转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 97 / 143 下载 TSV

上一页 97 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005409 Chr01 NC_080387.1:71347526-71347537promoter 内 1507-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 71341732-71345043(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCGG
SmilChr07G003709 Chr07 NC_080393.1:44812556-44812567promoter 内 1457-1468 bp + 2533 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 44815100-44816339(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr02G005336 Chr02 NC_080388.1:74218295-74218306promoter 内 1265-1276 bp - 2725 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 74204023-74215570(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCTG
SmilChr01G006085 Chr01 NC_080387.1:76335543-76335554promoter 内 1249-1260 bp - 2741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 76338295-76339200(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTT
SmilChr05G000427 Chr05 NC_080391.1:3220440-3220451promoter 内 1220-1231 bp - 2770 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 3212662-3217670(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCGT
SmilChr02G003324 Chr02 NC_080388.1:54520986-54520997promoter 内 1181-1192 bp + 2809 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 54514246-54518177(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTT
SmilChr02G001683 Chr02 NC_080388.1:31070333-31070344promoter 内 1155-1166 bp - 2835 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 31066005-31067498(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCTACAGCTGAC
SmilChr02G003774 Chr02 NC_080388.1:59438998-59439009promoter 内 1106-1117 bp + 2884 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 59434046-59436114(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCCT
SmilChr03G002217 Chr03 NC_080389.1:34929953-34929964promoter 内 1056-1067 bp - 2934 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 34932898-34933236(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGATG
SmilChr02G001714 Chr02 NC_080388.1:31521626-31521637promoter 内 938-949 bp + 3052 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 31524689-31528999(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTGCT
SmilChr03G002976 Chr03 NC_080389.1:46608023-46608034promoter 内 928-939 bp + 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 46601679-46604961(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTTTCAC
SmilChr04G001751 Chr04 NC_080390.1:28830811-28830822promoter 内 795-806 bp - 3195 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 28826880-28827616(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr07G002561 Chr07 NC_080393.1:24354502-24354513promoter 内 794-805 bp - 3196 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 24349118-24351306(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATT
SmilChr04G001775 Chr04 NC_080390.1:29184670-29184681promoter 内 782-793 bp + 3208 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 29187889-29190742(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr03G001204 Chr03 NC_080389.1:13875108-13875119promoter 内 719-730 bp + 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 13878390-13879761(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTACAGCTGAT
SmilChr01G001553 Chr01 NC_080387.1:29520887-29520898promoter 内 697-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 29514942-29517594(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr01G001526 Chr01 NC_080387.1:29226872-29226883promoter 内 680-691 bp - 3310 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 29220885-29223562(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTCAA
SmilChr02G003803 Chr02 NC_080388.1:59665013-59665024promoter 内 338-349 bp + 3652 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 59659322-59661361(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACTAGCTGTCCT
SmilChr07G001186 Chr07 NC_080393.1:9013937-9013948promoter 内 270-281 bp + 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 9017668-9018883(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCTG
SmilChr03G001472 Chr03 NC_080389.1:17565798-17565809promoter 内 183-194 bp + 3807 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 17560909-17561991(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGT
SmilChr02G004319 Chr02 NC_080388.1:65504166-65504177promoter 内 163-174 bp + 3827 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 65508004-65510566(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTCAT
SmilChr08G001815 Chr08 NC_080394.1:15296434-15296445promoter 内 115-126 bp + 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 15300320-15316132(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTATT
SmilChr08G002778 Chr08 NC_080394.1:27496168-27496179promoter 内 91-102 bp + 3899 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 27485200-27492269(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTAGT
SmilChr02G000598 Chr02 NC_080388.1:8642788-8642799promoter 内 49-60 bp + 3941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 8634748-8638847(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCTT
SmilChr07G000521 Chr07 NC_080393.1:3647418-3647429promoter 内 3751-3762 bp + 239 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 3647668-3649751(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGTT
SmilChr07G000522 Chr07 NC_080393.1:3647418-3647429promoter 内 125-136 bp + 3865 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 3 3651294-3653090(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGTT
SmilChr07G000796 Chr07 NC_080393.1:5620642-5620653promoter 内 3984-3995 bp - 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 5618953-5620636(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATCCAGCTGTT
SmilChr07G001406 Chr07 NC_080393.1:10935905-10935916promoter 内 3956-3967 bp + 34 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 10929836-10935871(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACCAGCTGTTAC
SmilChr07G000527 Chr07 NC_080393.1:3671214-3671225promoter 内 3788-3799 bp + 202 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 3671427-3673007(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGTT
SmilChr03G003806 Chr03 NC_080389.1:57133556-57133567promoter 内 3541-3552 bp + 449 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 57130065-57133107(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATG
SmilChr01G003186 Chr01 NC_080387.1:50614414-50614425promoter 内 3204-3215 bp + 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 50611651-50613628(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCTC
SmilChr03G000052 Chr03 NC_080389.1:520927-520938promoter 内 2613-2624 bp - 1377 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 517600-519550(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGTA
SmilChr02G002831 Chr02 NC_080388.1:48441561-48441572promoter 内 2560-2571 bp - 1430 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 48438113-48440131(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATCCAGCTGTT
SmilChr01G000080 Chr01 NC_080387.1:1459233-1459244promoter 内 1973-1984 bp - 2017 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 1457111-1457216(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATCCAGCTGTT
SmilChr04G000300 Chr04 NC_080390.1:2777888-2777899promoter 内 1784-1795 bp + 2206 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 2780105-2781652(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGTG
SmilChr07G002884 Chr07 NC_080393.1:29072935-29072946promoter 内 1450-1461 bp - 2540 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 29066972-29070395(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATCCAGCTGTT
SmilChr04G003735 Chr04 NC_080390.1:53665919-53665930promoter 内 1403-1414 bp + 2587 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 53661609-53663332(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTACT
SmilChr05G004328 Chr05 NC_080391.1:56934172-56934183promoter 内 1402-1413 bp + 2588 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 56929352-56931584(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATG
SmilChr03G003953 Chr03 NC_080389.1:58586016-58586027promoter 内 952-963 bp - 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 58589065-58591030(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTACT
SmilChr02G004916 Chr02 NC_080388.1:71179171-71179182promoter 内 918-929 bp - 3072 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 71182254-71185423(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATG
SmilChr07G000795 Chr07 NC_080393.1:5620642-5620653promoter 内 859-870 bp - 3131 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 5616209-5617511(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATCCAGCTGTT
SmilChr02G002353 Chr02 NC_080388.1:41320118-41320129promoter 内 832-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 41314921-41316960(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGTT
SmilChr07G000797 Chr07 NC_080393.1:5620642-5620653promoter 内 531-542 bp - 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 5624112-5626461(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATG
SmilChr08G000496 Chr08 NC_080394.1:3601043-3601054promoter 内 167-178 bp + 3823 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 2 3595221-3597220(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGATG
SmilChr03G002436 Chr03 NC_080389.1:38686240-38686251promoter 内 3645-3656 bp - 345 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 38684669-38685895(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAA
SmilChr05G003540 Chr05 NC_080391.1:47269907-47269918promoter 内 3490-3501 bp + 500 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 47270418-47271831(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTCAA
SmilChr05G000597 Chr05 NC_080391.1:4499840-4499851promoter 内 3290-3301 bp - 700 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 4497631-4499140(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAC
SmilChr07G002308 Chr07 NC_080393.1:21343655-21343666promoter 内 2905-2916 bp + 1085 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 21344751-21345334(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGTG
SmilChr01G003980 Chr01 NC_080387.1:58241372-58241383promoter 内 2623-2634 bp + 1367 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 58242750-58245425(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTGCG
SmilChr02G000521 Chr02 NC_080388.1:7161767-7161778promoter 内 2549-2560 bp - 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.6/ 100 1 7163219-7165430(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCTC