转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 11 / 136 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001137 Chr03 NC_080389.1:13094736-13094746promoter 内 2980-2990 bp - 1011 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 13095757-13096290(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGTG
SmilChr08G000352 Chr08 NC_080394.1:2425797-2425807promoter 内 2920-2930 bp + 1071 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 2423123-2424726(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGA
SmilChr07G003151 Chr07 NC_080393.1:33462067-33462077promoter 内 2669-2679 bp + 1322 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 33456705-33460745(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCA
SmilChr02G002666 Chr02 NC_080388.1:46155118-46155128promoter 内 2584-2594 bp - 1407 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 46156535-46157296(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCT
SmilChr08G002603 Chr08 NC_080394.1:25400829-25400839promoter 内 2525-2535 bp + 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 25402305-25403450(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGG
SmilChr08G000349 Chr08 NC_080394.1:2416122-2416132promoter 内 2472-2482 bp + 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 2413039-2414603(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGA
SmilChr06G000838 Chr06 NC_080392.1:7907901-7907911promoter 内 2442-2452 bp + 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 7903604-7906352(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCT
SmilChr05G002725 Chr05 NC_080391.1:31360544-31360554promoter 内 2221-2231 bp + 1770 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 31352926-31358774(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCT
SmilChr03G001799 Chr03 NC_080389.1:24611547-24611557promoter 内 2150-2160 bp + 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 24605563-24609706(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGA
SmilChr01G001338 Chr01 NC_080387.1:26606542-26606552promoter 内 2086-2096 bp - 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 26608457-26614485(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGTG
SmilChr05G004054 Chr05 NC_080391.1:54504927-54504937promoter 内 2038-2048 bp - 1953 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54500925-54502974(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCG
SmilChr05G003404 Chr05 NC_080391.1:45132197-45132207promoter 内 1988-1998 bp + 2003 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 45134210-45139298(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGC
SmilChr03G001710 Chr03 NC_080389.1:22871537-22871547promoter 内 1867-1877 bp - 2124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 22873671-22874800(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCGCTGAGCA
SmilChr01G000275 Chr01 NC_080387.1:5459482-5459492promoter 内 1809-1819 bp + 2182 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 5461674-5465796(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGCT
SmilChr05G004055 Chr05 NC_080391.1:54504927-54504937promoter 内 1679-1689 bp - 2312 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 54507249-54510191(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGA
SmilChr08G000348 Chr08 NC_080394.1:2413443-2413453promoter 内 1611-1621 bp + 2380 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 2409367-2411063(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGA
SmilChr04G002339 Chr04 NC_080390.1:37731078-37731088promoter 内 1581-1591 bp - 2410 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 37733498-37735638(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGTG
SmilChr07G002734 Chr07 NC_080393.1:26818581-26818591promoter 内 1460-1470 bp + 2531 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 26821122-26823700(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGG
SmilChr07G000514 Chr07 NC_080393.1:3607513-3607523promoter 内 1275-1285 bp + 2716 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 3610239-3612450(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGC
SmilChr06G001187 Chr06 NC_080392.1:12086102-12086112promoter 内 1138-1148 bp + 2853 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 12081317-12083249(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGTG
SmilChr08G000351 Chr08 NC_080394.1:2423589-2423599promoter 内 1113-1123 bp + 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 2419051-2420711(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGA
SmilChr02G004900 Chr02 NC_080388.1:71009583-71009593promoter 内 911-921 bp + 3080 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 71012673-71016859(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCG
SmilChr03G003273 Chr03 NC_080389.1:50696850-50696860promoter 内 843-853 bp + 3148 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 50689598-50693702(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGTG
SmilChr07G002281 Chr07 NC_080393.1:21100964-21100974promoter 内 784-794 bp + 3207 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 21095003-21097757(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCT
SmilChr04G001522 Chr04 NC_080390.1:25137871-25137881promoter 内 757-767 bp - 3234 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 25133386-25134637(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGC
SmilChr01G001131 Chr01 NC_080387.1:23002680-23002690promoter 内 744-754 bp - 3247 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 23005937-23007193(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGTG
SmilChr05G002091 Chr05 NC_080391.1:21897399-21897409promoter 内 715-725 bp - 3276 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 21887826-21894123(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCGGC
SmilChr02G002021 Chr02 NC_080388.1:36434468-36434478promoter 内 639-649 bp - 3352 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 36437830-36440922(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGCG
SmilChr05G002094 Chr05 NC_080391.1:21897399-21897409promoter 内 621-631 bp - 3370 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 21900779-21901399(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCT
SmilChr05G002787 Chr05 NC_080391.1:32578126-32578136promoter 内 527-537 bp + 3464 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 32568062-32574662(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCT
SmilChr02G000370 Chr02 NC_080388.1:4707751-4707761promoter 内 516-526 bp + 3475 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 4699575-4704276(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAGGA
SmilChr03G000206 Chr03 NC_080389.1:2360842-2360852promoter 内 486-496 bp + 3505 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 2364357-2367604(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGG
SmilChr07G003153 Chr07 NC_080393.1:33462067-33462077promoter 内 358-368 bp + 3633 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 33465710-33466486(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCGGG
SmilChr02G002841 Chr02 NC_080388.1:48543316-48543326promoter 内 284-294 bp - 3707 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 48537649-48539609(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGCG
SmilChr01G004163 Chr01 NC_080387.1:60123297-60123307promoter 内 242-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 60127056-60131519(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGCT
SmilChr08G000354 Chr08 NC_080394.1:2425797-2425807promoter 内 214-224 bp + 3777 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 2429584-2436644(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TCCTCAGCGCG
SmilChr08G004213 Chr08 NC_080394.1:51512784-51512794promoter 内 3947-3957 bp - 44 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 51512838-51514396(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGT
SmilChr01G001078 Chr01 NC_080387.1:22221807-22221817promoter 内 1833-1843 bp + 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 22215795-22219649(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGT
SmilChr04G001719 Chr04 NC_080390.1:28445417-28445427promoter 内 3334-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 28446084-28449000(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCC
SmilChr01G004727 Chr01 NC_080387.1:65453069-65453079promoter 内 2783-2793 bp - 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 65449517-65451861(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCC
SmilChr05G001900 Chr05 NC_080391.1:19276127-19276137promoter 内 2552-2562 bp - 1439 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 19277576-19287440(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGT
SmilChr05G003720 Chr05 NC_080391.1:50315462-50315472promoter 内 2024-2034 bp + 1967 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 50317439-50318619(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGTG
SmilChr08G004214 Chr08 NC_080394.1:51512784-51512794promoter 内 974-984 bp - 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 51515811-51521631(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGT
SmilChr02G002944 Chr02 NC_080388.1:49960242-49960252promoter 内 64-74 bp - 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 49949392-49956315(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCC
SmilChr07G003676 Chr07 NC_080393.1:44192462-44192472promoter 内 3584-3594 bp - 407 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 44191087-44192055(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCC
SmilChr07G003701 Chr07 NC_080393.1:44640291-44640301promoter 内 3562-3572 bp - 429 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 44638927-44639862(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCC
SmilChr02G002398 Chr02 NC_080388.1:41869502-41869512promoter 内 3465-3475 bp + 526 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 41870038-41876295(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCGTG
SmilChr03G001144 Chr03 NC_080389.1:13197968-13197978promoter 内 3438-3448 bp + 553 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 13198531-13199340(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCC
SmilChr01G000750 Chr01 NC_080387.1:16574951-16574961promoter 内 3089-3099 bp - 902 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 16575863-16581141(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGAGGT
SmilChr07G002849 Chr07 NC_080393.1:28600947-28600957promoter 内 2769-2779 bp - 1222 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 28598796-28599725(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCTCAGCGCC