转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003367; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00001784-RA_Salv SmilChr04G003367 MYB XP_057804957.1 MP00191 ATTAACCTTATCCTC

可能结合的靶基因

9690 个结合位点 6736 个候选靶基因 第 15 / 135 下载 TSV

上一页 15 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G004683 Chr01 NC_080387.1:64906762-64906776promoter 内 398-412 bp + 3589 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 64910365-64911638(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTCGATCTTATCCTC
SmilChr01G004014 Chr01 NC_080387.1:58552013-58552027promoter 内 303-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 58555711-58557670(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGAAAAGA
SmilChr01G005003 Chr01 NC_080387.1:68072627-68072641promoter 内 137-151 bp - 3850 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 68076491-68103913(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AAAGATAAGGAAAAG
SmilChr02G003371 Chr02 NC_080388.1:54835688-54835702promoter 内 102-116 bp + 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 54839587-54841481(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TCTTTTCTTATCCTC
SmilChr03G002673 Chr03 NC_080389.1:42443830-42443844promoter 内 102-116 bp - 3885 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 2 42447729-42447802(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGATCGAC
SmilChr03G002775 Chr03 NC_080389.1:44145875-44145889promoter 内 3979-3993 bp - 8 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 44144140-44145867(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTGTCCTTATCCTA
SmilChr03G000886 Chr03 NC_080389.1:10114375-10114389promoter 内 3601-3615 bp - 386 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 10111702-10113989(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTTTCCTTATCTTT
SmilChr03G000904 Chr03 NC_080389.1:10343115-10343129promoter 内 3386-3400 bp + 601 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 10343730-10354110(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACTCTCCTTATCCCC
SmilChr03G002348 Chr03 NC_080389.1:37095837-37095851promoter 内 3331-3345 bp - 656 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 37096507-37097205(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGATATAC
SmilChr03G002490 Chr03 NC_080389.1:39584083-39584097promoter 内 2836-2850 bp + 1151 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 39585248-39588954(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTATATCTTATCCTC
SmilChr02G001426 Chr02 NC_080388.1:26937725-26937739promoter 内 2808-2822 bp - 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 26933246-26936546(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTATTCTTATCCAA
SmilChr01G003682 Chr01 NC_080387.1:55218333-55218347promoter 内 2725-2739 bp + 1262 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 55219609-55220499(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTAGTCCTTATCCAT
SmilChr02G001997 Chr02 NC_080388.1:36121786-36121800promoter 内 2683-2697 bp - 1304 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 36105911-36120482(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATATCCTTATCTTT
SmilChr02G004141 Chr02 NC_080388.1:63734020-63734034promoter 内 2636-2650 bp - 1351 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 63731730-63732669(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CACCACCTTATCTTA
SmilChr01G004422 Chr01 NC_080387.1:62334315-62334329promoter 内 2120-2134 bp + 1867 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 62329403-62332448(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GGGGATAAGGAAGAC
SmilChr03G002672 Chr03 NC_080389.1:42443830-42443844promoter 内 2064-2078 bp - 1923 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 42440658-42441907(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTCGATCTTATCCTC
SmilChr02G002912 Chr02 NC_080388.1:49422189-49422203promoter 内 2059-2073 bp - 1928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 49416026-49420261(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACCATCCTTATCCCA
SmilChr03G000604 Chr03 NC_080389.1:6691059-6691073promoter 内 1988-2002 bp - 1999 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 6687924-6689060(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAAACCTTATCTTA
SmilChr03G001199 Chr03 NC_080389.1:13829476-13829490promoter 内 1973-1987 bp + 2014 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 13831504-13832646(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAAACCTTATCTTA
SmilChr02G000387 Chr02 NC_080388.1:4806015-4806029promoter 内 1916-1930 bp - 2071 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 4808100-4810743(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGGCTGTG
SmilChr01G002755 Chr01 NC_080387.1:45858662-45858676promoter 内 1579-1593 bp + 2408 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 45861084-45862112(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTGCTCCTTATCCTT
SmilChr02G000262 Chr02 NC_080388.1:3414225-3414239promoter 内 1438-1452 bp - 2549 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 3409681-3411676(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CTTAACCTTATCAAT
SmilChr02G001996 Chr02 NC_080388.1:36070407-36070421promoter 内 1082-1096 bp - 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 36054525-36067502(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TATATCCTTATCTTT
SmilChr02G004158 Chr02 NC_080388.1:63898527-63898541promoter 内 1020-1034 bp + 2967 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 63901508-63904482(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCTCCTTATCCCC
SmilChr01G003150 Chr01 NC_080387.1:50300053-50300067promoter 内 772-786 bp + 3215 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 50303282-50306067(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCTAATCTTATCCCA
SmilChr01G003117 Chr01 NC_080387.1:49973335-49973349promoter 内 565-579 bp + 3422 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 49967805-49969913(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGGAGGAT
SmilChr02G002151 Chr02 NC_080388.1:38722792-38722806promoter 内 267-281 bp + 3720 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 38726526-38737738(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CCTAACCTTATCAAA
SmilChr02G002629 Chr02 NC_080388.1:45646323-45646337promoter 内 30-44 bp - 3957 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.6/ 100 1 45640897-45642366(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AATCTCCTTATCTTC
SmilChr03G002861 Chr03 NC_080389.1:45217556-45217570promoter 内 1310-1324 bp - 2677 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 6 45213099-45214879(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATTAACCTCATCCAT
SmilChr02G003909 Chr02 NC_080388.1:61147821-61147835promoter 内 1086-1100 bp + 2901 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 61141637-61144920(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGAATTGG
SmilChr01G000471 Chr01 NC_080387.1:9612418-9612432promoter 内 191-205 bp - 3796 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 4 9606995-9608622(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GATTTTCTTATCCTC
SmilChr01G005440 Chr01 NC_080387.1:71522377-71522391promoter 内 3055-3069 bp - 932 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 71519011-71521445(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 CATCATCTTATCCAA
SmilChr01G003899 Chr01 NC_080387.1:57279241-57279255promoter 内 2655-2669 bp + 1332 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 57280587-57285754(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GACAATCTTATCCGC
SmilChr03G002657 Chr03 NC_080389.1:42243640-42243654promoter 内 2527-2541 bp + 1460 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 42240966-42242180(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGATTTAA
SmilChr03G001855 Chr03 NC_080389.1:25576558-25576572promoter 内 2481-2495 bp - 1506 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 25578078-25588940(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ACGGATAAGGTTTCG
SmilChr03G000114 Chr03 NC_080389.1:1267016-1267030promoter 内 2175-2189 bp + 1812 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 1263204-1265204(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TAGGATAAGAATGGT
SmilChr01G001795 Chr01 NC_080387.1:32818951-32818965promoter 内 1940-1954 bp + 2047 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 32821012-32823779(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TGAATCCTTATCCTT
SmilChr03G000290 Chr03 NC_080389.1:3306211-3306225promoter 内 1576-1590 bp + 2411 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 3300698-3303800(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCGGATAAGGTCCGG
SmilChr02G000877 Chr02 NC_080388.1:15098714-15098728promoter 内 842-856 bp + 3145 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 15084624-15095569(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTGGATAAGAATATT
SmilChr02G002845 Chr02 NC_080388.1:48591072-48591086promoter 内 734-748 bp - 3253 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 48594339-48599625(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTGGATAAGGGTATA
SmilChr01G003382 Chr01 NC_080387.1:52508589-52508603promoter 内 349-363 bp - 3638 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 3 52512241-52516320(+) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GCGGATAAGGTCCGG
SmilChr01G005874 Chr01 NC_080387.1:74699140-74699154promoter 内 3974-3988 bp - 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 74686291-74699127(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GTATATCTTATCCAC
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SmilChr03G000195 Chr03 NC_080389.1:2181589-2181603promoter 内 3484-3498 bp - 503 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 2178065-2181086(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 TTTCTTCTTATCCTC
SmilChr03G000302 Chr03 NC_080389.1:3451775-3451789promoter 内 3448-3462 bp + 539 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 3449974-3451236(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGAGAGA
SmilChr02G001808 Chr02 NC_080388.1:32912675-32912689promoter 内 3444-3458 bp + 543 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 32910261-32912132(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 AGGGATAAGGATATA
SmilChr01G003791 Chr01 NC_080387.1:56297911-56297925promoter 内 3364-3378 bp + 623 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 56291429-56297288(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAGGATAAGATATGA
SmilChr03G000375 Chr03 NC_080389.1:4190067-4190081promoter 内 3353-3367 bp + 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 4186723-4189433(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 GAAGATAAGGAGAGA
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SmilChr01G005215 Chr01 NC_080387.1:69753290-69753304promoter 内 3047-3061 bp + 940 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.5/ 100 2 69751850-69752350(-) SMil_00001784-RA_Salv MP00191 ATGGATAAGATTTAT