转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 111 / 143 下载 TSV

上一页 111 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G000015 Chr01 NC_080387.1:310824-310835promoter 内 1210-1221 bp + 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 304530-308044(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACC
SmilChr02G004875 Chr02 NC_080388.1:70831538-70831549promoter 内 1171-1182 bp + 2819 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70834368-70838535(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTC
SmilChr06G000931 Chr06 NC_080392.1:8835445-8835456promoter 内 1050-1061 bp + 2940 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 8830083-8832505(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGAACTGTCAA
SmilChr03G004577 Chr03 NC_080389.1:63664519-63664530promoter 内 1038-1049 bp + 2952 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 63658036-63661567(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTCAGCTGTTAT
SmilChr02G004400 Chr02 NC_080388.1:66347346-66347357promoter 内 1028-1039 bp - 2962 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 66341746-66344384(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACACCAGCTGTG
SmilChr08G002818 Chr08 NC_080394.1:27998482-27998493promoter 内 1022-1033 bp + 2968 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 28001461-28004516(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGAA
SmilChr06G002588 Chr06 NC_080392.1:37089699-37089710promoter 内 919-930 bp + 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 37082597-37086628(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCCG
SmilChr08G000498 Chr08 NC_080394.1:3646243-3646254promoter 内 869-880 bp + 3121 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3641259-3643122(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCCC
SmilChr01G004517 Chr01 NC_080387.1:63297271-63297282promoter 内 844-855 bp - 3146 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 63300428-63304872(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTTAGCTGTCCA
SmilChr05G000028 Chr05 NC_080391.1:137865-137876promoter 内 724-735 bp + 3266 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 141142-141837(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr04G001312 Chr04 NC_080390.1:20958758-20958769promoter 内 653-664 bp + 3337 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 20962106-20967363(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATACAGCTGAT
SmilChr06G002802 Chr06 NC_080392.1:40732189-40732200promoter 内 562-573 bp + 3428 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 40735628-40741086(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTAAG
SmilChr05G001855 Chr05 NC_080391.1:18576858-18576869promoter 内 426-437 bp + 3564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 18580433-18581610(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTAAT
SmilChr06G000255 Chr06 NC_080392.1:1682875-1682886promoter 内 362-373 bp - 3628 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1686514-1690663(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACA
SmilChr02G000420 Chr02 NC_080388.1:5321356-5321367promoter 内 348-359 bp + 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5325009-5328111(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTC
SmilChr08G003228 Chr08 NC_080394.1:33208641-33208652promoter 内 326-337 bp + 3664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 33203623-33204977(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACC
SmilChr07G002715 Chr07 NC_080393.1:26620162-26620173promoter 内 300-311 bp + 3690 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 26612754-26616472(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGTGT
SmilChr06G002545 Chr06 NC_080392.1:36518320-36518331promoter 内 268-279 bp + 3722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 36513644-36514598(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTC
SmilChr03G001941 Chr03 NC_080389.1:27634010-27634021promoter 内 236-247 bp - 3754 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 27621750-27630256(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTAAA
SmilChr03G003507 Chr03 NC_080389.1:53666718-53666729promoter 内 169-180 bp + 3821 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 53670550-53673864(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGTACAGCTGAG
SmilChr02G000009 Chr02 NC_080388.1:66514-66525promoter 内 96-107 bp + 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 70419-73585(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGTACAGCTGAA
SmilChr05G001874 Chr05 NC_080391.1:18962341-18962352promoter 内 3111-3122 bp + 879 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 3 18959891-18961462(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGT
SmilChr05G001308 Chr05 NC_080391.1:11295641-11295652promoter 内 1895-1906 bp - 2095 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 11289311-11293546(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACACCAGCTGTT
SmilChr05G001134 Chr05 NC_080391.1:9470275-9470286promoter 内 1860-1871 bp - 2130 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 9472416-9475494(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCTA
SmilChr06G000272 Chr06 NC_080392.1:1846006-1846017promoter 内 1259-1270 bp + 2731 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 2 1848748-1849647(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACACCAGCTGTT
SmilChr07G001572 Chr07 NC_080393.1:12964956-12964967promoter 内 3892-3903 bp - 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 12959426-12964858(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACACCAGCTGTT
SmilChr08G002677 Chr08 NC_080394.1:26293472-26293483promoter 内 3887-3898 bp + 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 26291658-26293369(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGA
SmilChr05G003645 Chr05 NC_080391.1:48877494-48877505promoter 内 3803-3814 bp - 187 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 48877692-48881740(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGT
SmilChr06G002881 Chr06 NC_080392.1:41628735-41628746promoter 内 3654-3665 bp - 336 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 41620616-41628399(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTGAG
SmilChr07G002269 Chr07 NC_080393.1:20924114-20924125promoter 内 3440-3451 bp - 550 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20921590-20923564(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCAA
SmilChr08G000843 Chr08 NC_080394.1:6234568-6234579promoter 内 3379-3390 bp - 611 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 6235190-6237674(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTACT
SmilChr03G002693 Chr03 NC_080389.1:42897544-42897555promoter 内 3354-3365 bp - 636 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 42898191-42899268(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCTA
SmilChr01G003543 Chr01 NC_080387.1:54018081-54018092promoter 内 3249-3260 bp + 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 54014397-54017340(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGT
SmilChr06G000977 Chr06 NC_080392.1:9534923-9534934promoter 内 3099-3110 bp - 891 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 9532933-9534032(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACACCAGCTGTT
SmilChr07G001381 Chr07 NC_080393.1:10728888-10728899promoter 内 3098-3109 bp - 892 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 10721292-10727996(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTGCA
SmilChr05G004191 Chr05 NC_080391.1:55799162-55799173promoter 内 3068-3079 bp + 922 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 55800095-55801136(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTCAA
SmilChr06G001251 Chr06 NC_080392.1:13005241-13005252promoter 内 2926-2937 bp - 1064 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 13002075-13004177(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTAAG
SmilChr07G000705 Chr07 NC_080393.1:4884924-4884935promoter 内 2853-2864 bp + 1137 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 4881813-4883787(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGT
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SmilChr03G004166 Chr03 NC_080389.1:60421730-60421741promoter 内 2710-2721 bp - 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 60423021-60429410(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGCAGCTGTCGA
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SmilChr07G002270 Chr07 NC_080393.1:20924114-20924125promoter 内 2486-2497 bp - 1504 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 20925629-20930583(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCCG
SmilChr02G000608 Chr02 NC_080388.1:8878291-8878302promoter 内 2479-2490 bp - 1511 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 8871483-8876780(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAAA
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SmilChr02G002576 Chr02 NC_080388.1:44815643-44815654promoter 内 2329-2340 bp - 1661 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44817315-44817967(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCACCTGTCAA
SmilChr06G003171 Chr06 NC_080392.1:44657097-44657108promoter 内 2005-2016 bp + 1985 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 44653486-44655112(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGGTGT
SmilChr02G002123 Chr02 NC_080388.1:37998474-37998485promoter 内 1961-1972 bp + 2029 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 38000514-38005590(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGTACAGCTGAA
SmilChr07G002653 Chr07 NC_080393.1:25698158-25698169promoter 内 1925-1936 bp - 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.7/ 100 1 25700234-25701354(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCACCTGTCAA