387.1:65751135-65751149promoter 内 1443-1457 bp - 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 65753693-65755291(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTGCAAAT
SmilChr01G000818 Chr01 NC_080387.1:17682278-17682292promoter 内 1403-1417 bp - 2584 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 17673208-17679694(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATGAG
SmilChr01G004724 Chr01 NC_080387.1:65432536-65432550promoter 内 1332-1346 bp + 2655 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 65426068-65429881(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATTTTT
SmilChr01G001760 Chr01 NC_080387.1:32308392-32308406promoter 内 1130-1144 bp - 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 32311263-32317860(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGCTTC
SmilChr01G005289 Chr01 NC_080387.1:70223914-70223928promoter 内 342-356 bp + 3645 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 70227573-70228610(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGCTAATGATGAT
SmilChr02G004631 Chr02 NC_080388.1:68787347-68787361promoter 内 3897-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 68787451-68789667(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTACATTA
SmilChr01G005621 Chr01 NC_080387.1:72703230-72703244promoter 内 3467-3481 bp + 520 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 72703764-72706336(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGATAATGATTAG
SmilChr02G005470 Chr02 NC_080388.1:74971302-74971316promoter 内 3185-3199 bp - 802 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 74972118-74974885(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ACAATCATTACAATT
SmilChr01G002253 Chr01 NC_080387.1:39168421-39168435promoter 内 3173-3187 bp - 814 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 39169249-39176589(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTATAATT
SmilChr01G003381 Chr01 NC_080387.1:52507483-52507497promoter 内 3166-3180 bp + 821 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 52505069-52506662(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTATTATT
SmilChr02G000700 Chr02 NC_080388.1:11191116-11191130promoter 内 3160-3174 bp + 827 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 11191957-11196658(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTGCAATGATTAC
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SmilChr01G001994 Chr01 NC_080387.1:35342963-35342977promoter 内 2416-2430 bp - 1571 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 35339808-35341392(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAAATAATGATGAG
SmilChr02G002022 Chr02 NC_080388.1:36448486-36448500promoter 内 2271-2285 bp + 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 36450216-36450997(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGATAATGATTAG
SmilChr01G001820 Chr01 NC_080387.1:33137755-33137769promoter 内 2242-2256 bp - 1745 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 33133079-33136010(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTGCAATGATTAC
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SmilChr02G001420 Chr02 NC_080388.1:26821851-26821865promoter 内 1991-2005 bp - 1996 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26818107-26819855(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGCTAATGATGAT
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SmilChr02G005480 Chr02 NC_080388.1:75014827-75014841promoter 内 1601-1615 bp + 2386 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 75009909-75012441(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GCCATCATTACTTCA
SmilChr02G001967 Chr02 NC_080388.1:35613303-35613317promoter 内 1464-1478 bp + 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 35609110-35610780(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATCATCATTAGCTTC
SmilChr01G003640 Chr01 NC_080387.1:54903941-54903955promoter 内 1314-1328 bp - 2673 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 54897961-54901268(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGAGATAATGATGGC
SmilChr01G004253 Chr01 NC_080387.1:60820828-60820842promoter 内 1060-1074 bp + 2927 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 60823769-60824749(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GGGAGTAATGATTAT
SmilChr01G003290 Chr01 NC_080387.1:51600564-51600578promoter 内 890-904 bp + 3097 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 51603675-51604186(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGATAATGATTAG
SmilChr01G003367 Chr01 NC_080387.1:52410981-52410995promoter 内 777-791 bp + 3210 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 52403207-52407771(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTATCTTT
SmilChr02G004865 Chr02 NC_080388.1:70760503-70760517promoter 内 689-703 bp + 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 70763815-70766556(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 AAAGATAATGATTAG
SmilChr02G002229 Chr02 NC_080388.1:39645877-39645891promoter 内 619-633 bp + 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 39638466-39642509(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTATCTTT
SmilChr03G001840 Chr03 NC_080389.1:25239485-25239499promoter 内 276-290 bp + 3711 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25235280-25235774(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TTCATCATTACTATA
SmilChr02G001419 Chr02 NC_080388.1:26821851-26821865promoter 内 243-257 bp - 3744 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 26816483-26818107(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GAAGCTAATGATGAT
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SmilChr01G000984 Chr01 NC_080387.1:20853484-20853498promoter 内 150-164 bp + 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20847482-20849647(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTCATCATTATTATC
SmilChr02G002989 Chr02 NC_080388.1:50562181-50562195promoter 内 136-150 bp - 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 50553903-50558330(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATTTGCAATGATTAC
SmilChr02G000266 Chr02 NC_080388.1:3434008-3434022promoter 内 123-137 bp - 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 3437886-3447368(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTATCTTT
SmilChr03G002093 Chr03 NC_080389.1:32285907-32285921promoter 内 58-72 bp - 3929 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 32276676-32281978(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATAATAATGATGAG
SmilChr02G004609 Chr02 NC_080388.1:68593737-68593751promoter 内 287-301 bp + 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 12 68585615-68590037(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGCCCTT
SmilChr03G000754 Chr03 NC_080389.1:8625937-8625951promoter 内 3631-3645 bp + 356 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 5 8622387-8625581(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATCATCATT
SmilChr02G003071 Chr02 NC_080388.1:51568512-51568526promoter 内 1161-1175 bp - 2826 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 51561803-51565686(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GATGGTGATGATTAG
SmilChr03G003213 Chr03 NC_080389.1:49745893-49745907promoter 内 1132-1146 bp - 2855 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 3 49748762-49749301(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 ATAATCATTGCTTCC
SmilChr02G000600 Chr02 NC_080388.1:8669437-8669451promoter 内 3865-3879 bp + 122 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 8665607-8669315(-) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTCATCATTATAGTT
SmilChr01G002934 Chr01 NC_080387.1:48104413-48104427promoter 内 3830-3844 bp - 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 48104584-48106855(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 TCCATCATTACCATT
SmilChr01G002074 Chr01 NC_080387.1:36658177-36658191promoter 内 3702-3716 bp - 285 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 36658476-36659473(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 GTAATCATTGTAATT
SmilChr01G001767 Chr01 NC_080387.1:32507431-32507445promoter 内 3414-3428 bp - 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 32508018-32513077(+) SMil_00027346-RA_Salv MP00200 CTAATCATTACAATA