转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 126 / 143 下载 TSV

上一页 126 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004336 Chr01 NC_080387.1:61486275-61486286promoter 内 1581-1592 bp + 2409 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 61473782-61483866(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAT
SmilChr07G001750 Chr07 NC_080393.1:14835547-14835558promoter 内 1568-1579 bp + 2422 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 14826030-14833125(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGA
SmilChr08G001502 Chr08 NC_080394.1:12159722-12159733promoter 内 1473-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 12162250-12163853(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAT
SmilChr05G004027 Chr05 NC_080391.1:54267867-54267878promoter 内 1373-1384 bp + 2617 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 54261108-54265250(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACCTGTCAA
SmilChr07G003969 Chr07 NC_080393.1:50521874-50521885promoter 内 1271-1282 bp + 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 50515949-50519155(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGA
SmilChr05G002105 Chr05 NC_080391.1:22060302-22060313promoter 内 1268-1279 bp - 2722 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 22063035-22064258(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr04G000721 Chr04 NC_080390.1:8470520-8470531promoter 内 1247-1258 bp - 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 8461382-8467777(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTAAC
SmilChr06G000607 Chr06 NC_080392.1:5237884-5237895promoter 内 1009-1020 bp + 2981 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 5240876-5246201(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAA
SmilChr07G000024 Chr07 NC_080393.1:107311-107322promoter 内 905-916 bp - 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 110407-113752(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGAACTGTCAA
SmilChr04G002638 Chr04 NC_080390.1:41792478-41792489promoter 内 832-843 bp - 3158 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 41786703-41789320(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAA
SmilChr04G000289 Chr04 NC_080390.1:2687043-2687054promoter 内 797-808 bp + 3193 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2690247-2693195(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAA
SmilChr02G004810 Chr02 NC_080388.1:70271447-70271458promoter 内 785-796 bp + 3205 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 70266135-70268242(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGA
SmilChr04G001266 Chr04 NC_080390.1:20080792-20080803promoter 内 748-759 bp + 3242 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 20084045-20087692(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGGG
SmilChr01G001853 Chr01 NC_080387.1:33473731-33473742promoter 内 734-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 33467816-33470475(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATAACAGCTGAA
SmilChr05G003028 Chr05 NC_080391.1:37890533-37890544promoter 内 627-638 bp - 3363 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 37893907-37895207(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGA
SmilChr04G000841 Chr04 NC_080390.1:10611505-10611516promoter 内 583-594 bp - 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 10614923-10617887(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTTAT
SmilChr05G004169 Chr05 NC_080391.1:55625792-55625803promoter 内 524-535 bp + 3466 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 55629269-55630128(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGTTCTA
SmilChr08G000387 Chr08 NC_080394.1:2720896-2720907promoter 内 506-517 bp - 3484 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 2716706-2717412(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGGTCTC
SmilChr08G002526 Chr08 NC_080394.1:24481400-24481411promoter 内 321-332 bp - 3669 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 24474459-24477731(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGTG
SmilChr03G001223 Chr03 NC_080389.1:14094137-14094148promoter 内 259-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 14097879-14100533(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGTG
SmilChr08G000152 Chr08 NC_080394.1:991666-991677promoter 内 197-208 bp + 3793 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 995470-995943(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCAACAGCTGTG
SmilChr06G001256 Chr06 NC_080392.1:13071871-13071882promoter 内 54-65 bp + 3936 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 13067243-13067935(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AGCAGCTGTCGT
SmilChr01G005915 Chr01 NC_080387.1:74983894-74983905promoter 内 47-58 bp + 3943 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.3/ 100 1 74987848-74990787(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGGG
SmilChr07G001439 Chr07 NC_080393.1:11158765-11158776promoter 内 2131-2142 bp - 1859 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 11156429-11156906(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGGT
SmilChr01G002566 Chr01 NC_080387.1:43769377-43769388promoter 内 1786-1797 bp - 2204 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 2 43764827-43767173(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGGT
SmilChr01G005392 Chr01 NC_080387.1:71209019-71209030promoter 内 2929-2940 bp + 1061 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 71205989-71207958(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAC
SmilChr05G002950 Chr05 NC_080391.1:35565551-35565562promoter 内 2849-2860 bp - 1141 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 35566703-35568408(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAACTGTCAA
SmilChr02G003339 Chr02 NC_080388.1:54604642-54604653promoter 内 2817-2828 bp - 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54605826-54606361(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTTAC
SmilChr01G002332 Chr01 NC_080387.1:40468834-40468845promoter 内 2549-2560 bp + 1441 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 40470286-40471841(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCCC
SmilChr03G001355 Chr03 NC_080389.1:15920887-15920898promoter 内 2468-2479 bp - 1522 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 15917647-15919365(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGAT
SmilChr08G001342 Chr08 NC_080394.1:10716916-10716927promoter 内 2055-2066 bp - 1935 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 10712980-10714981(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCCC
SmilChr01G001246 Chr01 NC_080387.1:24975693-24975704promoter 内 1852-1863 bp - 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 24971229-24973555(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGTG
SmilChr08G000014 Chr08 NC_080394.1:115096-115107promoter 内 1788-1799 bp + 2202 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 117309-122257(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAG
SmilChr06G001773 Chr06 NC_080392.1:20764596-20764607promoter 内 1446-1457 bp + 2544 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 20750155-20762052(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGAGCTGTCAC
SmilChr02G002395 Chr02 NC_080388.1:41848970-41848981promoter 内 1232-1243 bp - 2758 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 41851739-41855872(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGT
SmilChr07G003868 Chr07 NC_080393.1:48145249-48145260promoter 内 1232-1243 bp - 2758 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 48141620-48142491(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGTG
SmilChr04G003868 Chr04 NC_080390.1:54575151-54575162promoter 内 1147-1158 bp - 2843 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 54578005-54583615(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAA
SmilChr07G003857 Chr07 NC_080393.1:47919405-47919416promoter 内 1077-1088 bp + 2913 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 47922329-47923935(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGAT
SmilChr08G003508 Chr08 NC_080394.1:37650319-37650330promoter 内 1035-1046 bp + 2955 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 37653285-37654867(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTAACAGCTGAG
SmilChr03G000043 Chr03 NC_080389.1:483783-483794promoter 内 976-987 bp - 3014 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 486808-487809(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGTTGT
SmilChr03G004451 Chr03 NC_080389.1:62636219-62636230promoter 内 943-954 bp + 3047 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 62639277-62641939(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGCC
SmilChr02G002890 Chr02 NC_080388.1:49185905-49185916promoter 内 830-841 bp + 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 49189076-49192507(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCCC
SmilChr08G000012 Chr08 NC_080394.1:115096-115107promoter 内 776-787 bp + 3214 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 106888-111882(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAA
SmilChr03G004751 Chr03 NC_080389.1:64591865-64591876promoter 内 609-620 bp + 3381 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 64595257-64596262(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTAACAGCTGAT
SmilChr08G001831 Chr08 NC_080394.1:15693903-15693914promoter 内 517-528 bp + 3473 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 15686069-15690430(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAACTGTCAA
SmilChr02G000094 Chr02 NC_080388.1:1237787-1237798promoter 内 466-477 bp + 3524 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 1230404-1234263(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTTAA
SmilChr08G003165 Chr08 NC_080394.1:32290112-32290123promoter 内 410-421 bp - 3580 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 32282864-32286532(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCCC
SmilChr03G002902 Chr03 NC_080389.1:45777639-45777650promoter 内 63-74 bp + 3927 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.2/ 100 1 45768550-45773712(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGA
SmilChr01G000783 Chr01 NC_080387.1:17047785-17047796promoter 内 3323-3334 bp - 667 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 3 17046258-17047118(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACAACAGCTGTT
SmilChr01G002892 Chr01 NC_080387.1:47609328-47609339promoter 内 3550-3561 bp + 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.1/ 100 2 47602304-47608888(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTTGT