转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr03G001252; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00025976-RA_Salv SmilChr03G001252 bZIP XP_057802461.1 MP00291 AATGGTCACGTGGCA

可能结合的靶基因

9321 个结合位点 6894 个候选靶基因 第 90 / 138 下载 TSV

上一页 90 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G001999 Chr01 NC_080387.1:35495483-35495497promoter 内 452-466 bp - 3535 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 35499032-35502377(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGTGCC
SmilChr07G001140 Chr07 NC_080393.1:8563220-8563234promoter 内 436-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 8556802-8559669(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GTGACCTACGTGGCA
SmilChr04G000294 Chr04 NC_080390.1:2750624-2750638promoter 内 337-351 bp - 3650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 2738606-2746974(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATCCACACGTGGCC
SmilChr04G001499 Chr04 NC_080390.1:24584579-24584593promoter 内 219-233 bp - 3768 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 24579096-24580811(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGATTCTACGTGGCA
SmilChr03G001106 Chr03 NC_080389.1:12744631-12744645promoter 内 172-186 bp - 3815 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 12748460-12752581(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGAAACT
SmilChr02G003770 Chr02 NC_080388.1:59389234-59389248promoter 内 125-139 bp + 3862 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59393110-59398775(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGTGTCCACGTGGAG
SmilChr01G001857 Chr01 NC_080387.1:33518311-33518325promoter 内 97-111 bp - 3890 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 33522215-33522682(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGTGCC
SmilChr02G000071 Chr02 NC_080388.1:903773-903787promoter 内 92-106 bp - 3895 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 897628-899878(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCGGTCACGTGGAC
SmilChr01G001899 Chr01 NC_080387.1:34090464-34090478promoter 内 91-105 bp - 3896 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34094374-34094841(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTAGGTGCC
SmilChr02G001542 Chr02 NC_080388.1:28673015-28673029promoter 内 89-103 bp - 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28676927-28682190(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTGTTCAAA
SmilChr01G004681 Chr01 NC_080387.1:64883195-64883209promoter 内 34-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 64887162-64888454(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGACATG
SmilChr01G002133 Chr01 NC_080387.1:37324411-37324425promoter 内 1144-1158 bp - 2843 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 3 37316020-37321568(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTATCATACGTGGCA
SmilChr05G002839 Chr05 NC_080391.1:33722137-33722151promoter 内 3799-3813 bp - 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 33722339-33727669(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTCAATTTA
SmilChr02G005241 Chr02 NC_080388.1:73581125-73581139promoter 内 3727-3741 bp + 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 73577522-73580865(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGATAA
SmilChr07G001638 Chr07 NC_080393.1:13816456-13816470promoter 内 2893-2907 bp - 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 13817564-13822250(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGACAT
SmilChr04G001798 Chr04 NC_080390.1:29454005-29454019promoter 内 2882-2896 bp - 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 29455124-29456928(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTATG
SmilChr07G001657 Chr07 NC_080393.1:14015883-14015897promoter 内 2863-2877 bp - 1124 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 14017021-14021701(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGACAT
SmilChr03G003647 Chr03 NC_080389.1:55238939-55238953promoter 内 2698-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 55240242-55241327(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATAGCCACGTGGAA
SmilChr01G004985 Chr01 NC_080387.1:67905421-67905435promoter 内 1832-1846 bp + 2155 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 67897017-67903266(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TGCCACGTATGATAA
SmilChr02G003185 Chr02 NC_080388.1:52996346-52996360promoter 内 1555-1569 bp - 2432 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 52998792-53001288(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTATG
SmilChr03G003648 Chr03 NC_080389.1:55238939-55238953promoter 内 1445-1459 bp + 2542 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 55241495-55244036(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATAGCCACGTGGAA
SmilChr08G002720 Chr08 NC_080394.1:26828311-26828325promoter 内 963-977 bp - 3024 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 26831349-26834139(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTTCT
SmilChr02G001420 Chr02 NC_080388.1:26822949-26822963promoter 内 893-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 26818107-26819855(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATCGATGACGTGGCT
SmilChr08G004083 Chr08 NC_080394.1:49457439-49457453promoter 内 672-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 49452628-49454124(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TTCCACGTGGCTTCT
SmilChr07G001637 Chr07 NC_080393.1:13816456-13816470promoter 内 662-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 13809105-13813131(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATGTCCTACGTGGCG
SmilChr01G001976 Chr01 NC_080387.1:35170866-35170880promoter 内 590-604 bp + 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 35163307-35167469(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGATAA
SmilChr07G001656 Chr07 NC_080393.1:14015883-14015897promoter 内 564-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 14008595-14012460(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATGTCCTACGTGGCG
SmilChr02G003659 Chr02 NC_080388.1:57961379-57961393promoter 内 340-354 bp + 3647 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 57965040-57967019(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CATAGCCACGTGGAA
SmilChr02G001422 Chr02 NC_080388.1:26822949-26822963promoter 内 297-311 bp - 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 2 26826653-26827854(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCATCGAT
SmilChr06G001049 Chr06 NC_080392.1:10351805-10351819promoter 内 3954-3968 bp - 33 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 10351852-10353464(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTATAAT
SmilChr01G004860 Chr01 NC_080387.1:66750735-66750749promoter 内 3952-3966 bp - 35 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 66750784-66757976(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAACTAAC
SmilChr07G002432 Chr07 NC_080393.1:22639423-22639437promoter 内 3939-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 22633205-22639375(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTGTATCTC
SmilChr08G002168 Chr08 NC_080394.1:19620625-19620639promoter 内 3936-3950 bp + 51 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 19620690-19622465(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GAATTACACGTGGCC
SmilChr07G001369 Chr07 NC_080393.1:10626904-10626918promoter 内 3930-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 10626975-10629682(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCAGAGAT
SmilChr07G001356 Chr07 NC_080393.1:10520038-10520052promoter 内 3928-3942 bp - 59 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 10520111-10523911(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCAGAGAT
SmilChr03G003753 Chr03 NC_080389.1:56623007-56623021promoter 内 3906-3920 bp + 81 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56621086-56622926(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTGTCGGCT
SmilChr04G001971 Chr04 NC_080390.1:31928000-31928014promoter 内 3834-3848 bp + 153 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 31925539-31927847(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCATCTAG
SmilChr04G003401 Chr04 NC_080390.1:50567628-50567642promoter 内 3760-3774 bp + 227 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 50567869-50569304(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TAGATAGACGTGGCA
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SmilChr07G003842 Chr07 NC_080393.1:47618252-47618266promoter 内 3701-3715 bp - 286 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 47617115-47617966(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 ATCGATGACGTGGCT
SmilChr04G003266 Chr04 NC_080390.1:49379129-49379143promoter 内 3655-3669 bp - 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 49377857-49378797(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 TACACCGACGTGGCC
SmilChr05G003390 Chr05 NC_080391.1:44928073-44928087promoter 内 3608-3622 bp + 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 44926187-44927694(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 GGCCACGTCTTCTGA
SmilChr08G002033 Chr08 NC_080394.1:18116669-18116683promoter 内 3604-3618 bp - 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 18114874-18116286(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CTCAACCACGTGGCG
SmilChr02G001289 Chr02 NC_080388.1:23720762-23720776promoter 内 3563-3577 bp - 424 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 23721200-23724166(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGATCG
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SmilChr07G000822 Chr07 NC_080393.1:5797511-5797525promoter 内 3352-3366 bp + 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5795254-5796876(-) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 AGCCACGTCATCTAG
SmilChr04G002197 Chr04 NC_080390.1:35543141-35543155promoter 内 3330-3344 bp - 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 35543812-35545724(+) SMil_00025976-RA_Salv MP00291 CGCCACGTAGGACAT
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