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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 117 / 133 下载 TSV

上一页 117 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G005703 Chr01 NC_080387.1:73270733-73270747promoter 内 438-452 bp + 3549 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 73274296-73277234(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAACACCAT
SmilChr01G005253 Chr01 NC_080387.1:70034881-70034895promoter 内 413-427 bp - 3574 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 70038469-70041225(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GAATCCTTATCATGT
SmilChr02G000484 Chr02 NC_080388.1:6600212-6600226promoter 内 314-328 bp + 3673 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 6603899-6605266(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAAGAAGT
SmilChr01G002117 Chr01 NC_080387.1:37196952-37196966promoter 内 298-312 bp - 3689 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 37189801-37193263(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAACTTAGT
SmilChr03G000254 Chr03 NC_080389.1:2991511-2991525promoter 内 259-273 bp - 3728 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 2995253-2997060(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTGAGCTTATCCAAG
SmilChr01G003554 Chr01 NC_080387.1:54174556-54174570promoter 内 257-271 bp - 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 54178300-54179238(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTCAGCTTATCCCTC
SmilChr03G001128 Chr03 NC_080389.1:13031526-13031540promoter 内 177-191 bp + 3810 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 13035350-13046051(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAAATTCG
SmilChr03G000262 Chr03 NC_080389.1:3054774-3054788promoter 内 153-167 bp - 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 3049996-3050940(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTGGATAAGCTCAC
SmilChr03G001235 Chr03 NC_080389.1:14262301-14262315promoter 内 123-137 bp - 3864 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 14266179-14266935(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAAAATTATCCATT
SmilChr01G004359 Chr01 NC_080387.1:61775608-61775622promoter 内 112-126 bp + 3875 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 61779497-61785042(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAATTTTAT
SmilChr02G002408 Chr02 NC_080388.1:42036412-42036426promoter 内 76-90 bp + 3911 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 42040337-42042488(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGGCGATAAGGTTCT
SmilChr01G004577 Chr01 NC_080387.1:63815617-63815631promoter 内 68-82 bp + 3919 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 63806068-63811698(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAAAATTATCCATT
SmilChr01G003783 Chr01 NC_080387.1:56212844-56212858promoter 内 27-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 56216818-56219149(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTGGATAAGCTACT
SmilChr01G001180 Chr01 NC_080387.1:23853203-23853217promoter 内 7-21 bp - 3980 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 23848331-23849223(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAATTTTAT
SmilChr03G000626 Chr03 NC_080389.1:6944957-6944971promoter 内 3591-3605 bp + 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 6936230-6944561(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATCCATTATCCATT
SmilChr01G002680 Chr01 NC_080387.1:44995927-44995941promoter 内 3561-3575 bp + 426 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 44996367-44998325(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAATTTTGT
SmilChr01G005748 Chr01 NC_080387.1:73560001-73560015promoter 内 3297-3311 bp + 690 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 73560705-73564959(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAATTTTTT
SmilChr01G006132 Chr01 NC_080387.1:76844778-76844792promoter 内 3285-3299 bp + 702 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 76837515-76844076(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GAACTGTTATCCAAT
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SmilChr01G005744 Chr01 NC_080387.1:73535715-73535729promoter 内 672-686 bp + 3315 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 73539044-73541642(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAAGAAAT
SmilChr02G004300 Chr02 NC_080388.1:65379241-65379255promoter 内 478-492 bp - 3509 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 2 65373806-65375732(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAAATAAT
SmilChr01G004837 Chr01 NC_080387.1:66509357-66509371promoter 内 3930-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 66502369-66509300(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAAAGATTC
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SmilChr01G002235 Chr01 NC_080387.1:38878958-38878972promoter 内 3777-3791 bp + 210 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 38879182-38881841(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGTGGATAAAAATTA
SmilChr01G002959 Chr01 NC_080387.1:48464469-48464483promoter 内 3752-3766 bp + 235 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 48457651-48464234(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTACTATTATCCATT
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SmilChr02G000757 Chr02 NC_080388.1:12343424-12343438promoter 内 3572-3586 bp - 415 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 12340144-12343009(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAACAACTA
SmilChr01G003256 Chr01 NC_080387.1:51266305-51266319promoter 内 3503-3517 bp - 484 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51262243-51265821(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAATACCAA
SmilChr01G002685 Chr01 NC_080387.1:45056536-45056550promoter 内 3502-3516 bp + 485 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 45057035-45058846(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAATTTTGT
SmilChr02G001469 Chr02 NC_080388.1:27423246-27423260promoter 内 3460-3474 bp + 527 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 27420157-27422719(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTATTTTATCCATA
SmilChr01G005050 Chr01 NC_080387.1:68447215-68447229promoter 内 3402-3416 bp - 585 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 68447814-68451121(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGATTATTATCCAAA
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SmilChr02G003096 Chr02 NC_080388.1:51832948-51832962promoter 内 3264-3278 bp - 723 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 51829447-51832225(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTGGGATAAGCAGCT
SmilChr02G002191 Chr02 NC_080388.1:39140581-39140595promoter 内 3250-3264 bp + 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 39136070-39139844(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAACCCTTATCTCTC
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SmilChr01G005771 Chr01 NC_080387.1:73793044-73793058promoter 内 3228-3242 bp + 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 73789264-73792285(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATCCCTTATCTTAG
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SmilChr02G003806 Chr02 NC_080388.1:59681125-59681139promoter 内 3068-3082 bp - 919 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 59678296-59680206(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTAAGATAAGGGATT
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SmilChr01G005387 Chr01 NC_080387.1:71164068-71164082promoter 内 2792-2806 bp + 1195 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 71165277-71171837(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATGGATAATGATAA
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SmilChr01G003733 Chr01 NC_080387.1:55627224-55627238promoter 内 2637-2651 bp - 1350 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.6/ 100 1 55618087-55625874(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AACTGATAAGGATTA