转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 122 / 143 下载 TSV

上一页 122 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G003082 Chr07 NC_080393.1:32477971-32477982promoter 内 2001-2012 bp - 1989 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 32479971-32482009(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGC
SmilChr02G003428 Chr02 NC_080388.1:55512777-55512788promoter 内 1886-1897 bp - 2104 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 55508429-55510673(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCT
SmilChr06G001400 Chr06 NC_080392.1:14627981-14627992promoter 内 670-681 bp + 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 14631312-14634331(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr06G001363 Chr06 NC_080392.1:14197993-14198004promoter 内 659-670 bp + 3331 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 14201335-14204306(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr08G003620 Chr08 NC_080394.1:39369142-39369153promoter 内 259-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 2 39372884-39374161(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCAACAGCTGTG
SmilChr05G002063 Chr05 NC_080391.1:21498868-21498879promoter 内 3968-3979 bp - 22 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 21498901-21501328(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTT
SmilChr08G000777 Chr08 NC_080394.1:5731000-5731011promoter 内 3932-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5731069-5732410(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTAGCTGTCCT
SmilChr06G001503 Chr06 NC_080392.1:16073847-16073858promoter 内 3925-3936 bp + 65 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 16073923-16075465(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CATACAGCTGAC
SmilChr06G003046 Chr06 NC_080392.1:43324405-43324416promoter 内 3771-3782 bp - 219 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43321450-43324186(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGTG
SmilChr04G003110 Chr04 NC_080390.1:47650204-47650215promoter 内 3739-3750 bp + 251 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 47649000-47649953(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTAGCTGTCTT
SmilChr02G002520 Chr02 NC_080388.1:43779172-43779183promoter 内 3639-3650 bp + 351 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 43776311-43778821(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr04G000223 Chr04 NC_080390.1:1984234-1984245promoter 内 3551-3562 bp - 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 1980293-1983795(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAAG
SmilChr08G000800 Chr08 NC_080394.1:5871822-5871833promoter 内 3497-3508 bp - 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 5872326-5872779(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr08G001274 Chr08 NC_080394.1:10152708-10152719promoter 内 3466-3477 bp - 524 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 10153243-10155372(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr06G002072 Chr06 NC_080392.1:27333843-27333854promoter 内 3426-3437 bp - 564 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 27334418-27335066(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr02G002046 Chr02 NC_080388.1:36865071-36865082promoter 内 3425-3436 bp - 565 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36865647-36866610(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr05G001416 Chr05 NC_080391.1:12793414-12793425promoter 内 3409-3420 bp - 581 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12790333-12792833(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAT
SmilChr06G001399 Chr06 NC_080392.1:14627981-14627992promoter 内 3391-3402 bp + 599 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 14628591-14630720(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr05G000898 Chr05 NC_080391.1:7105137-7105148promoter 内 3340-3351 bp + 650 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7105798-7107220(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr05G000963 Chr05 NC_080391.1:7774065-7774076promoter 内 3330-3341 bp + 660 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 7774736-7776203(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr03G003744 Chr03 NC_080389.1:56494284-56494295promoter 内 3199-3210 bp - 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56490544-56493493(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCT
SmilChr03G003745 Chr03 NC_080389.1:56505576-56505587promoter 内 3199-3210 bp - 791 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 56501836-56504785(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCT
SmilChr07G003035 Chr07 NC_080393.1:31378409-31378420promoter 内 3131-3142 bp - 859 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 31376726-31377550(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCT
SmilChr04G002808 Chr04 NC_080390.1:44008672-44008683promoter 内 3004-3015 bp - 986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 44009669-44011722(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr02G001209 Chr02 NC_080388.1:22252154-22252165promoter 内 2897-2908 bp + 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 22253258-22253737(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr06G002632 Chr06 NC_080392.1:37884350-37884361promoter 内 2821-2832 bp + 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37882245-37883181(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr06G002633 Chr06 NC_080392.1:37893896-37893907promoter 内 2821-2832 bp + 1169 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37891791-37892727(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr01G000889 Chr01 NC_080387.1:18946988-18946999promoter 内 2615-2626 bp + 1375 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 18935863-18945613(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTAG
SmilChr04G002297 Chr04 NC_080390.1:37229612-37229623promoter 内 2553-2564 bp + 1437 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37224694-37228175(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTACA
SmilChr01G002187 Chr01 NC_080387.1:37992652-37992663promoter 内 2545-2556 bp + 1445 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 37994108-37997497(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGGT
SmilChr04G001162 Chr04 NC_080390.1:17276450-17276461promoter 内 2538-2549 bp + 1452 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 17273771-17274998(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr06G000089 Chr06 NC_080392.1:633806-633817promoter 内 2513-2524 bp - 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 635294-636451(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr03G003630 Chr03 NC_080389.1:54971248-54971259promoter 内 2411-2422 bp + 1579 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 54972838-54974617(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTAACAGCTGGT
SmilChr05G002727 Chr05 NC_080391.1:31378589-31378600promoter 内 2301-2312 bp + 1689 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 31380289-31384080(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAAAGCTGTA
SmilChr04G000257 Chr04 NC_080390.1:2344355-2344366promoter 内 2243-2254 bp + 1747 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2341092-2342608(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr08G001500 Chr08 NC_080394.1:12149426-12149437promoter 内 2206-2217 bp + 1784 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 12151221-12151964(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATACAGCTGAT
SmilChr02G003586 Chr02 NC_080388.1:57036408-57036419promoter 内 2190-2201 bp + 1800 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 57031731-57034608(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr02G002047 Chr02 NC_080388.1:36865071-36865082promoter 内 2183-2194 bp - 1807 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 36866889-36867572(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr01G005878 Chr01 NC_080387.1:74726057-74726068promoter 内 2181-2192 bp + 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 74721717-74724248(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACT
SmilChr05G000499 Chr05 NC_080391.1:3898269-3898280promoter 内 2165-2176 bp + 1825 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 3900105-4820659(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGGACAGCTAAG
SmilChr06G000298 Chr06 NC_080392.1:2127909-2127920promoter 内 2138-2149 bp - 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 2121637-2126057(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTAAT
SmilChr02G004533 Chr02 NC_080388.1:67905032-67905043promoter 内 2113-2124 bp - 1877 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67898323-67903155(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGAAAGCTGTA
SmilChr02G004521 Chr02 NC_080388.1:67738292-67738303promoter 内 2097-2108 bp - 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 67734728-67736399(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGACAGCTCAT
SmilChr06G002509 Chr06 NC_080392.1:35984832-35984843promoter 内 2075-2086 bp - 1915 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 35986758-35989568(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGCAGCTGTCGA
SmilChr07G002955 Chr07 NC_080393.1:30020210-30020221promoter 内 2039-2050 bp + 1951 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 30017000-30018259(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTACT
SmilChr02G004942 Chr02 NC_080388.1:71364874-71364885promoter 内 2034-2045 bp + 1956 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 71366841-71374911(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGCT
SmilChr04G001172 Chr04 NC_080390.1:17539880-17539891promoter 内 1964-1975 bp - 2026 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 17541917-17543133(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr04G000911 Chr04 NC_080390.1:11859734-11859745promoter 内 1901-1912 bp + 2089 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 11855592-11857645(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTAG
SmilChr03G004050 Chr03 NC_080389.1:59462607-59462618promoter 内 1770-1781 bp - 2220 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 59464838-59465778(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC
SmilChr02G004939 Chr02 NC_080388.1:71364874-71364885promoter 内 1681-1692 bp + 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.5/ 100 1 71360734-71362565(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGC