转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 96 / 149 下载 TSV

上一页 96 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G001075 Chr06 NC_080392.1:10647794-10647804promoter 内 347-357 bp + 3644 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 10651448-10655456(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr02G003803 Chr02 NC_080388.1:59665014-59665024promoter 内 338-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 59659322-59661361(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCC
SmilChr01G004431 Chr01 NC_080387.1:62420983-62420993promoter 内 307-317 bp + 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 62415542-62417299(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAGT
SmilChr03G004688 Chr03 NC_080389.1:64276559-64276569promoter 内 238-248 bp - 3753 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 64270109-64272806(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACTAGCTGTCC
SmilChr07G000303 Chr07 NC_080393.1:1991070-1991080promoter 内 222-232 bp - 3769 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1994849-1998318(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTAAT
SmilChr02G000444 Chr02 NC_080388.1:5821102-5821112promoter 内 8-18 bp + 3983 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 5816373-5817119(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCCTAA
SmilChr06G001633 Chr06 NC_080392.1:18307640-18307650promoter 内 6-16 bp - 3985 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 18302279-18303655(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATTAGCTGTCA
SmilChr05G003024 Chr05 NC_080391.1:37779658-37779668promoter 内 2788-2798 bp + 1203 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 37780871-37793984(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAA
SmilChr01G003479 Chr01 NC_080387.1:53350274-53350284promoter 内 1239-1249 bp + 2752 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 53353036-53357047(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr03G004098 Chr03 NC_080389.1:59856700-59856710promoter 内 1171-1181 bp + 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 59859530-59869953(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr03G003420 Chr03 NC_080389.1:52545257-52545267promoter 内 626-636 bp + 3365 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 3 52539660-52541892(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr06G002296 Chr06 NC_080392.1:33142994-33143004promoter 内 3630-3640 bp - 361 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 33143365-33147033(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr03G003714 Chr03 NC_080389.1:56084252-56084262promoter 内 3611-3621 bp - 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 56083801-56083872(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCT
SmilChr05G002298 Chr05 NC_080391.1:24797803-24797813promoter 内 3604-3614 bp - 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 24798200-24799363(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTACAGCTGGG
SmilChr01G003265 Chr01 NC_080387.1:51329806-51329816promoter 内 3144-3154 bp - 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 51330663-51335242(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr06G001780 Chr06 NC_080392.1:20823956-20823966promoter 内 2924-2934 bp - 1067 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 20825033-20829097(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTCAC
SmilChr03G004044 Chr03 NC_080389.1:59433139-59433149promoter 内 2476-2486 bp - 1515 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 59430620-59431624(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAA
SmilChr07G001293 Chr07 NC_080393.1:9937113-9937123promoter 内 2446-2456 bp + 1545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 9938668-9938741(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCT
SmilChr01G005547 Chr01 NC_080387.1:72268675-72268685promoter 内 2409-2419 bp + 1582 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 72270267-72274502(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAA
SmilChr02G004759 Chr02 NC_080388.1:69778475-69778485promoter 内 2356-2366 bp - 1635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 69780120-69781536(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTA
SmilChr04G000418 Chr04 NC_080390.1:4416125-4416135promoter 内 2312-2322 bp + 1679 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 4417814-4419641(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCT
SmilChr07G001294 Chr07 NC_080393.1:9937113-9937123promoter 内 2220-2230 bp + 1771 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 9938894-9941357(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCT
SmilChr02G001258 Chr02 NC_080388.1:23084520-23084530promoter 内 2109-2119 bp + 1882 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 23079644-23082638(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG
SmilChr06G000736 Chr06 NC_080392.1:6783615-6783625promoter 内 2090-2100 bp - 1901 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 6785526-6792764(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTA
SmilChr03G000474 Chr03 NC_080389.1:5043996-5044006promoter 内 2072-2082 bp + 1919 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 5045925-5046758(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAAGCTGTCG
SmilChr04G001797 Chr04 NC_080390.1:29442218-29442228promoter 内 1908-1918 bp - 2083 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 29438872-29440135(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CCTAGCTGTCT
SmilChr04G003664 Chr04 NC_080390.1:53096108-53096118promoter 内 1908-1918 bp - 2083 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 53090879-53094025(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAA
SmilChr01G002700 Chr01 NC_080387.1:45270675-45270685promoter 内 1898-1908 bp + 2093 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 45267047-45268582(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ATCCAGCTGGT
SmilChr06G002312 Chr06 NC_080392.1:33396066-33396076promoter 内 1824-1834 bp - 2167 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 33398243-33401510(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG
SmilChr02G002247 Chr02 NC_080388.1:39906532-39906542promoter 内 1680-1690 bp - 2311 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 39908853-39912236(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTACAGCTGTA
SmilChr05G001130 Chr05 NC_080391.1:9440428-9440438promoter 内 1563-1573 bp - 2428 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 9442866-9444479(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGGCAGCTGGA
SmilChr07G000167 Chr07 NC_080393.1:1014989-1014999promoter 内 1558-1568 bp + 2433 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 1017432-1025739(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAA
SmilChr05G003900 Chr05 NC_080391.1:52755068-52755078promoter 内 1548-1558 bp + 2443 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 52750239-52752625(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr05G000514 Chr05 NC_080391.1:3961762-3961772promoter 内 1471-1481 bp + 2520 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 3956303-3959242(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG
SmilChr07G000888 Chr07 NC_080393.1:6366853-6366863promoter 内 1330-1340 bp - 2661 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 6360987-6364192(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTAAGCTGTCG
SmilChr06G000734 Chr06 NC_080392.1:6783615-6783625promoter 内 1171-1181 bp - 2820 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 6779082-6780795(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAA
SmilChr04G001820 Chr04 NC_080390.1:29696346-29696356promoter 内 1020-1030 bp - 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 29699327-29702229(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr05G003868 Chr05 NC_080391.1:52277688-52277698promoter 内 1020-1030 bp + 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 52272332-52274717(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr05G000025 Chr05 NC_080391.1:126383-126393promoter 内 983-993 bp - 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 129401-132645(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTTTC
SmilChr07G002888 Chr07 NC_080393.1:29169264-29169274promoter 内 944-954 bp - 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 29162196-29166217(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TTCAGCTGTCT
SmilChr01G003884 Chr01 NC_080387.1:57161130-57161140promoter 内 920-930 bp - 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 57164211-57166340(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr03G000404 Chr03 NC_080389.1:4403263-4403273promoter 内 809-819 bp - 3182 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 4396603-4400081(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr01G005172 Chr01 NC_080387.1:69471396-69471406promoter 内 651-661 bp + 3340 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 69474746-69476712(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCA
SmilChr01G006085 Chr01 NC_080387.1:76334887-76334897promoter 内 593-603 bp + 3398 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 76338295-76339200(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GAAAGCTGTCT
SmilChr01G001492 Chr01 NC_080387.1:28728229-28728239promoter 内 479-489 bp - 3512 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 28731751-28735693(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTAG
SmilChr05G003836 Chr05 NC_080391.1:51808224-51808234promoter 内 314-324 bp + 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 51811911-51812653(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr01G002497 Chr01 NC_080387.1:42783443-42783453promoter 内 306-316 bp - 3685 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 42787138-42790359(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGACAGCTGAA
SmilChr05G001239 Chr05 NC_080391.1:10510375-10510385promoter 内 288-298 bp - 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 10504157-10506672(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT
SmilChr01G003732 Chr01 NC_080387.1:55613905-55613915promoter 内 260-270 bp - 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 55607009-55610174(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAA
SmilChr06G000709 Chr06 NC_080392.1:6389252-6389262promoter 内 235-245 bp + 3756 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.4/ 100 2 6393018-6396074(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 ACCAGCTGGAT