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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 93 / 151 下载 TSV

上一页 93 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G003643 Chr01 NC_080387.1:54922273-54922285promoter 内 2844-2856 bp + 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54923430-54924421(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTTTT
SmilChr05G000905 Chr05 NC_080391.1:7166338-7166350promoter 内 2813-2825 bp + 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7167526-7169075(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCCAG
SmilChr01G005964 Chr01 NC_080387.1:75366583-75366595promoter 内 2798-2810 bp + 1191 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 75363350-75365392(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGTTGGA
SmilChr05G001481 Chr05 NC_080391.1:13588923-13588935promoter 内 2797-2809 bp + 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 13586828-13587731(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATTTAGGTAAG
SmilChr04G003863 Chr04 NC_080390.1:54557262-54557274promoter 内 2778-2790 bp - 1211 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 54558485-54562023(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGTTAGGTAAT
SmilChr04G003374 Chr04 NC_080390.1:50315750-50315762promoter 内 2690-2702 bp + 1299 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 50299243-50314451(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAGTAGGTATA
SmilChr03G000865 Chr03 NC_080389.1:9848288-9848300promoter 内 2677-2689 bp - 1312 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9849612-9855030(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGTTAGGTAAT
SmilChr05G000968 Chr05 NC_080391.1:7810922-7810934promoter 内 2625-2637 bp + 1364 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7812298-7813413(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCAACCTACCCAG
SmilChr05G000071 Chr05 NC_080391.1:358932-358944promoter 内 2604-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 356429-357547(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
SmilChr03G004719 Chr03 NC_080389.1:64421789-64421801promoter 内 2506-2518 bp - 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 64417066-64420306(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACATAA
SmilChr04G003375 Chr04 NC_080390.1:50315750-50315762promoter 内 2488-2500 bp + 1501 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 50313671-50314249(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAGTAGGTATA
SmilChr02G000515 Chr02 NC_080388.1:7116136-7116148promoter 内 2444-2456 bp - 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7117693-7119003(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCTGGTAGGTTAC
SmilChr02G002724 Chr02 NC_080388.1:47135483-47135495promoter 内 2435-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 47137049-47139241(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTTCT
SmilChr02G002840 Chr02 NC_080388.1:48522607-48522619promoter 内 2407-2419 bp - 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 48515692-48521025(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTTTT
SmilChr02G001898 Chr02 NC_080388.1:34276920-34276932promoter 内 2326-2338 bp - 1663 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 34271505-34275257(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTACCTAATATT
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SmilChr05G001186 Chr05 NC_080391.1:9957485-9957497promoter 内 2289-2301 bp + 1700 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 9959197-9959920(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
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SmilChr04G001173 Chr04 NC_080390.1:17558513-17558525promoter 内 2060-2072 bp + 1929 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 17545287-17556584(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTTTAGGTAAA
SmilChr01G001258 Chr01 NC_080387.1:25281261-25281273promoter 内 2053-2065 bp + 1936 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 25265830-25279325(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTATA
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SmilChr01G004254 Chr01 NC_080387.1:60825407-60825419promoter 内 1970-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 60827438-60828265(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTTTT
SmilChr01G004871 Chr01 NC_080387.1:66833086-66833098promoter 内 1929-1941 bp + 2060 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 66828607-66831026(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATATTAGGTAAT
SmilChr04G001174 Chr04 NC_080390.1:17558513-17558525promoter 内 1904-1916 bp + 2085 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 17560610-17564629(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
SmilChr03G002031 Chr03 NC_080389.1:30456528-30456540promoter 内 1902-1914 bp - 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 30450371-30454441(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
SmilChr02G000516 Chr02 NC_080388.1:7124865-7124877promoter 内 1872-1884 bp - 2117 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 7120527-7122748(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTTTT
SmilChr05G000137 Chr05 NC_080391.1:1106402-1106414promoter 内 1830-1842 bp + 2159 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 1099003-1104243(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTGTTAGGTAAT
SmilChr02G005047 Chr02 NC_080388.1:72212203-72212215promoter 内 1828-1840 bp + 2161 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72214376-72218282(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
SmilChr02G005045 Chr02 NC_080388.1:72190136-72190148promoter 内 1827-1839 bp + 2162 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72192310-72196215(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
SmilChr02G002694 Chr02 NC_080388.1:46671387-46671399promoter 内 1795-1807 bp + 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 46673593-46680047(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTCTC
SmilChr01G003518 Chr01 NC_080387.1:53817170-53817182promoter 内 1743-1755 bp + 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 53807204-53814924(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTATA
SmilChr01G003460 Chr01 NC_080387.1:53181304-53181316promoter 内 1717-1729 bp + 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 53171301-53179032(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTATA
SmilChr04G001696 Chr04 NC_080390.1:28071517-28071529promoter 内 1709-1721 bp - 2280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 28066110-28069237(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAACT
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SmilChr03G001646 Chr03 NC_080389.1:21290129-21290141promoter 内 1671-1683 bp + 2318 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 21292459-21296212(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
SmilChr02G005053 Chr02 NC_080388.1:72237091-72237103promoter 内 1605-1617 bp + 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 72239487-72242550(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATACCTACTCTC
SmilChr05G001875 Chr05 NC_080391.1:18990876-18990888promoter 内 1563-1575 bp - 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 18993314-18994195(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTATA
SmilChr04G001806 Chr04 NC_080390.1:29552115-29552127promoter 内 1551-1563 bp - 2438 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 29545853-29549677(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
SmilChr05G000770 Chr05 NC_080391.1:6002419-6002431promoter 内 1522-1534 bp - 2467 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 6004898-6005865(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATATTAGGTAAT
SmilChr03G004136 Chr03 NC_080389.1:60217057-60217069promoter 内 1490-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 60211197-60214558(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAAAATT
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SmilChr03G000588 Chr03 NC_080389.1:6540519-6540531promoter 内 1466-1478 bp - 2523 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 6535229-6537996(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTCCCTCT
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SmilChr01G001760 Chr01 NC_080387.1:32308465-32308477promoter 内 1203-1215 bp - 2786 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 32311263-32317860(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAATTTAGGTAAG
SmilChr02G004161 Chr02 NC_080388.1:63932757-63932769promoter 内 1193-1205 bp - 2796 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 63935565-63940700(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTTTTAGGTAAG
SmilChr03G002555 Chr03 NC_080389.1:40724037-40724049promoter 内 1187-1199 bp - 2802 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.8/ 100 1 40726851-40729666(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTTTTAGGTAAA