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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 18 / 151 下载 TSV

上一页 18 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000523 Chr05 NC_080391.1:4018492-4018504promoter 内 360-372 bp - 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 4012772-4014863(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAACTTT
SmilChr03G002795 Chr03 NC_080389.1:44438913-44438925promoter 内 252-264 bp + 3737 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 44434064-44435176(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCGGTAGGTGGA
SmilChr03G004131 Chr03 NC_080389.1:60141146-60141158promoter 内 154-166 bp + 3835 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 2 60144993-60155269(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCTAT
SmilChr04G002622 Chr04 NC_080390.1:41638163-41638175promoter 内 3983-3995 bp + 6 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 41636145-41638157(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTAAC
SmilChr04G002874 Chr04 NC_080390.1:44881943-44881955promoter 内 3943-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 44882001-44884311(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACA
SmilChr04G002875 Chr04 NC_080390.1:44891576-44891588promoter 内 3943-3955 bp + 46 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 44891634-44893947(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACA
SmilChr02G002930 Chr02 NC_080388.1:49795512-49795524promoter 内 3932-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 49793183-49795455(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACA
SmilChr04G002666 Chr04 NC_080390.1:42063377-42063389promoter 内 3903-3915 bp + 86 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 42061272-42063291(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTAAC
SmilChr03G000791 Chr03 NC_080389.1:9013853-9013865promoter 内 3797-3809 bp - 192 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 9008587-9013661(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCAAT
SmilChr02G001569 Chr02 NC_080388.1:29104767-29104779promoter 内 3730-3742 bp - 259 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 29100652-29104508(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTT
SmilChr02G002931 Chr02 NC_080388.1:49805294-49805306promoter 内 3675-3687 bp - 314 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 49802967-49804980(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACA
SmilChr05G001196 Chr05 NC_080391.1:10049286-10049298promoter 内 3545-3557 bp - 444 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 10044965-10048842(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTAA
SmilChr04G001401 Chr04 NC_080390.1:22791236-22791248promoter 内 3533-3545 bp - 456 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 22791704-22792840(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTAGC
SmilChr03G000587 Chr03 NC_080389.1:6533230-6533242promoter 内 3524-3536 bp + 465 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 6527470-6532765(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTAAA
SmilChr02G005146 Chr02 NC_080388.1:72864819-72864831promoter 内 3447-3459 bp - 542 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 72860905-72864277(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACTTTT
SmilChr04G003994 Chr04 NC_080390.1:55328799-55328811promoter 内 3368-3380 bp + 621 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 55329432-55329831(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCACA
SmilChr01G004153 Chr01 NC_080387.1:60053956-60053968promoter 内 3307-3319 bp + 682 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 60051287-60053274(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGAGTAGGTAGG
SmilChr03G000497 Chr03 NC_080389.1:5315820-5315832promoter 内 3192-3204 bp + 797 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 5316629-5320251(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCAAT
SmilChr05G000800 Chr05 NC_080391.1:6269418-6269430promoter 内 3163-3175 bp + 826 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 6270256-6271073(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCTAT
SmilChr01G004761 Chr01 NC_080387.1:65792705-65792717promoter 内 3133-3145 bp + 856 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 65793573-65796299(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAACCTC
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SmilChr04G000678 Chr04 NC_080390.1:7759593-7759605promoter 内 2695-2707 bp - 1294 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 7754387-7758299(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTCACCTACCACA
SmilChr02G003974 Chr02 NC_080388.1:61983286-61983298promoter 内 2671-2683 bp - 1318 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 61976230-61981968(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCAAT
SmilChr03G002130 Chr03 NC_080389.1:33143298-33143310promoter 内 2666-2678 bp + 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 33144633-33146677(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCAAT
SmilChr05G001323 Chr05 NC_080391.1:11358068-11358080promoter 内 2626-2638 bp - 1363 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 11354476-11356705(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCAAA
SmilChr02G002769 Chr02 NC_080388.1:47753632-47753644promoter 内 2506-2518 bp - 1483 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 47750368-47752149(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCTCG
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SmilChr02G001937 Chr02 NC_080388.1:34776959-34776971promoter 内 2362-2374 bp + 1627 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 34774139-34775332(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTAGC
SmilChr04G002624 Chr04 NC_080390.1:41638163-41638175promoter 内 2322-2334 bp + 1667 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 41639842-41642949(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCATT
SmilChr01G001426 Chr01 NC_080387.1:27903819-27903831promoter 内 2313-2325 bp - 1676 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 27899043-27902143(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCTACCTACCAAT
SmilChr04G002668 Chr04 NC_080390.1:42063377-42063389promoter 内 2257-2269 bp + 1732 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 42065121-42068251(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTACCATT
SmilChr01G004782 Chr01 NC_080387.1:66008679-66008691promoter 内 2048-2060 bp - 1941 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 66010632-66013803(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTAAG
SmilChr02G005398 Chr02 NC_080388.1:74562196-74562208promoter 内 1953-1965 bp - 2036 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 74555887-74560160(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACTTCT
SmilChr01G002504 Chr01 NC_080387.1:42904892-42904904promoter 内 1884-1896 bp + 2105 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 42907009-42908794(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCAAA
SmilChr01G005568 Chr01 NC_080387.1:72470407-72470419promoter 内 1846-1858 bp - 2143 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 72465758-72468264(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCCTA
SmilChr03G004623 Chr03 NC_080389.1:63907418-63907430promoter 内 1723-1735 bp - 2266 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 63902401-63905152(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCAAT
SmilChr01G005139 Chr01 NC_080387.1:69190776-69190788promoter 内 1637-1649 bp + 2352 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 69171462-69188424(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTAGG
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SmilChr03G000793 Chr03 NC_080389.1:9013853-9013865promoter 内 1589-1601 bp - 2400 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 9016265-9021580(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATTGGTAGGTAGA
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SmilChr01G003954 Chr01 NC_080387.1:57918488-57918500promoter 内 1464-1476 bp + 2525 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 57921025-57976435(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTAA
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SmilChr01G002752 Chr01 NC_080387.1:45838358-45838370promoter 内 1337-1349 bp + 2652 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 45841022-45846134(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCCACCTACCACA
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SmilChr03G004222 Chr03 NC_080389.1:60780397-60780409promoter 内 1066-1078 bp + 2923 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.7/ 100 1 60783332-60786462(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACCAAT