转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001365; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010780-RA_Salv SmilChr06G001365 SBP XP_057768799.1 MP00307 ATTGTACGGAT

可能结合的靶基因

9755 个结合位点 6893 个候选靶基因 第 18 / 138 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001247 Chr02 NC_080388.1:22925392-22925402promoter 内 1504-1514 bp - 2487 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 22919554-22922905(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AATGTACGGTT
SmilChr02G003299 Chr02 NC_080388.1:54281057-54281067promoter 内 1348-1358 bp + 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 54252125-54278414(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AACCGTACATT
SmilChr01G002708 Chr01 NC_080387.1:45344145-45344155promoter 内 1278-1288 bp + 2713 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 45346868-45348686(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGTAC
SmilChr03G003594 Chr03 NC_080389.1:54580891-54580901promoter 内 1259-1269 bp - 2732 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 54577139-54578159(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CGTGTACGGAG
SmilChr03G002788 Chr03 NC_080389.1:44401411-44401421promoter 内 952-962 bp + 3039 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 44393563-44398372(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CACCGTACAAG
SmilChr01G002761 Chr01 NC_080387.1:46016041-46016051promoter 内 938-948 bp + 3053 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 46007200-46012988(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ACCCGTACACG
SmilChr01G000876 Chr01 NC_080387.1:18623773-18623783promoter 内 760-770 bp + 3231 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 18627014-18632149(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CGTGTACGGAG
SmilChr02G004177 Chr02 NC_080388.1:64065189-64065199promoter 内 718-728 bp + 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 64059365-64061916(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AACCGTACATT
SmilChr01G004255 Chr01 NC_080387.1:60827735-60827745promoter 内 505-515 bp - 3486 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 60831231-60832355(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATCCGTACGGC
SmilChr02G002588 Chr02 NC_080388.1:45005967-45005977promoter 内 470-480 bp + 3521 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 45000641-45002446(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 AACCGTACATT
SmilChr01G003098 Chr01 NC_080387.1:49784655-49784665promoter 内 291-301 bp - 3700 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 49788365-49792661(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTCCGTACACG
SmilChr01G001082 Chr01 NC_080387.1:22233709-22233719promoter 内 142-152 bp + 3849 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.8/ 100 1 22237568-22244887(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CGTGTACGGAG
SmilChr01G002467 Chr01 NC_080387.1:42364195-42364205promoter 内 2069-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 7 42366127-42368224(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 GTACGTACAAC
SmilChr02G004354 Chr02 NC_080388.1:65824623-65824633promoter 内 3853-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 5 65821840-65824485(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr02G004355 Chr02 NC_080388.1:65824623-65824633promoter 内 1091-1101 bp - 2900 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 5 65827533-65838754(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr02G004437 Chr02 NC_080388.1:66751893-66751903promoter 内 2748-2758 bp + 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 66753146-66754326(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr02G003795 Chr02 NC_080388.1:59598686-59598696promoter 内 2325-2335 bp - 1666 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 59592143-59597020(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr01G001998 Chr01 NC_080387.1:35478189-35478199promoter 内 2263-2273 bp - 1728 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 35470632-35476461(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr03G001316 Chr03 NC_080389.1:15445929-15445939promoter 内 2206-2216 bp + 1785 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 15442504-15444144(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr03G003754 Chr03 NC_080389.1:56656638-56656648promoter 内 2086-2096 bp + 1905 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 56652733-56654733(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr03G003015 Chr03 NC_080389.1:47053642-47053652promoter 内 1204-1214 bp + 2787 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 47056439-47059206(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr02G004867 Chr02 NC_080388.1:70779680-70779690promoter 内 987-997 bp + 3004 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 70782694-70782767(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr01G003154 Chr01 NC_080387.1:50327749-50327759promoter 内 550-560 bp + 3441 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 50331200-50332174(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr01G002750 Chr01 NC_080387.1:45808996-45809006promoter 内 212-222 bp - 3779 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 45812785-45817933(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr01G001474 Chr01 NC_080387.1:28504120-28504130promoter 内 39-49 bp + 3952 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 4 28508082-28509865(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 CTGGTACGGAT
SmilChr02G004942 Chr02 NC_080388.1:71366733-71366743promoter 内 3893-3903 bp + 98 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 71366841-71374911(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TATGTACGGAC
SmilChr01G004578 Chr01 NC_080387.1:63825381-63825391promoter 内 3817-3827 bp + 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 63819762-63825207(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr02G001076 Chr02 NC_080388.1:19254301-19254311promoter 内 3720-3730 bp + 271 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 19254582-19260044(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr02G000521 Chr02 NC_080388.1:7162696-7162706promoter 内 3478-3488 bp - 513 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 7163219-7165430(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATCCGTACCAG
SmilChr02G002729 Chr02 NC_080388.1:47206793-47206803promoter 内 3463-3473 bp - 528 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 47205786-47206265(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr03G003191 Chr03 NC_080389.1:49368979-49368989promoter 内 3243-3253 bp - 748 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 49369737-49373510(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr01G001763 Chr01 NC_080387.1:32413798-32413808promoter 内 2944-2954 bp + 1047 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 32414855-32420349(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr01G002749 Chr01 NC_080387.1:45808996-45809006promoter 内 2702-2712 bp - 1289 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 45805944-45807707(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr03G000184 Chr03 NC_080389.1:1957863-1957873promoter 内 2438-2448 bp - 1553 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 1959426-1962875(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr01G005543 Chr01 NC_080387.1:72247910-72247920promoter 内 2423-2433 bp + 1568 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 72244774-72246342(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr01G005544 Chr01 NC_080387.1:72247910-72247920promoter 内 2331-2341 bp + 1660 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 72249580-72252845(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
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SmilChr03G000791 Chr03 NC_080389.1:9015483-9015493promoter 内 2169-2179 bp - 1822 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 9008587-9013661(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
SmilChr03G003772 Chr03 NC_080389.1:56871206-56871216promoter 内 2080-2090 bp - 1911 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 56873127-56876522(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATCCGTACCAG
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SmilChr03G003160 Chr03 NC_080389.1:48958344-48958354promoter 内 1586-1596 bp - 2405 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 48960759-48964130(+) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
SmilChr01G003153 Chr01 NC_080387.1:50327665-50327675promoter 内 1533-1543 bp + 2458 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 50323980-50325207(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 TACCGTACAAT
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SmilChr03G003936 Chr03 NC_080389.1:58426494-58426504promoter 内 1123-1133 bp - 2868 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 3 58422533-58423626(-) SMil_00010780-RA_Salv MP00307 ATTGTACGGTA
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