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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 11 / 133 下载 TSV

上一页 11 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004147 Chr01 NC_080387.1:59994933-59994947promoter 内 2785-2799 bp - 1202 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 59990548-59993731(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGAATAT
SmilChr01G000511 Chr01 NC_080387.1:10399761-10399775promoter 内 2761-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 10401001-10401339(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTAGATAAGGAAAG
SmilChr02G001494 Chr02 NC_080388.1:27888740-27888754promoter 内 2543-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 27886473-27887296(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGGCGTT
SmilChr02G000467 Chr02 NC_080388.1:6301785-6301799promoter 内 2441-2455 bp + 1546 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 6297501-6300239(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACTGCCTTATCCAAA
SmilChr01G002312 Chr01 NC_080387.1:40112744-40112758promoter 内 2402-2416 bp - 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 40109167-40111159(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGTGGATAAGACTTT
SmilChr01G000184 Chr01 NC_080387.1:3165129-3165143promoter 内 2376-2390 bp - 1611 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 3166754-3167811(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATTCTTATCCCCA
SmilChr01G001249 Chr01 NC_080387.1:25049282-25049296promoter 内 2180-2194 bp + 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 25045339-25047475(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTACCTTATCTAAA
SmilChr02G001045 Chr02 NC_080388.1:18510812-18510826promoter 内 2147-2161 bp - 1840 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 18507736-18508972(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTGGATAAGGTTAA
SmilChr01G004141 Chr01 NC_080387.1:59913639-59913653promoter 内 1900-1914 bp + 2087 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 59900126-59911552(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTCTCCTTATCCACT
SmilChr01G002652 Chr01 NC_080387.1:44839509-44839523promoter 内 1843-1857 bp + 2144 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 44837282-44837365(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CAAACCTTATCCTTG
SmilChr01G004579 Chr01 NC_080387.1:63848151-63848165promoter 内 1183-1197 bp - 2804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 63843623-63845347(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGATCAG
SmilChr01G000146 Chr01 NC_080387.1:2491876-2491890promoter 内 942-956 bp - 3045 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 2494935-2498868(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GCGACCTTATCCTAA
SmilChr02G001110 Chr02 NC_080388.1:19983068-19983082promoter 内 901-915 bp + 3086 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 19976745-19979982(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTTCCTTATCTACA
SmilChr01G001634 Chr01 NC_080387.1:30400701-30400715promoter 内 806-820 bp + 3181 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 30392990-30397520(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CACACCTTATCCCAT
SmilChr01G003812 Chr01 NC_080387.1:56497652-56497666promoter 内 626-640 bp - 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 56492209-56494291(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGGCGTT
SmilChr01G000746 Chr01 NC_080387.1:16506567-16506581promoter 内 525-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 2 16510043-16513220(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAGGGATAAGGTATT
SmilChr02G001460 Chr02 NC_080388.1:27301557-27301571promoter 内 3712-3726 bp + 275 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 27299186-27301282(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATTCCTTATCCCCA
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SmilChr01G005814 Chr01 NC_080387.1:74138289-74138303promoter 内 3072-3086 bp - 915 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 74139218-74141307(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAACCCTTATCCATT
SmilChr01G005920 Chr01 NC_080387.1:75033019-75033033promoter 内 2886-2900 bp - 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 75030558-75031918(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGGCGTT
SmilChr01G005813 Chr01 NC_080387.1:74138289-74138303promoter 内 2503-2517 bp - 1484 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 74130223-74136805(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAAGGGTTT
SmilChr01G006067 Chr01 NC_080387.1:76075775-76075789promoter 内 2422-2436 bp - 1565 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 76077354-76078168(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CGTATCTTATCCACT
SmilChr01G005789 Chr01 NC_080387.1:73986499-73986513promoter 内 2265-2279 bp + 1722 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 73988235-73992518(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGATTCA
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SmilChr02G003118 Chr02 NC_080388.1:52208654-52208668promoter 内 2100-2114 bp + 1887 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 52204851-52206767(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CACGCCTTATCCAAA
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SmilChr03G000712 Chr03 NC_080389.1:7912551-7912565promoter 内 1916-1930 bp - 2071 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 7914636-7917421(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGTCTTATCCACT
SmilChr01G005959 Chr01 NC_080387.1:75303252-75303266promoter 内 1610-1624 bp + 2377 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 75305643-75308359(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGGCGTT
SmilChr02G002195 Chr02 NC_080388.1:39165273-39165287promoter 内 1465-1479 bp + 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 39161798-39162751(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGCCTTATCCAAA
SmilChr02G001683 Chr02 NC_080388.1:31070737-31070751promoter 内 748-762 bp - 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 31066005-31067498(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGAAGA
SmilChr02G001580 Chr02 NC_080388.1:29523554-29523568promoter 内 733-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 29518751-29520300(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATCTCCTTATCCATT
SmilChr01G003117 Chr01 NC_080387.1:49973336-49973350promoter 内 564-578 bp - 3423 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 49967805-49969913(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAAGGAGGA
SmilChr01G005815 Chr01 NC_080387.1:74138289-74138303promoter 内 396-410 bp - 3591 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 74141894-74144092(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAACCCTTATCCATT
SmilChr01G005021 Chr01 NC_080387.1:68197948-68197962promoter 内 241-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 68190795-68194202(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAAGATAAGGTGGA
SmilChr02G004230 Chr02 NC_080388.1:64494693-64494707promoter 内 80-94 bp + 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 64498614-64500758(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGGCGTT
SmilChr02G004325 Chr02 NC_080388.1:65548925-65548939promoter 内 16-30 bp - 3971 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 65542733-65544954(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAGGATAAGGATTC
SmilChr01G002162 Chr01 NC_080387.1:37628459-37628473promoter 内 2793-2807 bp - 1194 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 37629667-37631655(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACTATCTTATCCTTA
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SmilChr01G003521 Chr01 NC_080387.1:53851478-53851492promoter 内 3881-3895 bp - 106 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 53851598-53855012(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGCCTTATCCCAA
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SmilChr02G005233 Chr02 NC_080388.1:73535403-73535417promoter 内 2543-2557 bp - 1444 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 73532384-73533959(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAAGGGTTA
SmilChr02G000770 Chr02 NC_080388.1:12672594-12672608promoter 内 2495-2509 bp - 1492 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 12674100-12676684(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAATCCTTATCCCTA
SmilChr03G000821 Chr03 NC_080389.1:9413003-9413017promoter 内 2097-2111 bp - 1890 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 9405709-9411113(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAGGGATAAGGATTT
SmilChr01G005272 Chr01 NC_080387.1:70156624-70156638promoter 内 1917-1931 bp + 2070 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 70158708-70159433(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAGGATAAGATAGT
SmilChr02G002737 Chr02 NC_080388.1:47300852-47300866promoter 内 423-437 bp + 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 47304430-47306172(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATAGATAAGGTAAA
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SmilChr01G002249 Chr01 NC_080387.1:39104358-39104372promoter 内 2845-2859 bp + 1142 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 39105514-39107684(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAAGGATAAGATGTG
SmilChr02G001865 Chr02 NC_080388.1:33882897-33882911promoter 内 2631-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 33884267-33884842(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GCAACCTTATCCCGT
SmilChr02G001294 Chr02 NC_080388.1:23883890-23883904promoter 内 2511-2525 bp - 1476 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 23881556-23882414(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGTGGATAAGGAGGC