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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G002704; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00005062-RA_Salv SmilChr04G002704 ERF XP_057807081.1 MP00026 CACCGACCAT

可能结合的靶基因

9854 个结合位点 7408 个候选靶基因 第 9 / 149 下载 TSV

上一页 9 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003588 Chr01 NC_080387.1:54427566-54427575promoter 内 653-662 bp + 3339 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 54430914-54433917(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr02G003430 Chr02 NC_080388.1:55520788-55520797promoter 内 556-565 bp + 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 55524233-55529275(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr04G002039 Chr04 NC_080390.1:33111317-33111326promoter 内 534-543 bp - 3458 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 33105602-33107859(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr05G004136 Chr05 NC_080391.1:55347028-55347037promoter 内 512-521 bp - 3480 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 55350517-55351365(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GTGGTCGGTG
SmilChr01G003591 Chr01 NC_080387.1:54454884-54454893promoter 内 343-352 bp + 3649 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 54458542-54509308(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr01G003592 Chr01 NC_080387.1:54454884-54454893promoter 内 331-340 bp + 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 54458554-54462410(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr04G003461 Chr04 NC_080390.1:51083085-51083094promoter 内 330-339 bp - 3662 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 51086756-51093396(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GTGGTCGGTG
SmilChr05G001483 Chr05 NC_080391.1:13606332-13606341promoter 内 311-320 bp - 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 13595297-13602651(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr06G001555 Chr06 NC_080392.1:16937003-16937012promoter 内 308-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 16940696-16941259(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr04G003585 Chr04 NC_080390.1:52290023-52290032promoter 内 258-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 52285399-52286289(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GTGGTCGGTG
SmilChr02G004127 Chr02 NC_080388.1:63525118-63525127promoter 内 212-221 bp - 3780 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 63520369-63521338(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr05G004037 Chr05 NC_080391.1:54336488-54336497promoter 内 185-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 54340304-54344851(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CACCGACCAC
SmilChr02G004731 Chr02 NC_080388.1:69547850-69547859promoter 内 74-83 bp - 3918 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 69551777-69558821(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GTGGTCGGTG
SmilChr02G000437 Chr02 NC_080388.1:5705368-5705377promoter 内 70-79 bp + 3922 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 5699949-5701446(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 GTGGTCGGTG
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SmilChr02G003787 Chr02 NC_080388.1:59526164-59526173promoter 内 3735-3744 bp + 257 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 59522829-59525907(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
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SmilChr03G002398 Chr03 NC_080389.1:37990385-37990394promoter 内 2723-2732 bp + 1269 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 3 37985835-37989116(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
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SmilChr02G003788 Chr02 NC_080388.1:59526164-59526173promoter 内 3133-3142 bp + 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 59527032-59529805(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
SmilChr03G004682 Chr03 NC_080389.1:64237900-64237909promoter 内 3070-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 64238831-64239774(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
SmilChr02G004340 Chr02 NC_080388.1:65643910-65643919promoter 内 3054-3063 bp + 938 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 65644857-65647214(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
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SmilChr03G003386 Chr03 NC_080389.1:52225214-52225223promoter 内 2583-2592 bp - 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 52222220-52223805(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
SmilChr04G003675 Chr04 NC_080390.1:53209218-53209227promoter 内 2394-2403 bp - 1598 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 53210825-53212810(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr04G000640 Chr04 NC_080390.1:7271325-7271334promoter 内 2304-2313 bp - 1688 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 7273022-7275924(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr03G003336 Chr03 NC_080389.1:51628990-51628999promoter 内 2138-2147 bp + 1854 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 51624445-51627136(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr04G000833 Chr04 NC_080390.1:10471254-10471263promoter 内 1426-1435 bp - 2566 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 10473829-10475535(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr01G004529 Chr01 NC_080387.1:63479216-63479225promoter 内 1258-1267 bp + 2734 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 63481959-63483387(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
SmilChr03G001880 Chr03 NC_080389.1:26107349-26107358promoter 内 767-776 bp - 3225 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 2 26110583-26113565(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr03G001033 Chr03 NC_080389.1:12030942-12030951promoter 内 3388-3397 bp - 604 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 12031555-12031661(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr04G000221 Chr04 NC_080390.1:1949409-1949418promoter 内 3252-3261 bp - 740 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 1947142-1948669(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
SmilChr02G000684 Chr02 NC_080388.1:10812307-10812316promoter 内 3130-3139 bp + 862 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 10813178-10815951(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
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SmilChr05G002384 Chr05 NC_080391.1:26283273-26283282promoter 内 2838-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 26284436-26299761(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
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SmilChr04G003496 Chr04 NC_080390.1:51388642-51388651promoter 内 2532-2541 bp + 1460 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 51385150-51387182(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr02G003634 Chr02 NC_080388.1:57686799-57686808promoter 内 2477-2486 bp + 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 57677485-57685284(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr02G000486 Chr02 NC_080388.1:6628377-6628386promoter 内 2410-2419 bp - 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 6629968-6632943(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr02G002176 Chr02 NC_080388.1:38985947-38985956promoter 内 2230-2239 bp + 1762 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 38980129-38984185(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr06G001680 Chr06 NC_080392.1:19066293-19066302promoter 内 2177-2186 bp + 1815 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 19068117-19073100(+) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT
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SmilChr03G003487 Chr03 NC_080389.1:53449493-53449502promoter 内 1887-1896 bp + 2105 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 53445101-53447388(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 ATGGTCGGCG
SmilChr04G000856 Chr04 NC_080390.1:10872196-10872205promoter 内 1793-1802 bp - 2199 bp 位于靶基因 TSS 上游 98.8/ 100 1 10869096-10869997(-) SMil_00005062-RA_Salv MP00026 CGCCGACCAT