转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 94 / 136 下载 TSV

上一页 94 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G001003 Chr04 NC_080390.1:13913060-13913070promoter 内 3917-3927 bp + 74 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 13913144-13913735(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr04G001992 Chr04 NC_080390.1:32234289-32234299promoter 内 3810-3820 bp + 181 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 32232606-32234108(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr05G001369 Chr05 NC_080391.1:12179915-12179925promoter 内 3806-3816 bp - 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12180110-12181151(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr02G002659 Chr02 NC_080388.1:46020277-46020287promoter 内 3803-3813 bp + 188 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 46018745-46020089(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr02G002746 Chr02 NC_080388.1:47444635-47444645promoter 内 3694-3704 bp + 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 47442827-47444338(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr04G004180 Chr04 NC_080390.1:56385519-56385529promoter 内 3544-3554 bp + 447 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56383202-56385072(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCTGAGCC
SmilChr03G000495 Chr03 NC_080389.1:5309807-5309817promoter 内 3480-3490 bp + 511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5308165-5309296(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr04G001993 Chr04 NC_080390.1:32234289-32234299promoter 内 3460-3470 bp + 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 32234830-32236495(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr01G002459 Chr01 NC_080387.1:42230100-42230110promoter 内 3442-3452 bp + 549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42230659-42233117(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr06G002076 Chr06 NC_080392.1:27384651-27384661promoter 内 3418-3428 bp - 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 27385234-27385803(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr01G003119 Chr01 NC_080387.1:50004836-50004846promoter 内 3366-3376 bp - 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 50002361-50004211(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr07G003612 Chr07 NC_080393.1:42423579-42423589promoter 内 3366-3376 bp + 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42424214-42425078(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr03G000759 Chr03 NC_080389.1:8650438-8650448promoter 内 3354-3364 bp + 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8651085-8654584(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr05G000662 Chr05 NC_080391.1:5011600-5011610promoter 内 3345-3355 bp - 646 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5009800-5010954(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCTCAGCGTG
SmilChr07G004167 Chr07 NC_080393.1:53577829-53577839promoter 内 3259-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53575057-53577097(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTA
SmilChr01G002624 Chr01 NC_080387.1:44511937-44511947promoter 内 3199-3209 bp + 792 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44508084-44511145(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCTGAGCC
SmilChr02G002279 Chr02 NC_080388.1:40282010-40282020promoter 内 3150-3160 bp - 841 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40280312-40281169(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACC
SmilChr04G001139 Chr04 NC_080390.1:16803065-16803075promoter 内 3097-3107 bp - 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16803969-16804074(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr05G004253 Chr05 NC_080391.1:56322493-56322503promoter 内 3081-3091 bp + 910 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56323413-56326490(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr08G004660 Chr08 NC_080394.1:56085141-56085151promoter 内 3050-3060 bp - 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56082836-56084200(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGGT
SmilChr02G002556 Chr02 NC_080388.1:44467051-44467061promoter 内 3034-3044 bp + 957 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 44464058-44466094(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTA
SmilChr02G004886 Chr02 NC_080388.1:70945573-70945583promoter 内 2990-3000 bp + 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 70938481-70944572(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr05G000970 Chr05 NC_080391.1:7831854-7831864promoter 内 2860-2870 bp - 1131 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 7827197-7830723(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGTC
SmilChr08G001639 Chr08 NC_080394.1:13598175-13598185promoter 内 2853-2863 bp + 1138 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 13595164-13597037(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr02G003621 Chr02 NC_080388.1:57522242-57522252promoter 内 2713-2723 bp - 1278 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 57523530-57524994(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr05G002044 Chr05 NC_080391.1:21280784-21280794promoter 内 2699-2709 bp + 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 21275849-21279492(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr06G000746 Chr06 NC_080392.1:6945217-6945227promoter 内 2689-2699 bp + 1302 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 6943551-6943915(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr03G001358 Chr03 NC_080389.1:15954953-15954963promoter 内 2671-2681 bp - 1320 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15956283-15958980(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr04G002917 Chr04 NC_080390.1:45366918-45366928promoter 内 2606-2616 bp + 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 45368313-45368873(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr05G002296 Chr05 NC_080391.1:24790970-24790980promoter 内 2585-2595 bp + 1406 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 24788599-24789564(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr01G000258 Chr01 NC_080387.1:4960577-4960587promoter 内 2582-2592 bp + 1409 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4955894-4959168(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTA
SmilChr03G001885 Chr03 NC_080389.1:26256871-26256881promoter 内 2484-2494 bp - 1507 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26247151-26255364(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGTC
SmilChr05G003153 Chr05 NC_080391.1:40276857-40276867promoter 内 2476-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40272717-40275342(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCTCAGCGCA
SmilChr01G004754 Chr01 NC_080387.1:65742276-65742286promoter 内 2440-2450 bp + 1551 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 65743837-65744217(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr08G001918 Chr08 NC_080394.1:16713535-16713545promoter 内 2439-2449 bp - 1552 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 16705200-16711983(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGTC
SmilChr05G002865 Chr05 NC_080391.1:34243729-34243739promoter 内 2403-2413 bp - 1588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 34245327-34247102(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACGCTGAGAC
SmilChr01G005101 Chr01 NC_080387.1:68811945-68811955promoter 内 2344-2354 bp - 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 68813602-68815717(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCA
SmilChr01G005100 Chr01 NC_080387.1:68811945-68811955promoter 内 2266-2276 bp - 1725 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 68808004-68810220(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr02G003907 Chr02 NC_080388.1:61125307-61125317promoter 内 2188-2198 bp + 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61127120-61129344(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCACC
SmilChr07G000037 Chr07 NC_080393.1:167417-167427promoter 内 2147-2157 bp + 1844 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 162832-165573(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGTGCTGAGCA
SmilChr08G004164 Chr08 NC_080394.1:50946950-50946960promoter 内 2146-2156 bp + 1845 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 50938505-50945105(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr07G003613 Chr07 NC_080393.1:42423579-42423589promoter 内 2144-2154 bp + 1847 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 42425436-42426618(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGAGGC
SmilChr08G002749 Chr08 NC_080394.1:27147206-27147216promoter 内 2010-2020 bp - 1981 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 27149197-27151595(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTA
SmilChr02G002262 Chr02 NC_080388.1:40076634-40076644promoter 内 1986-1996 bp + 2005 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40078649-40081433(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCGC
SmilChr03G001913 Chr03 NC_080389.1:26783098-26783108promoter 内 1956-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26778138-26781063(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTG
SmilChr07G004278 Chr07 NC_080393.1:55322236-55322246promoter 内 1924-1934 bp + 2067 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55314244-55320169(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGCG
SmilChr01G002348 Chr01 NC_080387.1:40625331-40625341promoter 内 1923-1933 bp - 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40627409-40632379(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCTGAGCC
SmilChr06G002030 Chr06 NC_080392.1:26445867-26445877promoter 内 1907-1917 bp + 2084 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26435263-26443783(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CAGGCTGAGCT
SmilChr05G000545 Chr05 NC_080391.1:4165102-4165112promoter 内 1878-1888 bp + 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 4157974-4162989(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TTCGCTGAGCG
SmilChr08G001798 Chr08 NC_080394.1:15154734-15154744promoter 内 1853-1863 bp + 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 15156882-15160959(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTG