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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G001518; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00023584-RA_Salv SmilChr05G001518 WRKY XP_057765511.1 MP00455 AACGTTGACTATT

可能结合的靶基因

9792 个结合位点 6900 个候选靶基因 第 108 / 138 下载 TSV

上一页 108 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005166 Chr02 NC_080388.1:72997859-72997871promoter 内 3257-3269 bp + 732 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 72994608-72997127(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCGAGTCAACATG
SmilChr01G004676 Chr01 NC_080387.1:64859327-64859339promoter 内 2268-2280 bp - 1721 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 64853565-64857606(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGTTGACTAAA
SmilChr03G004261 Chr03 NC_080389.1:61100145-61100157promoter 内 2131-2143 bp + 1858 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 61102015-61108363(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CATGTTGACTTAA
SmilChr01G003146 Chr01 NC_080387.1:50282713-50282725promoter 内 2098-2110 bp - 1891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 50280144-50280822(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTGTTTGACTAAA
SmilChr02G003761 Chr02 NC_080388.1:59287869-59287881promoter 内 2001-2013 bp + 1988 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 59289869-59293995(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTTAC
SmilChr03G001204 Chr03 NC_080389.1:13876258-13876270promoter 内 1869-1881 bp + 2120 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 13878390-13879761(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGTTGACTCAA
SmilChr02G004964 Chr02 NC_080388.1:71553898-71553910promoter 内 1802-1814 bp - 2187 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 71556097-71562272(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGGAGTCAACACC
SmilChr03G001317 Chr03 NC_080389.1:15453012-15453024promoter 内 1793-1805 bp - 2196 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 15449509-15450816(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGTTGACTCAA
SmilChr03G003681 Chr03 NC_080389.1:55652425-55652437promoter 内 1773-1785 bp + 2216 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 55654653-55655777(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGTTGACTTGC
SmilChr03G001319 Chr03 NC_080389.1:15462675-15462687promoter 内 1067-1079 bp + 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 15458438-15459753(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTGAGTCAACATC
SmilChr02G002102 Chr02 NC_080388.1:37697745-37697757promoter 内 683-695 bp - 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 37690636-37694439(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTACG
SmilChr02G001374 Chr02 NC_080388.1:25981619-25981631promoter 内 283-295 bp + 3706 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 2 25985337-25988773(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAGTTGACTACA
SmilChr01G002380 Chr01 NC_080387.1:41002438-41002450promoter 内 3980-3992 bp + 9 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 41002459-41005081(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGTTGACTTAA
SmilChr03G003854 Chr03 NC_080389.1:57645856-57645868promoter 内 3972-3984 bp - 17 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 57640631-57645839(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACATTTGACTATT
SmilChr01G000835 Chr01 NC_080387.1:18033285-18033297promoter 内 3945-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18033341-18034810(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACTTA
SmilChr02G005040 Chr02 NC_080388.1:72131157-72131169promoter 内 3905-3917 bp + 84 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 72131253-72136802(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGTTGACTAAA
SmilChr03G000674 Chr03 NC_080389.1:7542448-7542460promoter 内 3808-3820 bp - 181 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 7540437-7542267(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGTTGACTTAA
SmilChr02G000731 Chr02 NC_080388.1:11860116-11860128promoter 内 3755-3767 bp + 234 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 11860362-11863701(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGTTGACTTAA
SmilChr02G000656 Chr02 NC_080388.1:9969728-9969740promoter 内 3562-3574 bp - 427 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 9968660-9969301(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGAGTTGACTTCA
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SmilChr03G003590 Chr03 NC_080389.1:54555638-54555650promoter 内 3490-3502 bp + 499 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54556149-54564451(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGTTGACTTAA
SmilChr03G000274 Chr03 NC_080389.1:3127133-3127145promoter 内 3483-3495 bp - 506 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 3127651-3128780(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGCAGTCAACTCT
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SmilChr02G003769 Chr02 NC_080388.1:59389843-59389855promoter 内 3324-3336 bp - 665 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 59387920-59389178(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTTGTTGACTGAC
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SmilChr03G003973 Chr03 NC_080389.1:58757010-58757022promoter 内 3310-3322 bp - 679 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 58757701-58763813(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ACTAGTCAATGAC
SmilChr02G004275 Chr02 NC_080388.1:64943244-64943256promoter 内 3215-3227 bp - 774 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 64944030-64945789(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GAGAGTCAACTCT
SmilChr03G003472 Chr03 NC_080389.1:53210448-53210460promoter 内 3211-3223 bp - 778 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 53204994-53209670(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AAAGTTGACTAAA
SmilChr03G004258 Chr03 NC_080389.1:61074829-61074841promoter 内 3030-3042 bp + 959 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 61075800-61082461(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTGTTTGACTAAA
SmilChr03G001808 Chr03 NC_080389.1:24682122-24682134promoter 内 3013-3025 bp - 976 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 24677312-24681146(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GTGTTTGACTAAA
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SmilChr03G004458 Chr03 NC_080389.1:62681479-62681491promoter 内 2939-2951 bp - 1050 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 62675581-62680429(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTCAG
SmilChr01G004051 Chr01 NC_080387.1:58965086-58965098promoter 内 2853-2865 bp - 1136 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 58956726-58963950(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATTTTGACTAGA
SmilChr01G000829 Chr01 NC_080387.1:17838881-17838893promoter 内 2844-2856 bp - 1145 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 17840038-17840523(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACTTA
SmilChr03G001775 Chr03 NC_080389.1:24197537-24197549promoter 内 2831-2843 bp + 1158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 24198707-24198812(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGTTGACTTGC
SmilChr03G003589 Chr03 NC_080389.1:54555638-54555650promoter 内 2791-2803 bp + 1198 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 54552627-54554440(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTAAGTCAACTTT
SmilChr03G003290 Chr03 NC_080389.1:51018134-51018146promoter 内 2771-2783 bp + 1218 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 51019364-51019993(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATGTTGACTCAA
SmilChr01G002343 Chr01 NC_080387.1:40576222-40576234promoter 内 2751-2763 bp + 1238 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 40577472-40582546(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 CCTGTTGACTGCA
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SmilChr01G005185 Chr01 NC_080387.1:69568037-69568049promoter 内 2707-2719 bp + 1282 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 69569331-69575575(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GATTTTGACTATA
SmilChr02G001424 Chr02 NC_080388.1:26889960-26889972promoter 内 2581-2593 bp + 1408 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 26884547-26888552(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 AGGAGTCAACCAT
SmilChr03G004459 Chr03 NC_080389.1:62681479-62681491promoter 内 2509-2521 bp - 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 62679200-62679999(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTCAG
SmilChr01G002712 Chr01 NC_080387.1:45366650-45366662promoter 内 2440-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 45368211-45371658(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TTCAGTCAACATG
SmilChr03G001519 Chr03 NC_080389.1:18641093-18641105promoter 内 2430-2442 bp + 1559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 18642664-18643384(+) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 ATTGTTGACTCAG
SmilChr01G000382 Chr01 NC_080387.1:7858543-7858555promoter 内 2403-2415 bp - 1586 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 7856244-7856957(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TAAGTTGACTTGC
SmilChr03G004199 Chr03 NC_080389.1:60632456-60632468promoter 内 2271-2283 bp + 1718 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 60627061-60630738(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 TGAAGTCAACTCT
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SmilChr02G000487 Chr02 NC_080388.1:6641528-6641540promoter 内 2214-2226 bp + 1775 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 6636649-6639753(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACTTA
SmilChr03G001683 Chr03 NC_080389.1:22213743-22213755promoter 内 2186-2198 bp + 1803 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.6/ 100 1 22208652-22211940(-) SMil_00023584-RA_Salv MP00455 GCAAGTCAACTTA