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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 104 / 148 下载 TSV

上一页 104 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002252 Chr04 NC_080390.1:36490350-36490363promoter 内 720-733 bp + 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 36483905-36487082(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAACTAAT
SmilChr06G000088 Chr06 NC_080392.1:630076-630089promoter 内 684-697 bp - 3304 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 633393-635237(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTACAACA
SmilChr03G001371 Chr03 NC_080389.1:16111172-16111185promoter 内 638-651 bp + 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 16096314-16107822(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAAATACA
SmilChr04G001600 Chr04 NC_080390.1:26684088-26684101promoter 内 635-648 bp - 3353 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26676919-26680735(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTGAACCACGTGG
SmilChr04G001833 Chr04 NC_080390.1:29879019-29879032promoter 内 616-629 bp + 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 29882404-29883489(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTCAGTCACGTGT
SmilChr07G003584 Chr07 NC_080393.1:41874963-41874976promoter 内 487-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41868676-41871462(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCTTCACG
SmilChr02G000568 Chr02 NC_080388.1:8024066-8024079promoter 内 480-493 bp - 3508 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8013848-8020558(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CAAATCGCACGTGG
SmilChr03G001732 Chr03 NC_080389.1:23285433-23285446promoter 内 472-485 bp - 3516 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 23281811-23281917(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTATTTCACGTGC
SmilChr06G001229 Chr06 NC_080392.1:12690975-12690988promoter 内 403-416 bp - 3585 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12694573-12694649(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTTAG
SmilChr05G001247 Chr05 NC_080391.1:10594415-10594428promoter 内 401-414 bp - 3587 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 10598015-10601637(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGCAAAA
SmilChr08G000772 Chr08 NC_080394.1:5691604-5691617promoter 内 384-397 bp - 3604 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5686469-5688000(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTGAACCACGTGG
SmilChr08G000540 Chr08 NC_080394.1:3942642-3942655promoter 内 311-324 bp + 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 3937963-3938965(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTGTTTT
SmilChr06G001230 Chr06 NC_080392.1:12690975-12690988promoter 内 231-244 bp - 3757 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12694745-12694825(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAATTTAG
SmilChr07G001545 Chr07 NC_080393.1:12551125-12551138promoter 内 203-216 bp - 3785 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12554923-12558238(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGCAAAA
SmilChr06G001873 Chr06 NC_080392.1:22244611-22244624promoter 内 174-187 bp + 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 22238063-22240797(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTGGTCT
SmilChr08G000773 Chr08 NC_080394.1:5691604-5691617promoter 内 31-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 5695574-5698253(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTTCACG
SmilChr05G000768 Chr05 NC_080391.1:5984696-5984709promoter 内 3898-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 5978121-5984606(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCATACCACGTGG
SmilChr05G003361 Chr05 NC_080391.1:44406551-44406564promoter 内 3173-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 44407379-44408224(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGACCTTCACGTGC
SmilChr07G003466 Chr07 NC_080393.1:38750332-38750345promoter 内 2135-2148 bp + 1853 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 38752198-38754479(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGCGAACACGTGG
SmilChr06G002869 Chr06 NC_080392.1:41531367-41531380promoter 内 1940-1953 bp - 2048 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 41528149-41529319(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCATCTCACGTGA
SmilChr05G000742 Chr05 NC_080391.1:5685631-5685644promoter 内 1587-1600 bp + 2401 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 5688045-5688782(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TATGCTCCACGTGG
SmilChr08G001103 Chr08 NC_080394.1:8525192-8525205promoter 内 930-943 bp + 3058 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 8519631-8522134(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTATGAT
SmilChr06G000951 Chr06 NC_080392.1:9162667-9162680promoter 内 187-200 bp + 3801 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 9155814-9158866(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAACTGAA
SmilChr04G002199 Chr04 NC_080390.1:35603432-35603445promoter 内 87-100 bp - 3901 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 35607346-35610055(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTCGTCA
SmilChr07G001261 Chr07 NC_080393.1:9699556-9699569promoter 内 44-57 bp - 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 9703513-9705460(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTACTT
SmilChr06G000604 Chr06 NC_080392.1:5218945-5218958promoter 内 3902-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 5217827-5218859(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCTCATCACGTGA
SmilChr07G002101 Chr07 NC_080393.1:19114497-19114510promoter 内 3840-3853 bp + 148 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 19111360-19114349(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCTAATT
SmilChr07G002618 Chr07 NC_080393.1:25271173-25271186promoter 内 3816-3829 bp - 172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 25271358-25272819(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGATATT
SmilChr03G004089 Chr03 NC_080389.1:59789242-59789255promoter 内 3794-3807 bp + 194 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 59786087-59789048(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATATTCA
SmilChr08G001095 Chr08 NC_080394.1:8448056-8448069promoter 内 3775-3788 bp - 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 8442358-8447843(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGAGATCACGTGT
SmilChr03G003789 Chr03 NC_080389.1:56990782-56990795promoter 内 3680-3693 bp - 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 56987902-56990474(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AACCTGTCACGTGT
SmilChr02G004865 Chr02 NC_080388.1:70763493-70763506promoter 内 3679-3692 bp - 309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 70763815-70766556(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACAACTT
SmilChr02G004864 Chr02 NC_080388.1:70763493-70763506promoter 内 3579-3592 bp - 409 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 70761104-70763084(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGTTGTCACGTGA
SmilChr07G002111 Chr07 NC_080393.1:19225741-19225754promoter 内 3528-3541 bp + 460 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 19219495-19225281(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCTAATT
SmilChr01G005133 Chr01 NC_080387.1:69133905-69133918promoter 内 3486-3499 bp + 502 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 69131839-69133403(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGAGGGTCG
SmilChr07G004158 Chr07 NC_080393.1:54618187-54618200promoter 内 3410-3423 bp - 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53450446-54617609(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGTTTCACGTGA
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SmilChr06G002585 Chr06 NC_080392.1:37063929-37063942promoter 内 3272-3285 bp + 716 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 37059666-37063213(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTATCTTA
SmilChr05G004151 Chr05 NC_080391.1:55442017-55442030promoter 内 3247-3260 bp - 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 55442771-55444143(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGATATA
SmilChr03G004460 Chr03 NC_080389.1:62690026-62690039promoter 内 3058-3071 bp - 930 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 62687438-62689096(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTCGTACCACGTGG
SmilChr05G001588 Chr05 NC_080391.1:14580733-14580746promoter 内 3047-3060 bp - 941 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 14579370-14579792(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATGTTCACGTGC
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SmilChr08G001514 Chr08 NC_080394.1:12292839-12292852promoter 内 2772-2785 bp - 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 12291054-12291623(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATGTTCACGTGC