转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 2 / 151 下载 TSV

上一页 2 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002040 Chr04 NC_080390.1:33118029-33118041promoter 内 1946-1958 bp - 2043 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 33113750-33115986(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCATT
SmilChr03G004473 Chr03 NC_080389.1:62838382-62838394promoter 内 1831-1843 bp - 2158 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 62832482-62836224(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCCC
SmilChr01G004521 Chr01 NC_080387.1:63323197-63323209promoter 内 1801-1813 bp - 2188 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 63319523-63321009(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCCC
SmilChr03G002707 Chr03 NC_080389.1:43045615-43045627promoter 内 1795-1807 bp - 2194 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 43042381-43043421(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTCT
SmilChr04G001298 Chr04 NC_080390.1:20691924-20691936promoter 内 726-738 bp + 3263 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 20687488-20688661(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGGGGTAGGTGGG
SmilChr01G005892 Chr01 NC_080387.1:74852031-74852043promoter 内 482-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 74855550-74858226(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGGGTAGGTGGG
SmilChr05G001721 Chr05 NC_080391.1:16490957-16490969promoter 内 458-470 bp + 3531 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.6/ 100 1 16485265-16487426(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGAG
SmilChr04G003921 Chr04 NC_080390.1:54897381-54897393promoter 内 696-708 bp - 3293 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 4 54889238-54894088(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCACT
SmilChr01G003715 Chr01 NC_080387.1:55491104-55491116promoter 内 3436-3448 bp + 553 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 3 55486465-55490551(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGTGAA
SmilChr01G003716 Chr01 NC_080387.1:55491104-55491116promoter 内 379-391 bp + 3610 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 3 55494726-55498773(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTTC
SmilChr04G000497 Chr04 NC_080390.1:5432502-5432514promoter 内 3359-3371 bp - 630 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 1 5422966-5431872(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTTC
SmilChr02G002283 Chr02 NC_080388.1:40301255-40301267promoter 内 3244-3256 bp - 745 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 1 40302012-40303908(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGGTAGGTGGA
SmilChr05G001152 Chr05 NC_080391.1:9675574-9675586promoter 内 2780-2792 bp + 1209 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 1 9676795-9679167(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCTTC
SmilChr02G000397 Chr02 NC_080388.1:4911736-4911748promoter 内 373-385 bp + 3616 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 1 4915364-4916889(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCATC
SmilChr03G001145 Chr03 NC_080389.1:13199880-13199892promoter 内 353-365 bp + 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.5/ 100 1 13203528-13208130(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTTC
SmilChr05G002057 Chr05 NC_080391.1:21422156-21422168promoter 内 3242-3254 bp - 747 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 3 21419188-21421409(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCACC
SmilChr05G000077 Chr05 NC_080391.1:396782-396794promoter 内 246-258 bp + 3743 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 3 390649-393039(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTGAA
SmilChr02G004081 Chr02 NC_080388.1:63092057-63092069promoter 内 3686-3698 bp + 303 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 2 63092372-63096688(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCACC
SmilChr01G002492 Chr01 NC_080387.1:42661926-42661938promoter 内 2356-2368 bp + 1633 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 2 42663571-42665645(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCTCC
SmilChr02G002244 Chr02 NC_080388.1:39860398-39860410promoter 内 1431-1443 bp - 2558 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 2 39856971-39857840(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCACC
SmilChr01G004751 Chr01 NC_080387.1:65687484-65687496promoter 内 2931-2943 bp + 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 65684443-65686426(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTGGA
SmilChr03G004029 Chr03 NC_080389.1:59305434-59305446promoter 内 1728-1740 bp + 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 59298837-59303173(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTGAA
SmilChr05G001254 Chr05 NC_080391.1:10663924-10663936promoter 内 1039-1051 bp + 2950 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.4/ 100 1 10666886-10669189(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCTCC
SmilChr04G002013 Chr04 NC_080390.1:32676355-32676367promoter 内 1580-1592 bp + 2409 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 32671486-32673946(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGGTAGGTAGG
SmilChr04G002014 Chr04 NC_080390.1:32676355-32676367promoter 内 1506-1518 bp + 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 32672832-32673872(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGGTAGGTAGG
SmilChr02G003998 Chr02 NC_080388.1:62312105-62312117promoter 内 1338-1350 bp - 2651 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 3 62303822-62309454(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCCACCTACCCTT
SmilChr01G001619 Chr01 NC_080387.1:30295332-30295344promoter 内 3028-3040 bp + 961 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 30296305-30300618(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTACCACC
SmilChr01G000369 Chr01 NC_080387.1:7621707-7621719promoter 内 2627-2639 bp + 1362 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 7620268-7620345(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTGGTAGGTAGG
SmilChr01G004391 Chr01 NC_080387.1:62085342-62085354promoter 内 1952-1964 bp - 2037 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 62087391-62090905(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GATGGTAGGTAAG
SmilChr04G003132 Chr04 NC_080390.1:47913394-47913406promoter 内 1524-1536 bp - 2465 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.3/ 100 1 47908485-47910929(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCCCT
SmilChr03G004190 Chr03 NC_080389.1:60576940-60576952promoter 内 3975-3987 bp - 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 3 60573544-60576926(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCTC
SmilChr03G001812 Chr03 NC_080389.1:24741370-24741382promoter 内 2699-2711 bp - 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 24738227-24740080(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTCACCTACCTAC
SmilChr02G005384 Chr02 NC_080388.1:74497453-74497465promoter 内 2546-2558 bp - 1443 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 74494794-74496010(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCCC
SmilChr02G003290 Chr02 NC_080388.1:54179431-54179443promoter 内 1802-1814 bp - 2187 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 54181630-54183611(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTAGGTAGGTGGG
SmilChr01G001743 Chr01 NC_080387.1:32121381-32121393promoter 内 1239-1251 bp - 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 32118551-32118631(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCCC
SmilChr01G004772 Chr01 NC_080387.1:65911778-65911790promoter 内 1114-1126 bp - 2875 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 2 65905160-65908903(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCTC
SmilChr04G000866 Chr04 NC_080390.1:10945348-10945360promoter 内 2956-2968 bp + 1033 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 10946393-10946463(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCCC
SmilChr04G000867 Chr04 NC_080390.1:10945348-10945360promoter 内 2802-2814 bp + 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 10946547-10947483(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCCC
SmilChr04G001582 Chr04 NC_080390.1:26303830-26303842promoter 内 2368-2380 bp - 1621 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 26301584-26302209(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCCC
SmilChr03G002616 Chr03 NC_080389.1:41569709-41569721promoter 内 1628-1640 bp + 2361 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 41563902-41567348(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAGGGTAGGTGGA
SmilChr04G000868 Chr04 NC_080390.1:10945348-10945360promoter 内 1542-1554 bp + 2447 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 10947807-10957469(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTCACCTACCCCC
SmilChr01G005316 Chr01 NC_080387.1:70403705-70403717promoter 内 1305-1317 bp + 2684 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.2/ 100 1 70406401-70406994(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCCCC
SmilChr05G001480 Chr05 NC_080391.1:13578618-13578630promoter 内 23-35 bp - 3966 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 4 13572886-13574652(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCT
SmilChr03G003604 Chr03 NC_080389.1:54682679-54682691promoter 内 3206-3218 bp - 783 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 3 54683474-54684649(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAGGTAGGTGGA
SmilChr02G002872 Chr02 NC_080388.1:48965302-48965314promoter 内 2321-2333 bp - 1668 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 3 48957194-48963634(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCT
SmilChr04G003628 Chr04 NC_080390.1:52791167-52791179promoter 内 904-916 bp - 3085 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 3 52780274-52788082(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTCT
SmilChr01G003198 Chr01 NC_080387.1:50748842-50748854promoter 内 286-298 bp + 3703 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 3 50752557-50757349(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCTACCTACCCTC
SmilChr02G002820 Chr02 NC_080388.1:48291753-48291765promoter 内 3975-3987 bp + 14 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 48291014-48291739(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTGGA
SmilChr01G005630 Chr01 NC_080387.1:72750410-72750422promoter 内 3750-3762 bp - 239 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 72746687-72750171(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TCCACCTACCTTT
SmilChr01G003195 Chr01 NC_080387.1:50709275-50709287promoter 内 2509-2521 bp + 1480 bp 位于靶基因 TSS 上游 99.1/ 100 2 50705893-50707795(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGTGGTAGGTGAA