转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G004246; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00021799-RA_Salv SmilChr08G004246 WRKY XP_057780410.1 MP00422 AAAAGTCAACGAT

可能结合的靶基因

9791 个结合位点 6535 个候选靶基因 第 14 / 131 下载 TSV

上一页 14 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002611 Chr02 NC_080388.1:45306134-45306146promoter 内 1831-1843 bp + 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 45302269-45303976(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G004657 Chr02 NC_080388.1:68986823-68986835promoter 内 1788-1800 bp + 2201 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 68983438-68984622(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G002417 Chr01 NC_080387.1:41587380-41587392promoter 内 1767-1779 bp - 2222 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 41561379-41585158(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr03G001079 Chr03 NC_080389.1:12477660-12477672promoter 内 977-989 bp - 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 12480684-12481652(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G005090 Chr02 NC_080388.1:72490295-72490307promoter 内 888-900 bp + 3101 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 72493408-72500890(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GCAAGTCAACGAC
SmilChr01G005957 Chr01 NC_080387.1:75256666-75256678promoter 内 621-633 bp - 3368 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 75260046-75263014(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G002753 Chr01 NC_080387.1:45853807-45853819promoter 内 302-314 bp + 3687 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 2 45847328-45850120(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G005102 Chr02 NC_080388.1:72563470-72563482promoter 内 3876-3888 bp - 113 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72561030-72563357(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G002122 Chr01 NC_080387.1:37225507-37225519promoter 内 3790-3802 bp + 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 37222854-37225308(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G005049 Chr02 NC_080388.1:72222485-72222497promoter 内 3789-3801 bp - 200 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72222697-72225713(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G004992 Chr01 NC_080387.1:67951909-67951921promoter 内 3702-3714 bp + 287 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 67952208-67955835(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr03G001425 Chr03 NC_080389.1:16899861-16899873promoter 内 3693-3705 bp + 296 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 16898811-16899565(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AATGTTGACTTTT
SmilChr03G001323 Chr03 NC_080389.1:15469445-15469457promoter 内 3692-3704 bp - 297 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 15469754-15470548(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AATGTTGACTTTT
SmilChr03G000024 Chr03 NC_080389.1:364787-364799promoter 内 3650-3662 bp - 339 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 363541-364448(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr02G004604 Chr02 NC_080388.1:68551689-68551701promoter 内 3597-3609 bp - 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 68546587-68551297(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr03G001916 Chr03 NC_080389.1:26837790-26837802promoter 内 3597-3609 bp + 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 26838194-26840759(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G005626 Chr01 NC_080387.1:72726535-72726547promoter 内 3593-3605 bp + 396 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72726943-72733229(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G005664 Chr01 NC_080387.1:72962298-72962310promoter 内 3572-3584 bp + 417 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72962727-72962800(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr02G002537 Chr02 NC_080388.1:44157776-44157788promoter 内 3400-3412 bp + 589 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 44154115-44157187(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G002217 Chr01 NC_080387.1:38495664-38495676promoter 内 3389-3401 bp - 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 38496276-38498860(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G002612 Chr02 NC_080388.1:45306134-45306146promoter 内 3282-3294 bp + 707 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 45306853-45307196(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr02G004537 Chr02 NC_080388.1:67962513-67962525promoter 内 3269-3281 bp - 720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 67957432-67961793(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AGAAGTCAACCCC
SmilChr01G001203 Chr01 NC_080387.1:24253537-24253549promoter 内 3177-3189 bp - 812 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24250444-24252725(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G004812 Chr01 NC_080387.1:66319885-66319897promoter 内 3065-3077 bp - 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66315769-66318961(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G004813 Chr01 NC_080387.1:66319885-66319897promoter 内 3063-3075 bp - 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66320823-66324495(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G005095 Chr01 NC_080387.1:68791605-68791617promoter 内 3053-3065 bp + 936 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 68790592-68790669(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G003322 Chr01 NC_080387.1:51924041-51924053promoter 内 3024-3036 bp + 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 51920813-51923076(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AATGTTGACTTTT
SmilChr01G005665 Chr01 NC_080387.1:72962298-72962310promoter 内 2949-2961 bp + 1040 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72963350-72964618(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr02G002613 Chr02 NC_080388.1:45306134-45306146promoter 内 2937-2949 bp + 1052 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 45307198-45309376(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G002473 Chr01 NC_080387.1:42462384-42462396promoter 内 2880-2892 bp + 1109 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 42455494-42461275(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G004028 Chr02 NC_080388.1:62557600-62557612promoter 内 2855-2867 bp + 1134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 62558746-62562572(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr03G000375 Chr03 NC_080389.1:4190787-4190799promoter 内 2635-2647 bp + 1354 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 4186723-4189433(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G005023 Chr01 NC_080387.1:68207458-68207470promoter 内 2604-2616 bp - 1385 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 68202894-68206073(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAACATT
SmilChr02G005419 Chr02 NC_080388.1:74648333-74648345promoter 内 2597-2609 bp - 1392 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 74643948-74646941(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G005625 Chr01 NC_080387.1:72726535-72726547promoter 内 2555-2567 bp + 1434 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 72723566-72725101(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G002280 Chr01 NC_080387.1:39596790-39596802promoter 内 2499-2511 bp + 1490 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 39592366-39595300(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G005333 Chr02 NC_080388.1:74155930-74155942promoter 内 2451-2463 bp - 1538 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 74157480-74162524(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G001324 Chr02 NC_080388.1:24729066-24729078promoter 内 2440-2452 bp - 1549 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 24730627-24732489(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G005096 Chr01 NC_080387.1:68791605-68791617promoter 内 2191-2203 bp + 1798 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 68793415-68797220(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr02G002299 Chr02 NC_080388.1:40579013-40579025promoter 内 2181-2193 bp - 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 40580833-40588306(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr03G000508 Chr03 NC_080389.1:5481923-5481935promoter 内 2175-2187 bp - 1814 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 5483749-5488480(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AATGTTGACTTTT
SmilChr01G003878 Chr01 NC_080387.1:57110861-57110873promoter 内 1954-1966 bp - 2035 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 57107397-57108826(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr02G002538 Chr02 NC_080388.1:44157776-44157788promoter 内 1870-1882 bp + 2119 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 44159907-44165662(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr01G003756 Chr01 NC_080387.1:55959140-55959152promoter 内 1855-1867 bp - 2134 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 55961286-55993711(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G002913 Chr02 NC_080388.1:49435793-49435805promoter 内 1823-1835 bp - 2166 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 49428195-49433627(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 AAAAGTCAAAGAT
SmilChr02G004390 Chr02 NC_080388.1:66249012-66249024promoter 内 1578-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 66251435-66255580(+) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CGAAGTCAACTCT
SmilChr02G005483 Chr02 NC_080388.1:75038843-75038855promoter 内 1500-1512 bp + 2489 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 75034610-75036354(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr01G005156 Chr01 NC_080387.1:69335214-69335226promoter 内 1335-1347 bp + 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 69327137-69332560(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 ATCTTTGACTTTT
SmilChr02G001266 Chr02 NC_080388.1:23223997-23224009promoter 内 1321-1333 bp - 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 23218539-23221329(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 CAAAGTCAACAAC
SmilChr01G004209 Chr01 NC_080387.1:60537489-60537501promoter 内 1286-1298 bp + 2703 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.8/ 100 1 60528217-60534786(-) SMil_00021799-RA_Salv MP00422 GCAGTTGACTTCG