转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 93 / 143 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001358 Chr03 NC_080389.1:15954611-15954622promoter 内 2329-2340 bp - 1661 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 15956283-15958980(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAT
SmilChr07G001156 Chr07 NC_080393.1:8666953-8666964promoter 内 1961-1972 bp - 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 8654472-8664924(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTT
SmilChr01G001561 Chr01 NC_080387.1:29624715-29624726promoter 内 1707-1718 bp - 2283 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 29627009-29628114(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr04G001515 Chr04 NC_080390.1:24955001-24955012promoter 内 1688-1699 bp - 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 24957314-24961441(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr03G004078 Chr03 NC_080389.1:59715488-59715499promoter 内 1509-1520 bp + 2481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 59712399-59713007(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTA
SmilChr02G000935 Chr02 NC_080388.1:16330195-16330206promoter 内 1446-1457 bp - 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 16332750-16336805(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATT
SmilChr02G000050 Chr02 NC_080388.1:665967-665978promoter 内 1394-1405 bp - 2596 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 668574-669670(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAT
SmilChr06G001289 Chr06 NC_080392.1:13462056-13462067promoter 内 1255-1266 bp - 2735 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 13464802-13467894(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTAT
SmilChr02G000175 Chr02 NC_080388.1:2222125-2222136promoter 内 1097-1108 bp + 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 2225029-2226402(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGTT
SmilChr02G001673 Chr02 NC_080388.1:30984672-30984683promoter 内 693-704 bp + 3297 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 30987980-30989248(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCA
SmilChr08G002966 Chr08 NC_080394.1:29685626-29685637promoter 内 499-510 bp - 3491 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 29677410-29682135(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr05G003364 Chr05 NC_080391.1:44485297-44485308promoter 内 465-476 bp + 3525 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 44481446-44481772(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACACCTGTCAA
SmilChr08G001780 Chr08 NC_080394.1:15004747-15004758promoter 内 309-320 bp + 3681 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 15008439-15010005(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr03G000326 Chr03 NC_080389.1:3723992-3724003promoter 内 213-224 bp - 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 3727780-3730025(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr08G002289 Chr08 NC_080394.1:21337331-21337342promoter 内 86-97 bp - 3904 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 21341246-21342261(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTATT
SmilChr03G003191 Chr03 NC_080389.1:49365786-49365797promoter 内 50-61 bp - 3940 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 49369737-49373510(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTACA
SmilChr02G005092 Chr02 NC_080388.1:72512892-72512903promoter 内 33-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 2 72507868-72508935(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATACCAGCTGTT
SmilChr05G000241 Chr05 NC_080391.1:1845130-1845141promoter 内 3887-3898 bp + 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1845244-1848441(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr02G000985 Chr02 NC_080388.1:17339217-17339228promoter 内 3886-3897 bp - 104 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 17339332-17339801(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCTG
SmilChr07G002727 Chr07 NC_080393.1:26733314-26733325promoter 内 3869-3880 bp + 121 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 26733446-26736267(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr02G001078 Chr02 NC_080388.1:19323825-19323836promoter 内 3790-3801 bp + 200 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 19324036-19325001(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAGG
SmilChr02G004929 Chr02 NC_080388.1:71296021-71296032promoter 内 3779-3790 bp + 211 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 71296243-71300602(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr01G000270 Chr01 NC_080387.1:5329399-5329410promoter 内 3679-3690 bp + 311 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 5329721-5330807(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr03G001743 Chr03 NC_080389.1:23517609-23517620promoter 内 3658-3669 bp + 332 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 23515333-23517277(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr04G002192 Chr04 NC_080390.1:35458623-35458634promoter 内 3640-3651 bp + 350 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 35458984-35459621(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGGG
SmilChr05G004099 Chr05 NC_080391.1:54846897-54846908promoter 内 3562-3573 bp + 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54847336-54849783(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAG
SmilChr01G002415 Chr01 NC_080387.1:41532345-41532356promoter 内 3540-3551 bp - 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 41532806-41533526(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr06G001719 Chr06 NC_080392.1:19814615-19814626promoter 内 3538-3549 bp - 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 19805275-19814163(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr02G005444 Chr02 NC_080388.1:74817430-74817441promoter 内 3509-3520 bp - 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 74817922-74820746(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCAT
SmilChr08G000592 Chr08 NC_080394.1:4409454-4409465promoter 内 3454-3465 bp + 536 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4410001-4410837(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTCAA
SmilChr04G003358 Chr04 NC_080390.1:50183174-50183185promoter 内 3445-3456 bp - 545 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 50183730-50186953(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCGG
SmilChr04G001176 Chr04 NC_080390.1:17736574-17736585promoter 内 3340-3351 bp - 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 17733441-17735924(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAGG
SmilChr03G002827 Chr03 NC_080389.1:44759613-44759624promoter 内 3313-3324 bp - 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 44751241-44758936(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTACAGCTGAT
SmilChr03G003653 Chr03 NC_080389.1:55326940-55326951promoter 内 3245-3256 bp + 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 55315756-55326195(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTA
SmilChr03G003799 Chr03 NC_080389.1:57061695-57061706promoter 内 3239-3250 bp - 751 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 57060139-57060944(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTGCA
SmilChr05G001122 Chr05 NC_080391.1:9356213-9356224promoter 内 3223-3234 bp + 767 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9356991-9359244(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTGAC
SmilChr03G000856 Chr03 NC_080389.1:9789954-9789965promoter 内 3210-3221 bp + 780 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9788275-9789174(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr08G000591 Chr08 NC_080394.1:4409454-4409465promoter 内 3143-3154 bp + 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 4407318-4408607(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC
SmilChr05G004278 Chr05 NC_080391.1:56571972-56571983promoter 内 3139-3150 bp - 851 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56572834-56575389(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGT
SmilChr03G004642 Chr03 NC_080389.1:64006504-64006515promoter 内 3120-3131 bp + 870 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 64002956-64005634(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAACTGTCAA
SmilChr01G001856 Chr01 NC_080387.1:33513600-33513611promoter 内 3111-3122 bp + 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 33511321-33512721(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCAC
SmilChr07G004357 Chr07 NC_080393.1:56136652-56136663promoter 内 3016-3027 bp - 974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 56134223-56135678(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATT
SmilChr01G003261 Chr01 NC_080387.1:51309591-51309602promoter 内 2966-2977 bp - 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 51310626-51319042(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTAGT
SmilChr03G000941 Chr03 NC_080389.1:10694860-10694871promoter 内 2933-2944 bp - 1057 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 10695928-10697625(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCTT
SmilChr05G001234 Chr05 NC_080391.1:10460780-10460791promoter 内 2922-2933 bp - 1068 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 10461859-10464092(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCTG
SmilChr02G005537 Chr02 NC_080388.1:75409272-75409283promoter 内 2909-2920 bp + 1081 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 75404654-75408191(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCTG
SmilChr01G000335 Chr01 NC_080387.1:6829275-6829286promoter 内 2902-2913 bp - 1088 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 6830374-6831466(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCTG
SmilChr08G003105 Chr08 NC_080394.1:31301056-31301067promoter 内 2842-2853 bp - 1148 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 31297168-31299908(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTATT
SmilChr03G004011 Chr03 NC_080389.1:59100128-59100139promoter 内 2812-2823 bp - 1178 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 59101317-59104691(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCGA
SmilChr01G000352 Chr01 NC_080387.1:7327653-7327664promoter 内 2796-2807 bp + 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7325434-7326459(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCC