转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 119 / 136 下载 TSV

上一页 119 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000884 Chr06 NC_080392.1:8395054-8395064promoter 内 3654-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 8389397-8394717(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr01G000049 Chr01 NC_080387.1:769346-769356promoter 内 3598-3608 bp - 393 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 769749-772394(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGCCG
SmilChr01G000153 Chr01 NC_080387.1:2596390-2596400promoter 内 3547-3557 bp + 444 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 2596844-2599067(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AATTCAGCGCG
SmilChr03G000201 Chr03 NC_080389.1:2282195-2282205promoter 内 3513-3523 bp + 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 2282683-2287094(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr03G000198 Chr03 NC_080389.1:2259511-2259521promoter 内 3488-3498 bp - 503 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 2260024-2265235(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGTT
SmilChr04G001563 Chr04 NC_080390.1:25942583-25942593promoter 内 3467-3477 bp + 524 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 25941443-25942059(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr03G003223 Chr03 NC_080389.1:49900980-49900990promoter 内 3453-3463 bp + 538 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 49899621-49900442(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCT
SmilChr01G003291 Chr01 NC_080387.1:51607888-51607898promoter 内 3436-3446 bp + 555 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 51604540-51607333(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAACT
SmilChr07G003922 Chr07 NC_080393.1:49521987-49521997promoter 内 3418-3428 bp - 573 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 49522570-49526791(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGTT
SmilChr03G002660 Chr03 NC_080389.1:42263868-42263878promoter 内 3351-3361 bp + 640 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 42264518-42265742(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGAC
SmilChr07G000862 Chr07 NC_080393.1:6141697-6141707promoter 内 3330-3340 bp - 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 6142368-6143992(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr03G003405 Chr03 NC_080389.1:52406229-52406239promoter 内 3258-3268 bp + 733 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 52406972-52407911(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AATTCAGCGCG
SmilChr03G001570 Chr03 NC_080389.1:19832795-19832805promoter 内 3247-3257 bp - 744 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 19833549-19836442(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGCCG
SmilChr08G004021 Chr08 NC_080394.1:48649380-48649390promoter 内 3242-3252 bp - 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 48647032-48648631(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGCCAGCGCG
SmilChr04G000142 Chr04 NC_080390.1:1212782-1212792promoter 内 3236-3246 bp + 755 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 1210995-1212027(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr04G001502 Chr04 NC_080390.1:24626490-24626500promoter 内 3226-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 24627265-24628260(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCACT
SmilChr07G001188 Chr07 NC_080393.1:9024975-9024985promoter 内 3204-3214 bp - 787 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 9025772-9027352(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr04G000105 Chr04 NC_080390.1:931673-931683promoter 内 3143-3153 bp + 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 932531-938147(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGCCAGCGCG
SmilChr04G001623 Chr04 NC_080390.1:26999555-26999565promoter 内 3116-3126 bp - 875 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 26994654-26998680(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AATTCAGCGCG
SmilChr01G002998 Chr01 NC_080387.1:48930298-48930308promoter 内 3103-3113 bp + 888 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 48927161-48929410(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATT
SmilChr08G004674 Chr08 NC_080394.1:56239916-56239926promoter 内 3097-3107 bp + 894 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 56232203-56239022(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGTT
SmilChr01G005441 Chr01 NC_080387.1:71520508-71520518promoter 内 3079-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 71521430-71523973(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr03G003023 Chr03 NC_080389.1:47142569-47142579promoter 内 3077-3087 bp - 914 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 47138749-47141655(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCGT
SmilChr01G000043 Chr01 NC_080387.1:706848-706858promoter 内 3075-3085 bp - 916 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 707774-710491(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGCCG
SmilChr04G001194 Chr04 NC_080390.1:18274274-18274284promoter 内 3071-3081 bp + 920 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 18275204-18281066(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr08G004677 Chr08 NC_080394.1:56264616-56264626promoter 内 3055-3065 bp + 936 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 56265562-56266599(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGTT
SmilChr07G001597 Chr07 NC_080393.1:13307342-13307352promoter 内 3049-3059 bp + 942 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 13304745-13306400(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATT
SmilChr04G000196 Chr04 NC_080390.1:1745341-1745351promoter 内 3033-3043 bp - 958 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 1742191-1744383(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACACAGCGCG
SmilChr08G003638 Chr08 NC_080394.1:39709979-39709989promoter 内 3006-3016 bp - 985 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 39710974-39712523(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GTCGCTGAGTC
SmilChr04G001141 Chr04 NC_080390.1:16814541-16814551promoter 内 3000-3010 bp + 991 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 16808700-16813550(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr06G001842 Chr06 NC_080392.1:21619770-21619780promoter 内 2985-2995 bp - 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 21620786-21622113(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGGCTGAGCT
SmilChr05G001559 Chr05 NC_080391.1:14297163-14297173promoter 内 2984-2994 bp - 1007 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 14288871-14296156(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr01G001159 Chr01 NC_080387.1:23564848-23564858promoter 内 2975-2985 bp + 1016 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 23562783-23563832(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATT
SmilChr07G003144 Chr07 NC_080393.1:33338548-33338558promoter 内 2969-2979 bp + 1022 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 33339580-33342511(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr01G000551 Chr01 NC_080387.1:11463844-11463854promoter 内 2930-2940 bp - 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 11464915-11488037(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATT
SmilChr05G001616 Chr05 NC_080391.1:14939341-14939351promoter 内 2890-2900 bp + 1101 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 14937506-14938240(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGTGCTGAGCT
SmilChr02G001189 Chr02 NC_080388.1:21831994-21832004promoter 内 2886-2896 bp + 1105 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 21827397-21830889(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr07G000171 Chr07 NC_080393.1:1068041-1068051promoter 内 2875-2885 bp + 1116 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 1069167-1072661(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AATTCAGCGCG
SmilChr02G003944 Chr02 NC_080388.1:61588292-61588302promoter 内 2866-2876 bp - 1125 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 61589427-61591159(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr02G001675 Chr02 NC_080388.1:31003487-31003497promoter 内 2848-2858 bp - 1143 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 30999605-31002344(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACTCAGCGAC
SmilChr08G002343 Chr08 NC_080394.1:22121565-22121575promoter 内 2841-2851 bp - 1150 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 22122725-22127167(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGCCG
SmilChr05G003140 Chr05 NC_080391.1:40010610-40010620promoter 内 2838-2848 bp - 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 40011773-40022714(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAACT
SmilChr07G003180 Chr07 NC_080393.1:33871282-33871292promoter 内 2838-2848 bp - 1153 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 33872445-33876152(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGGCTGAGCT
SmilChr07G002141 Chr07 NC_080393.1:19581600-19581610promoter 内 2815-2825 bp - 1176 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 19582786-19586814(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr06G000771 Chr06 NC_080392.1:7208842-7208852promoter 内 2783-2793 bp - 1208 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 7202815-7207634(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCTCAGCCTC
SmilChr06G000651 Chr06 NC_080392.1:5751188-5751198promoter 内 2765-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 5749010-5749962(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GAGGCTGAGCT
SmilChr08G003974 Chr08 NC_080394.1:47753140-47753150promoter 内 2758-2768 bp - 1233 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 47754383-47755555(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAACT
SmilChr07G004421 Chr07 NC_080393.1:56826347-56826357promoter 内 2711-2721 bp - 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 56827637-56832521(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAATT
SmilChr02G002101 Chr02 NC_080388.1:37686165-37686175promoter 内 2699-2709 bp + 1292 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 37679729-37684873(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACGGCTGAGCT
SmilChr02G003126 Chr02 NC_080388.1:52290544-52290554promoter 内 2683-2693 bp - 1308 bp 位于靶基因 TSS 上游 90.7/ 100 1 52291862-52296540(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGTT