转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 92 / 149 下载 TSV

上一页 92 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003040 Chr02 NC_080388.1:51142912-51142922promoter 内 540-550 bp + 3451 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 2 51146373-51148060(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAG
SmilChr02G000908 Chr02 NC_080388.1:15712811-15712821promoter 内 3878-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 15708843-15712698(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAT
SmilChr05G001398 Chr05 NC_080391.1:12569258-12569268promoter 内 3874-3884 bp - 117 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 12569385-12576372(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTG
SmilChr02G004863 Chr02 NC_080388.1:70757114-70757124promoter 内 3794-3804 bp + 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 70757321-70760043(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAT
SmilChr04G001324 Chr04 NC_080390.1:21332852-21332862promoter 内 3479-3489 bp - 512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 21333374-21334620(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTG
SmilChr04G001304 Chr04 NC_080390.1:20753496-20753506promoter 内 3370-3380 bp - 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 20754127-20755558(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTG
SmilChr01G001214 Chr01 NC_080387.1:24373685-24373695promoter 内 3238-3248 bp - 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 24368871-24372932(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAT
SmilChr02G004607 Chr02 NC_080388.1:68568877-68568887promoter 内 3218-3228 bp + 773 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 68569660-68579495(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCT
SmilChr06G002722 Chr06 NC_080392.1:39329660-39329670promoter 内 3187-3197 bp + 804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 39330474-39332010(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCC
SmilChr03G001856 Chr03 NC_080389.1:25588108-25588118promoter 内 3165-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 25588944-25589594(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAG
SmilChr05G002162 Chr05 NC_080391.1:22857435-22857445promoter 内 3127-3137 bp + 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 22858309-22858744(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCT
SmilChr05G002256 Chr05 NC_080391.1:24269769-24269779promoter 内 3123-3133 bp - 868 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 24270647-24276749(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTG
SmilChr02G002666 Chr02 NC_080388.1:46155585-46155595promoter 内 3051-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 46156535-46157296(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCC
SmilChr03G002842 Chr03 NC_080389.1:44966608-44966618promoter 内 3043-3053 bp + 948 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 44963780-44965660(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGA
SmilChr02G000593 Chr02 NC_080388.1:8492460-8492470promoter 内 2983-2993 bp - 1008 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 8493478-8565262(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGT
SmilChr01G005622 Chr01 NC_080387.1:72713481-72713491promoter 内 2740-2750 bp + 1251 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 72708889-72712230(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTC
SmilChr01G000939 Chr01 NC_080387.1:19890532-19890542promoter 内 2697-2707 bp + 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 19891836-19895713(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAT
SmilChr06G001885 Chr06 NC_080392.1:22512198-22512208promoter 内 2692-2702 bp - 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 22513507-22515887(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTC
SmilChr04G004173 Chr04 NC_080390.1:56359336-56359346promoter 内 2681-2691 bp + 1310 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 56354676-56358026(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGT
SmilChr06G001814 Chr06 NC_080392.1:21306732-21306742promoter 内 2454-2464 bp + 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 21308279-21310455(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAG
SmilChr02G004211 Chr02 NC_080388.1:64372924-64372934promoter 内 2435-2445 bp + 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 64374490-64376363(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAG
SmilChr05G002151 Chr05 NC_080391.1:22733048-22733058promoter 内 2431-2441 bp - 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 22734618-22737271(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGG
SmilChr03G000203 Chr03 NC_080389.1:2296662-2296672promoter 内 2324-2334 bp + 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2298339-2302432(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAG
SmilChr02G001014 Chr02 NC_080388.1:17884934-17884944promoter 内 1942-1952 bp + 2049 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 17886993-17888133(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCC
SmilChr03G002223 Chr03 NC_080389.1:35048409-35048419promoter 内 1930-1940 bp + 2061 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 35042421-35046348(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTG
SmilChr02G003905 Chr02 NC_080388.1:61128560-61128570promoter 内 1929-1939 bp - 2062 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 61122350-61126498(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAT
SmilChr01G000791 Chr01 NC_080387.1:17212727-17212737promoter 内 1901-1911 bp - 2090 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 17205651-17210637(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCCAGCTGGAT
SmilChr02G001290 Chr02 NC_080388.1:23728206-23728216promoter 内 1722-1732 bp - 2269 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 23724213-23725937(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCC
SmilChr04G002290 Chr04 NC_080390.1:37187800-37187810promoter 内 1694-1704 bp - 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 37184289-37185503(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCC
SmilChr01G002542 Chr01 NC_080387.1:43470238-43470248promoter 内 1665-1675 bp - 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 43472574-43473839(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGG
SmilChr04G004034 Chr04 NC_080390.1:55583761-55583771promoter 内 1636-1646 bp - 2355 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 55586126-55590610(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGT
SmilChr04G001227 Chr04 NC_080390.1:19228522-19228532promoter 内 1581-1591 bp + 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 19223497-19226112(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTCTC
SmilChr06G002974 Chr06 NC_080392.1:42575328-42575338promoter 内 1550-1560 bp - 2441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 42577779-42580354(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTG
SmilChr05G001237 Chr05 NC_080391.1:10477353-10477363promoter 内 1462-1472 bp - 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 10479892-10482261(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGA
SmilChr01G003357 Chr01 NC_080387.1:52322876-52322886promoter 内 938-948 bp + 3053 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 52318677-52319823(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTTTG
SmilChr05G000421 Chr05 NC_080391.1:3193172-3193182promoter 内 881-891 bp - 3110 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3189057-3190062(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCGAGCTGTCT
SmilChr04G003449 Chr04 NC_080390.1:50990434-50990444promoter 内 799-809 bp - 3192 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 50993636-50994322(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGG
SmilChr02G003530 Chr02 NC_080388.1:56448949-56448959promoter 内 792-802 bp - 3199 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 56452158-56455371(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGG
SmilChr02G002097 Chr02 NC_080388.1:37657320-37657330promoter 内 779-789 bp + 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 37652262-37654108(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGA
SmilChr02G003584 Chr02 NC_080388.1:57002047-57002057promoter 内 767-777 bp - 3224 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 57005281-57007063(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGG
SmilChr07G001006 Chr07 NC_080393.1:7324266-7324276promoter 内 709-719 bp - 3282 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 7327558-7329957(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGA
SmilChr03G001902 Chr03 NC_080389.1:26577013-26577023promoter 内 584-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 26580430-26585758(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCC
SmilChr05G004004 Chr05 NC_080391.1:53948565-53948575promoter 内 539-549 bp + 3452 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 53952027-53953751(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCC
SmilChr01G000218 Chr01 NC_080387.1:3791020-3791030promoter 内 510-520 bp + 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 3794511-3799399(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAGAGCTGTCC
SmilChr03G000217 Chr03 NC_080389.1:2514980-2514990promoter 内 388-398 bp + 3603 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 2518593-2525041(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CAAAGCTGTCC
SmilChr07G003076 Chr07 NC_080393.1:32393545-32393555promoter 内 348-358 bp - 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 32397198-32399342(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTCGA
SmilChr05G003219 Chr05 NC_080391.1:41310330-41310340promoter 内 338-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 41313993-41315268(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGG
SmilChr01G003174 Chr01 NC_080387.1:50541977-50541987promoter 内 215-225 bp + 3776 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 50545763-50553870(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGTAG
SmilChr04G003469 Chr04 NC_080390.1:51167090-51167100promoter 内 213-223 bp - 3778 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 51170878-51171796(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGG
SmilChr05G000692 Chr05 NC_080391.1:5232441-5232451promoter 内 138-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.7/ 100 1 5236304-5239026(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGGT