转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 100 / 148 下载 TSV

上一页 100 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G004554 Chr02 NC_080388.1:68059554-68059567promoter 内 3163-3176 bp + 825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 68055111-68058729(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTCTAA
SmilChr02G000357 Chr02 NC_080388.1:4604245-4604258promoter 内 2846-2859 bp + 1142 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 4601080-4603103(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGACATT
SmilChr01G002327 Chr01 NC_080387.1:40416521-40416534promoter 内 2444-2457 bp - 1544 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 40413969-40414977(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAATGCACGTGG
SmilChr08G000690 Chr08 NC_080394.1:5134645-5134658promoter 内 2412-2425 bp - 1576 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 5128006-5133069(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACATATCACGTGG
SmilChr04G002370 Chr04 NC_080390.1:38182062-38182075promoter 内 2400-2413 bp - 1588 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 38183663-38185907(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAATTCAC
SmilChr05G003059 Chr05 NC_080391.1:38413309-38413322promoter 内 2373-2386 bp - 1615 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 38407476-38411694(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCTCTTCACGTGC
SmilChr07G003477 Chr07 NC_080393.1:39027536-39027549promoter 内 2308-2321 bp + 1680 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 39021199-39025856(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGATCTTCA
SmilChr04G003810 Chr04 NC_080390.1:54255252-54255265promoter 内 1962-1975 bp - 2026 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 54257291-54260001(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAGGTC
SmilChr04G000786 Chr04 NC_080390.1:9680917-9680930promoter 内 1771-1784 bp - 2217 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 9676495-9678700(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACATTCACGTGG
SmilChr08G001674 Chr08 NC_080394.1:13964261-13964274promoter 内 1631-1644 bp - 2357 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 13956558-13961904(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAGATTCACGTGA
SmilChr03G004730 Chr03 NC_080389.1:64463172-64463185promoter 内 1439-1452 bp - 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 64465734-64468897(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTGTTAT
SmilChr05G001177 Chr05 NC_080391.1:9876079-9876092promoter 内 926-939 bp - 3062 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 9870211-9873017(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGAATTCACGTGA
SmilChr07G003905 Chr07 NC_080393.1:49236803-49236816promoter 内 658-671 bp - 3330 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 49240146-49243706(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAATTCAC
SmilChr06G002959 Chr06 NC_080392.1:42387632-42387645promoter 内 561-574 bp + 3427 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 42391072-42393776(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAAAACTCACGTGC
SmilChr05G004021 Chr05 NC_080391.1:54200950-54200963promoter 内 41-54 bp - 3947 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 54204910-54208677(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGATTTC
SmilChr05G000538 Chr05 NC_080391.1:4127954-4127967promoter 内 3975-3988 bp - 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4127980-4130486(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAAGTCA
SmilChr03G002268 Chr03 NC_080389.1:35807406-35807419promoter 内 3928-3941 bp + 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 35806557-35807346(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGTGTCA
SmilChr02G003289 Chr02 NC_080388.1:54167212-54167225promoter 内 3920-3933 bp + 68 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54165330-54167144(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACAAAAT
SmilChr05G001203 Chr05 NC_080391.1:10108083-10108096promoter 内 3910-3923 bp + 78 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10104555-10108005(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATGTAAC
SmilChr07G002460 Chr07 NC_080393.1:23131823-23131836promoter 内 3822-3835 bp - 166 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23132002-23140480(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACAAATG
SmilChr08G001004 Chr08 NC_080394.1:7562433-7562446promoter 内 3814-3827 bp - 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 7562620-7564024(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATTCTA
SmilChr06G002240 Chr06 NC_080392.1:31720484-31720497promoter 内 3811-3824 bp + 177 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 31719294-31720307(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGAACA
SmilChr06G002311 Chr06 NC_080392.1:33384411-33384424promoter 内 3742-3755 bp - 246 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 33384670-33385999(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGGCAAA
SmilChr03G003634 Chr03 NC_080389.1:55024496-55024509promoter 内 3739-3752 bp - 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55022605-55024247(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTATACCACGTGG
SmilChr06G001676 Chr06 NC_080392.1:19038343-19038356promoter 内 3588-3601 bp - 400 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 19038756-19052342(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGTTACA
SmilChr01G005440 Chr01 NC_080387.1:71521949-71521962promoter 内 3484-3497 bp - 504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 71519011-71521445(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCCCACCACGTGG
SmilChr02G000251 Chr02 NC_080388.1:3238697-3238710promoter 内 3457-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3236952-3238166(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACATTACACGTGG
SmilChr02G000504 Chr02 NC_080388.1:6951123-6951136promoter 内 3424-3437 bp + 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 6951700-6952732(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAGTGCCCACGTGG
SmilChr02G005122 Chr02 NC_080388.1:72698637-72698650promoter 内 3355-3368 bp - 633 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 72699283-72703370(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTCACCG
SmilChr05G002851 Chr05 NC_080391.1:34005361-34005374promoter 内 3280-3293 bp - 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 34006082-34007875(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAACTTTC
SmilChr02G002177 Chr02 NC_080388.1:39000839-39000852promoter 内 3243-3256 bp - 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38991661-39000094(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTTTTGGCACGTGG
SmilChr08G000151 Chr08 NC_080394.1:970703-970716promoter 内 3235-3248 bp + 753 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 971469-991885(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCTTCTCACGTGG
SmilChr01G003691 Chr01 NC_080387.1:55280697-55280710promoter 内 3188-3201 bp + 800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55276083-55279897(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATGTCA
SmilChr05G000621 Chr05 NC_080391.1:4701581-4701594promoter 内 3106-3119 bp - 882 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4702476-4703165(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTGAAC
SmilChr02G004647 Chr02 NC_080388.1:68913006-68913019promoter 内 3102-3115 bp + 886 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68906280-68912120(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGATTAG
SmilChr01G003574 Chr01 NC_080387.1:54299223-54299236promoter 内 3072-3085 bp - 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54300152-54302260(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCTCAG
SmilChr05G003293 Chr05 NC_080391.1:43071717-43071730promoter 内 3070-3083 bp + 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 43067830-43070799(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATGCTC
SmilChr07G000722 Chr07 NC_080393.1:5026042-5026055promoter 内 3070-3083 bp - 918 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5023494-5025124(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCACATCACGTGT
SmilChr02G001088 Chr02 NC_080388.1:19587254-19587267promoter 内 3019-3032 bp + 969 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 19582600-19586285(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACAGAAC
SmilChr07G004092 Chr07 NC_080393.1:52458572-52458585promoter 内 2930-2943 bp - 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52459643-52462482(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGAGCAT
SmilChr07G002788 Chr07 NC_080393.1:27792057-27792070promoter 内 2913-2926 bp + 1075 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 27788767-27790982(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATTTCTT
SmilChr03G003427 Chr03 NC_080389.1:52601858-52601871promoter 内 2876-2889 bp - 1112 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 52602983-52606903(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGGGGAG
SmilChr01G000281 Chr01 NC_080387.1:5523194-5523207promoter 内 2821-2834 bp - 1167 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5521374-5522027(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGATTTTCACGTGC
SmilChr05G000537 Chr05 NC_080391.1:4127954-4127967promoter 内 2808-2821 bp - 1180 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 4119603-4126774(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACTTTCACGTGG
SmilChr07G003685 Chr07 NC_080393.1:44370589-44370602promoter 内 2699-2712 bp + 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 44362916-44369300(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACAGAAC
SmilChr02G003352 Chr02 NC_080388.1:54713270-54713283promoter 内 2629-2642 bp - 1359 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54710558-54711911(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACAGATCACGTGC
SmilChr02G003841 Chr02 NC_080388.1:60134056-60134069promoter 内 2585-2598 bp + 1403 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 60135472-60136046(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTGAAGCACGTGG
SmilChr02G003761 Chr02 NC_080388.1:59288400-59288413promoter 内 2532-2545 bp - 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 59289869-59293995(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAACTTG
SmilChr01G005050 Chr01 NC_080387.1:68446244-68446257promoter 内 2431-2444 bp - 1557 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 68447814-68451121(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAAAGGCT
SmilChr04G002697 Chr04 NC_080390.1:42472442-42472455promoter 内 2428-2441 bp + 1560 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 42474015-42475474(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGCATGCACGTGG