Red Sage Omics 丹参基因组信息平台
首页 基因查询 ID 对照表 功能注释 结构域预测 Pfam 基因组工具 蛋白互作 亚细胞定位 表达量 共表达 同源/共线性 GO/KEGG 注释 TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变 JBrowse BLAST 下载 关于 帮助
数据资源
ID 对照表 功能注释 功能检索 次生代谢专题 文献证据 结构域预测 Pfam 同源/共线性
分析工具
基因组工具 引物设计 同源重组引物设计 核酸翻译 BLAST 蛋白互作 亚细胞定位 共表达 GO/KEGG 注释 功能检索
调控/突变
TF 结合位点 TF 靶基因 EMS 突变
帮助
关于 帮助 资源与版本
中文 EN

转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因，每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G000943; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008897-RA_Salv SmilChr01G000943 MIKC_MADS XP_057790035.1 MP00508 CTTTCCTTTTTTGGAAAGT

可能结合的靶基因

7481 个结合位点 5979 个候选靶基因 第 119 / 120 下载 TSV

上一页 119 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003169 Chr02 NC_080388.1:52707261-52707279promoter 内 2649-2667 bp - 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 52708613-52716242(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAGT
SmilChr07G002266 Chr07 NC_080393.1:20863357-20863375promoter 内 2641-2659 bp - 1342 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 20858608-20862015(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AATTCTTGTTTTGGAATCT
SmilChr01G004962 Chr01 NC_080387.1:67708073-67708091promoter 内 2588-2606 bp - 1395 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 67705505-67706678(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCCTTATTTATAAACA
SmilChr05G003722 Chr05 NC_080391.1:50334777-50334795promoter 内 2465-2483 bp + 1518 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 50329052-50333259(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTACTATATAAGGAAAT
SmilChr08G004499 Chr08 NC_080394.1:54613427-54613445promoter 内 2435-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 54614993-54615295(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CGTACTATTTTAGGAAAGT
SmilChr01G005848 Chr01 NC_080387.1:74434765-74434783promoter 内 2419-2437 bp - 1564 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 74436347-74437790(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CGATTCCAAATCAGGTAAA
SmilChr05G001862 Chr05 NC_080391.1:18651653-18651671promoter 内 2381-2399 bp - 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 18653273-18658004(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTACCACAAAAGGAATT
SmilChr08G000242 Chr08 NC_080394.1:1676954-1676972promoter 内 2322-2340 bp + 1661 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 1667654-1675293(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATAAACCAAAAAAAGAAAC
SmilChr04G001310 Chr04 NC_080390.1:20961660-20961678promoter 内 2290-2308 bp + 1693 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 20958065-20959967(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ACAATCCAAAACGAGAAAC
SmilChr02G004583 Chr02 NC_080388.1:68330044-68330062promoter 内 2257-2275 bp + 1726 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 68312853-68328318(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTGAATAAGGAAAC
SmilChr02G003896 Chr02 NC_080388.1:61055073-61055091promoter 内 2252-2270 bp - 1731 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 61050395-61053342(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTTGATAAAGA
SmilChr01G004575 Chr01 NC_080387.1:63799512-63799530promoter 内 2144-2162 bp + 1839 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 63793365-63797673(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AGGTTCTCAAAAAGGTAAT
SmilChr03G001959 Chr03 NC_080389.1:28083704-28083722promoter 内 2058-2076 bp + 1925 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 28080979-28081779(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AATGTCCAAAAATGGCAAA
SmilChr08G001081 Chr08 NC_080394.1:8325396-8325414promoter 内 2049-2067 bp + 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 8318054-8323462(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TGTTGCCAAAAAAAGGAAT
SmilChr06G001499 Chr06 NC_080392.1:16056941-16056959promoter 内 1918-1936 bp - 2065 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 16050764-16054876(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AATTCTGCTTTTGGAAAAT
SmilChr08G004553 Chr08 NC_080394.1:55108010-55108028promoter 内 1838-1856 bp - 2145 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 55110173-55111173(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTTACCAAAAATAGACAG
SmilChr07G002750 Chr07 NC_080393.1:27036191-27036209promoter 内 1834-1852 bp - 2149 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 27031940-27034042(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AATTCCAATTTTGGAATAT
SmilChr05G001029 Chr05 NC_080391.1:8442842-8442860promoter 内 1792-1810 bp - 2191 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 8445051-8448787(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATCTCCCAAAAATGGCAAC
SmilChr05G003339 Chr05 NC_080391.1:43836820-43836838promoter 内 1787-1805 bp + 2196 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 43839034-43842514(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTACCTTTTTGGTAAAAA
SmilChr08G000582 Chr08 NC_080394.1:4261561-4261579promoter 内 1720-1738 bp + 2263 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 4257237-4259298(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AGTTTCCAAAAGTGGATTT
SmilChr05G003129 Chr05 NC_080391.1:39914833-39914851promoter 内 1657-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 39917177-39925436(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTTCTCATTTTGGATACC
SmilChr05G000259 Chr05 NC_080391.1:1985848-1985866promoter 内 1616-1634 bp + 2367 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 1988233-1990750(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTACCCTTTTTGGATTGG
SmilChr06G000056 Chr06 NC_080392.1:444547-444565promoter 内 1377-1395 bp + 2606 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 447171-452585(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTGCTATTTTTGGAATCA
SmilChr01G001549 Chr01 NC_080387.1:29479810-29479828promoter 内 1057-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 29472855-29476884(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ACTACCTTATTTGGAAATG
SmilChr03G001960 Chr03 NC_080389.1:28083704-28083722promoter 内 1016-1034 bp + 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 28086689-28096713(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTGCCATTTTTGGACATT
SmilChr08G000793 Chr08 NC_080394.1:5833793-5833811promoter 内 981-999 bp - 3002 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 5836813-5839530(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CATTTCCAAATAAGGTAGT
SmilChr04G000070 Chr04 NC_080390.1:631967-631985promoter 内 863-881 bp - 3120 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 635105-640305(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AACATCCAAATAAGGAAAA
SmilChr04G003497 Chr04 NC_080390.1:51385152-51385170promoter 内 771-789 bp - 3212 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 51388382-51391111(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTTTACCAAAAAGGCAAC
SmilChr02G004497 Chr02 NC_080388.1:67456227-67456245promoter 内 742-760 bp - 3241 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 67459486-67477871(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AAAACCCCAAAAAGGAAAA
SmilChr02G001604 Chr02 NC_080388.1:29875875-29875893promoter 内 738-756 bp + 3245 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 29879138-29879524(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTCCTTTTTTTGGCAACA
SmilChr08G001082 Chr08 NC_080394.1:8325396-8325414promoter 内 707-725 bp + 3276 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 8328690-8329433(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTCCTTTTTTTGGCAACA
SmilChr04G001276 Chr04 NC_080390.1:20288328-20288346promoter 内 634-652 bp - 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 20291695-20292501(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATATCCCAAAAAGAGAAAA
SmilChr03G004070 Chr03 NC_080389.1:59685103-59685121promoter 内 619-637 bp - 3364 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 59680409-59681739(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCTTGATTTGGAAGTG
SmilChr06G000196 Chr06 NC_080392.1:1354543-1354561promoter 内 489-507 bp - 3494 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 1348396-1351049(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CGTACTATTTTAGGAAAGT
SmilChr08G000672 Chr08 NC_080394.1:4992329-4992347promoter 内 390-408 bp - 3593 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 4984837-4988736(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTATTTGGAGAAA
SmilChr05G003723 Chr05 NC_080391.1:50334777-50334795promoter 内 330-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 50338448-50340924(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ATTTCCTTATATAGTAAAA
SmilChr07G003646 Chr07 NC_080393.1:43252361-43252379promoter 内 140-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.1/ 100 1 43246760-43248518(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCCTTTTCTGGCTTCG
SmilChr01G004724 Chr01 NC_080387.1:65429960-65429978promoter 内 3904-3922 bp + 79 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 65426068-65429881(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ACGTCCCAAAAAAAGAAAA
SmilChr05G001461 Chr05 NC_080391.1:13335526-13335544promoter 内 3897-3915 bp - 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 13335630-13340101(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GACAACCCGAAAAGGAAAG
SmilChr01G003602 Chr01 NC_080387.1:54571500-54571518promoter 内 3821-3839 bp + 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 54571680-54573014(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTTCCTTTAGGGGAAATA
SmilChr08G001008 Chr08 NC_080394.1:7585044-7585062promoter 内 3821-3839 bp - 162 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 7585224-7588042(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 AATTTCCAAAAAAGGCTAT
SmilChr06G000743 Chr06 NC_080392.1:6901663-6901681promoter 内 3727-3745 bp - 256 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 6900070-6901407(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCTATTTTTGGACAAC
SmilChr07G003149 Chr07 NC_080393.1:33399480-33399498promoter 内 3717-3735 bp - 266 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 33389761-33399214(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCCTTTTTGGGCGTTC
SmilChr02G003004 Chr02 NC_080388.1:50690848-50690866promoter 内 3684-3702 bp - 299 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 50689365-50690549(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GTTTCCTTTAGGGGAAATA
SmilChr07G003130 Chr07 NC_080393.1:33218197-33218215promoter 内 3632-3650 bp - 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 33208466-33217846(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCCTTTTTGGGCGTTC
SmilChr03G003633 Chr03 NC_080389.1:55007555-55007573promoter 内 3558-3576 bp + 425 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 55007998-55009489(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCTATTTTTGGACAAC
SmilChr06G001629 Chr06 NC_080392.1:18229056-18229074promoter 内 2991-3009 bp - 992 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 18218045-18228064(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 CTTTCCTTTTTAATAAAAT
SmilChr04G002188 Chr04 NC_080390.1:35386347-35386365promoter 内 2923-2941 bp - 1060 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 35379602-35385287(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 TTTTCCTTTTTTGGACGTC
SmilChr01G004370 Chr01 NC_080387.1:61897546-61897564promoter 内 2873-2891 bp + 1110 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 61898674-61900356(+) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 ACTTCCTGATTTGGAAGCA
SmilChr05G001075 Chr05 NC_080391.1:8942173-8942191promoter 内 2683-2701 bp + 1300 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.0/ 100 1 8939476-8940873(-) SMil_00008897-RA_Salv MP00508 GGAATCCAAAAATAGAAAT