转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

下载包含当前查询和阈值下的全部候选靶基因,每个基因保留一个最佳位点及命中位点数。0–100 标准化 motif 得分不代表结合概率。

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 131 / 149 下载 TSV

上一页 131 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 标准化 motif 得分 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G000054 Chr04 NC_080390.1:472350-472360promoter 内 1267-1277 bp - 2724 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 475084-477233(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr02G000588 Chr02 NC_080388.1:8442524-8442534promoter 内 1197-1207 bp + 2794 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 8445328-8446504(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr05G000614 Chr05 NC_080391.1:4610805-4610815promoter 内 1120-1130 bp + 2871 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 4613686-4616997(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TACAGCTGTAG
SmilChr07G002229 Chr07 NC_080393.1:20508341-20508351promoter 内 1040-1050 bp + 2951 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 20504358-20505390(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAG
SmilChr01G001427 Chr01 NC_080387.1:27915372-27915382promoter 内 917-927 bp - 3074 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 27918456-27919332(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr02G005539 Chr02 NC_080388.1:75420720-75420730promoter 内 118-128 bp + 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 2 75413636-75416847(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGTA
SmilChr06G002120 Chr06 NC_080392.1:28435869-28435879promoter 内 3945-3955 bp - 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 28434148-28435823(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr04G002824 Chr04 NC_080390.1:44311495-44311505promoter 内 3904-3914 bp - 87 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 44311592-44311990(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAG
SmilChr01G001215 Chr01 NC_080387.1:24409071-24409081promoter 内 3828-3838 bp - 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 24409244-24415649(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAC
SmilChr01G001173 Chr01 NC_080387.1:23788291-23788301promoter 内 3813-3823 bp - 178 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 23788479-23792190(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAC
SmilChr07G002114 Chr07 NC_080393.1:19255552-19255562promoter 内 3763-3773 bp + 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 19255790-19262603(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr02G004409 Chr02 NC_080388.1:66412300-66412310promoter 内 3679-3689 bp + 312 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 66408238-66411988(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGGCAGCTGGC
SmilChr04G003108 Chr04 NC_080390.1:47639817-47639827promoter 内 3612-3622 bp - 379 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 47640206-47642840(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr05G004099 Chr05 NC_080391.1:54846898-54846908promoter 内 3563-3573 bp - 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 54847336-54849783(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAG
SmilChr02G000240 Chr02 NC_080388.1:3099457-3099467promoter 内 3513-3523 bp + 478 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 3099945-3104334(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr01G003771 Chr01 NC_080387.1:56080020-56080030promoter 内 3371-3381 bp + 620 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 56076342-56079400(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAG
SmilChr07G003053 Chr07 NC_080393.1:31856970-31856980promoter 内 3354-3364 bp + 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 31857617-31862524(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr03G004190 Chr03 NC_080389.1:60577590-60577600promoter 内 3327-3337 bp - 664 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 60573544-60576926(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr04G003179 Chr04 NC_080390.1:48494193-48494203promoter 内 3236-3246 bp - 755 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 48492374-48493438(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr07G001200 Chr07 NC_080393.1:9117756-9117766promoter 内 3185-3195 bp + 806 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 9115439-9116950(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAG
SmilChr05G004278 Chr05 NC_080391.1:56571972-56571982promoter 内 3139-3149 bp + 852 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 56572834-56575389(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAG
SmilChr04G002648 Chr04 NC_080390.1:41842256-41842266promoter 内 3063-3073 bp + 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 41843194-41845852(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr01G003047 Chr01 NC_080387.1:49451450-49451460promoter 内 3042-3052 bp + 949 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 49448957-49450501(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr01G005847 Chr01 NC_080387.1:74436621-74436631promoter 内 2819-2829 bp - 1172 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 74432516-74435449(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr03G002459 Chr03 NC_080389.1:38939996-38940006promoter 内 2765-2775 bp - 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38935585-38938770(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr02G003981 Chr02 NC_080388.1:62063263-62063273promoter 内 2757-2767 bp - 1234 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 62064507-62067225(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr04G000761 Chr04 NC_080390.1:9285209-9285219promoter 内 2661-2671 bp - 1330 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 9279966-9283879(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr05G001315 Chr05 NC_080391.1:11319493-11319503promoter 内 2636-2646 bp + 1355 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 11320858-11323001(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAG
SmilChr04G002618 Chr04 NC_080390.1:41593449-41593459promoter 内 2495-2505 bp + 1496 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 41594955-41600347(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GTTAGCTGTCC
SmilChr03G001576 Chr03 NC_080389.1:19927888-19927898promoter 内 2421-2431 bp - 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 19925517-19926318(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAG
SmilChr07G002027 Chr07 NC_080393.1:18270496-18270506promoter 内 2334-2344 bp + 1657 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 18272163-18273742(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAG
SmilChr01G004962 Chr01 NC_080387.1:67708364-67708374promoter 内 2305-2315 bp + 1686 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 67705505-67706678(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTACAGCTGAG
SmilChr03G002896 Chr03 NC_080389.1:45691172-45691182promoter 内 2275-2285 bp - 1716 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 45692898-45694761(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr07G002018 Chr07 NC_080393.1:18043358-18043368promoter 内 2254-2264 bp + 1737 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 18045105-18046547(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAG
SmilChr07G000811 Chr07 NC_080393.1:5717881-5717891promoter 内 2192-2202 bp - 1799 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5719690-5723407(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr03G001109 Chr03 NC_080389.1:12788224-12788234promoter 内 2189-2199 bp + 1802 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 12790036-12791228(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAG
SmilChr04G004072 Chr04 NC_080390.1:55811571-55811581promoter 内 2043-2053 bp - 1948 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55813529-55815622(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr01G000494 Chr01 NC_080387.1:10071115-10071125promoter 内 1603-1613 bp + 2388 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 10073513-10076671(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr02G001584 Chr02 NC_080388.1:29590222-29590232promoter 内 1396-1406 bp + 2595 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 29587041-29587627(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AGGCAGCTGGC
SmilChr02G005501 Chr02 NC_080388.1:75147112-75147122promoter 内 1367-1377 bp + 2624 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 75149746-75154104(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr04G000721 Chr04 NC_080390.1:8470520-8470530promoter 内 1248-1258 bp + 2743 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 8461382-8467777(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAC
SmilChr07G000810 Chr07 NC_080393.1:5717881-5717891promoter 内 1075-1085 bp - 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 5710930-5714965(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr02G005002 Chr02 NC_080388.1:71818176-71818186promoter 内 1048-1058 bp - 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 71821129-71821929(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr01G003772 Chr01 NC_080387.1:56080020-56080030promoter 内 1005-1015 bp + 2986 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 56083016-56085836(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCAGCTGTAG
SmilChr04G004003 Chr04 NC_080390.1:55370051-55370061promoter 内 982-992 bp + 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 55373070-55378103(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GCCAGCTGCCT
SmilChr04G000051 Chr04 NC_080390.1:450740-450750promoter 内 896-906 bp - 3095 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 453845-458680(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr05G000199 Chr05 NC_080391.1:1592580-1592590promoter 内 847-857 bp - 3144 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 1595734-1598962(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGGCAGCTGGA
SmilChr04G000050 Chr04 NC_080390.1:450740-450750promoter 内 710-720 bp - 3281 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 447156-447459(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG
SmilChr05G002680 Chr05 NC_080391.1:30284469-30284479promoter 内 672-682 bp - 3319 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 30287798-30290452(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GGACAGCTAAC
SmilChr01G002227 Chr01 NC_080387.1:38738591-38738601promoter 内 432-442 bp + 3559 bp 位于靶基因 TSS 上游 91.8/ 100 1 38742160-38743032(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TCCAGCTGCCG