转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 1 / 138 下载 TSV

1 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000872 Chr03 NC_080389.1:9906870-9906882promoter 内 2023-2035 bp + 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 2 9908848-9909798(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACCGGG
SmilChr03G002267 Chr03 NC_080389.1:35798090-35798102promoter 内 1135-1147 bp + 2854 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 1 35800956-35804016(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACCGGG
SmilChr01G002366 Chr01 NC_080387.1:40834221-40834233promoter 内 1002-1014 bp - 2987 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 1 40837220-40839089(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACAGGTCAACGCC
SmilChr02G004154 Chr02 NC_080388.1:63846387-63846399promoter 内 938-950 bp + 3051 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 1 63849450-63852102(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACCATT
SmilChr03G000249 Chr03 NC_080389.1:2935507-2935519promoter 内 465-477 bp - 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 1 2939043-2943253(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCCGGTCAACGCC
SmilChr02G005074 Chr02 NC_080388.1:72381227-72381239promoter 内 384-396 bp - 3605 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.9/ 100 1 72384844-72390199(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGGTCAACGCC
SmilChr01G004514 Chr01 NC_080387.1:63265944-63265956promoter 内 2305-2317 bp - 1684 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 2 63262823-63264260(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCGTT
SmilChr01G002278 Chr01 NC_080387.1:39545641-39545653promoter 内 1718-1730 bp - 2271 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 1 39547924-39548787(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGGTCAACGGC
SmilChr02G005364 Chr02 NC_080388.1:74353163-74353175promoter 内 1404-1416 bp - 2585 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 1 74348519-74350578(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCTGT
SmilChr03G003207 Chr03 NC_080389.1:49624324-49624336promoter 内 362-374 bp - 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.8/ 100 1 49618368-49620697(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCGGT
SmilChr03G001096 Chr03 NC_080389.1:12643961-12643973promoter 内 165-177 bp + 3824 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 3 12647797-12648573(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACCTGG
SmilChr03G000366 Chr03 NC_080389.1:4094851-4094863promoter 内 1973-1985 bp - 2016 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 2 4088674-4092835(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACCTGG
SmilChr02G003933 Chr02 NC_080388.1:61410940-61410952promoter 内 563-575 bp - 3426 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 1 61405369-61407514(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACCATG
SmilChr03G001529 Chr03 NC_080389.1:19081173-19081185promoter 内 1262-1274 bp + 2727 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 3 19077686-19078446(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGGTCAACGGT
SmilChr02G004681 Chr02 NC_080388.1:69135841-69135853promoter 内 2152-2164 bp - 1837 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 69137690-69140701(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGGTCAACGGT
SmilChr02G004425 Chr02 NC_080388.1:66583948-66583960promoter 内 1729-1741 bp - 2260 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 66586220-66589870(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CAAGGTCAACGGT
SmilChr02G004679 Chr02 NC_080388.1:69135841-69135853promoter 内 1283-1295 bp - 2706 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 69130958-69133135(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACCGGT
SmilChr01G003235 Chr01 NC_080387.1:51107632-51107644promoter 内 598-610 bp + 3391 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 51101765-51104241(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGGTCAACGGT
SmilChr01G001666 Chr01 NC_080387.1:30754428-30754440promoter 内 466-478 bp - 3523 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 30748494-30750905(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGCGTTGACCTTG
SmilChr01G002730 Chr01 NC_080387.1:45657965-45657977promoter 内 3840-3852 bp - 149 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 45658126-45662265(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGGTCAACGGT
SmilChr02G005276 Chr02 NC_080388.1:73824843-73824855promoter 内 3765-3777 bp + 224 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 73825079-73825676(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACCTTT
SmilChr02G000329 Chr02 NC_080388.1:4205461-4205473promoter 内 1198-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 4201138-4202670(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACCGTT
SmilChr02G000332 Chr02 NC_080388.1:4213449-4213461promoter 内 1198-1210 bp - 2791 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 2 4209441-4210658(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACCGTTGACCGTT
SmilChr01G001844 Chr01 NC_080387.1:33401520-33401532promoter 内 1747-1759 bp + 2242 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 33396188-33399278(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGGTCAACGGT
SmilChr01G002390 Chr01 NC_080387.1:41176337-41176349promoter 内 1360-1372 bp + 2629 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 41170890-41173708(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AACGGTCAACGGT
SmilChr02G001959 Chr02 NC_080388.1:35375870-35375882promoter 内 2394-2406 bp + 1595 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 6 35377477-35377821(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCAAG
SmilChr01G002996 Chr01 NC_080387.1:48915177-48915189promoter 内 2839-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 48916339-48918397(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCAAGTCAACGCC
SmilChr01G001075 Chr01 NC_080387.1:22162471-22162483promoter 内 2528-2540 bp + 1461 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 22163944-22168094(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACTATG
SmilChr01G003689 Chr01 NC_080387.1:55271379-55271391promoter 内 2405-2417 bp - 1584 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 55267026-55269795(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCAGA
SmilChr01G003328 Chr01 NC_080387.1:51967121-51967133promoter 内 1519-1531 bp - 2470 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 51969603-51972266(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCCAGTCAACGCC
SmilChr01G001074 Chr01 NC_080387.1:22162471-22162483promoter 内 1175-1187 bp + 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 22157957-22159657(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAACGCC
SmilChr03G002509 Chr03 NC_080389.1:39954560-39954572promoter 内 3969-3981 bp - 20 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 39954592-39957361(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAACGCC
SmilChr01G001041 Chr01 NC_080387.1:21643122-21643134promoter 内 2963-2975 bp - 1026 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 21637958-21642096(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACTATG
SmilChr01G003695 Chr01 NC_080387.1:55313376-55313388promoter 内 974-986 bp + 3015 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 55305291-55310361(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGGTCAACGCC
SmilChr01G003989 Chr01 NC_080387.1:58310933-58310945promoter 内 727-739 bp + 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 58314207-58315187(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACTAGT
SmilChr01G000612 Chr01 NC_080387.1:13519363-13519375promoter 内 515-527 bp - 3474 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 3 13514420-13515889(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACTATT
SmilChr02G000301 Chr02 NC_080388.1:3801772-3801784promoter 内 3675-3687 bp - 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 3800886-3801458(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCTAT
SmilChr02G000341 Chr02 NC_080388.1:4440389-4440401promoter 内 3675-3687 bp + 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 4440715-4441287(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCTAT
SmilChr01G003452 Chr01 NC_080387.1:53089078-53089090promoter 内 2193-2205 bp + 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 53086481-53087282(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AATAGTCAACGGC
SmilChr01G000204 Chr01 NC_080387.1:3520332-3520344promoter 内 1498-1510 bp - 2491 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 3514613-3517841(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACTATG
SmilChr03G003534 Chr03 NC_080389.1:53944539-53944551promoter 内 1452-1464 bp + 2537 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 53947088-53948198(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACTATT
SmilChr01G001272 Chr01 NC_080387.1:25400624-25400636promoter 内 1380-1392 bp + 2609 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 25403245-25405945(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACCGAT
SmilChr01G003406 Chr01 NC_080387.1:52722970-52722982promoter 内 990-1002 bp + 2999 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 52725981-52727578(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACCAAT
SmilChr02G000544 Chr02 NC_080388.1:7500159-7500171promoter 内 3834-3846 bp + 155 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 7500326-7500844(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCCGTTGACTATG
SmilChr01G003608 Chr01 NC_080387.1:54638632-54638644promoter 内 2715-2727 bp - 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 54633004-54637358(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACCGAT
SmilChr01G005847 Chr01 NC_080387.1:74436931-74436943promoter 内 2507-2519 bp - 1482 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 74432516-74435449(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACTTTT
SmilChr03G001376 Chr03 NC_080389.1:16245422-16245434promoter 内 434-446 bp + 3555 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 16248989-16250404(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GGCGTTGACCGAT
SmilChr02G000543 Chr02 NC_080388.1:7500159-7500171promoter 内 62-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 1 7493156-7496232(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATAGTCAACGGC
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SmilChr03G002269 Chr03 NC_080389.1:35821221-35821233promoter 内 3985-3997 bp + 4 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.0/ 100 1 35819285-35821217(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAGGTCAACGGC