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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 25 / 148 下载 TSV

上一页 25 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G002492 Chr05 NC_080391.1:27605864-27605877promoter 内 57-70 bp - 3931 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 27597530-27601933(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TAAGGGTCACGTGG
SmilChr03G004654 Chr03 NC_080389.1:64052707-64052720promoter 内 50-63 bp + 3938 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 64056658-64059498(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGCATCACACGTGG
SmilChr03G003544 Chr03 NC_080389.1:54086392-54086405promoter 内 21-34 bp + 3967 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 54081136-54082425(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTGCCC
SmilChr04G003745 Chr04 NC_080390.1:53743757-53743770promoter 内 4-17 bp + 3984 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 53747754-53748552(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGGCTGCACGTGG
SmilChr06G000015 Chr06 NC_080392.1:236958-236971promoter 内 3973-3986 bp + 15 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 236986-242359(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATAGCGGCACGTGG
SmilChr08G000410 Chr08 NC_080394.1:2884372-2884385promoter 内 3915-3928 bp + 73 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 2881587-2884299(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGATCC
SmilChr08G001287 Chr08 NC_080394.1:10256482-10256495promoter 内 3825-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 10256658-10269334(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGGGCGTCACGTGT
SmilChr02G004555 Chr02 NC_080388.1:68082100-68082113promoter 内 3820-3833 bp + 168 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 68078785-68081932(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGGGCA
SmilChr01G000460 Chr01 NC_080387.1:9425854-9425867promoter 内 3782-3795 bp + 206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 9423489-9425648(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACGCGAC
SmilChr04G001251 Chr04 NC_080390.1:19736621-19736634promoter 内 3733-3746 bp + 255 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 19733491-19736366(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGACCTTAA
SmilChr07G003990 Chr07 NC_080393.1:50963346-50963359promoter 内 3148-3161 bp - 840 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 50956390-50962506(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTAGGCCACGTGG
SmilChr05G002128 Chr05 NC_080391.1:22384094-22384107promoter 内 2403-2416 bp + 1585 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 22373997-22382509(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCACACT
SmilChr01G003165 Chr01 NC_080387.1:50460441-50460454promoter 内 2315-2328 bp - 1673 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 50455202-50458768(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAGGGTCACGTGA
SmilChr05G002129 Chr05 NC_080391.1:22384094-22384107promoter 内 2054-2067 bp + 1934 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 22386041-22394554(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGTGTGCCACGTGG
SmilChr06G000698 Chr06 NC_080392.1:6209732-6209745promoter 内 1238-1251 bp + 2750 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 6212495-6216121(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGTCACGTGG
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SmilChr03G001581 Chr03 NC_080389.1:19972043-19972056promoter 内 546-559 bp + 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 19967704-19968601(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCATTCT
SmilChr02G005511 Chr02 NC_080388.1:75231382-75231395promoter 内 379-392 bp - 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 2 75235004-75238347(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTGAA
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SmilChr05G000293 Chr05 NC_080391.1:2235020-2235033promoter 内 3931-3944 bp - 57 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 2235090-2237980(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGTGTT
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SmilChr01G002386 Chr01 NC_080387.1:41108733-41108746promoter 内 3601-3614 bp - 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 41098661-41108346(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGATGTCACGTGG
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SmilChr05G001251 Chr05 NC_080391.1:10641651-10641664promoter 内 3597-3610 bp + 391 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 10642055-10645817(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GACAAGACACGTGG
SmilChr02G003160 Chr02 NC_080388.1:52650378-52650391promoter 内 3566-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 52650813-52654043(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGGGCA
SmilChr06G002307 Chr06 NC_080392.1:33300992-33301005promoter 内 2994-3007 bp + 994 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 33301999-33302712(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGATGTCACGTGG
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SmilChr03G003720 Chr03 NC_080389.1:56216815-56216828promoter 内 2632-2645 bp - 1356 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 56212604-56215459(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GAGCGGTCACGTGG
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SmilChr05G002915 Chr05 NC_080391.1:35119871-35119884promoter 内 2146-2159 bp - 1842 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 35121726-35124335(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACGCCAC
SmilChr05G003753 Chr05 NC_080391.1:50667469-50667482promoter 内 2091-2104 bp - 1897 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 50669379-50674671(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCTCAA
SmilChr05G002279 Chr05 NC_080391.1:24502080-24502093promoter 内 1734-1747 bp + 2254 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 24498377-24499826(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTTCCC
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SmilChr08G000830 Chr08 NC_080394.1:6144804-6144817promoter 内 1489-1502 bp - 2499 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 6138744-6142305(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGATGTCACGTGG
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SmilChr03G000632 Chr03 NC_080389.1:6966094-6966107promoter 内 1488-1501 bp + 2500 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 6968607-6972166(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGATGTCACGTGG
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SmilChr05G004177 Chr05 NC_080391.1:55700705-55700718promoter 内 841-854 bp + 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 55694135-55697558(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCCTACG
SmilChr03G000623 Chr03 NC_080389.1:6883259-6883272promoter 内 632-645 bp + 3356 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 1 6886628-6890764(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGAATGGCACGTGG
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SmilChr03G003421 Chr03 NC_080389.1:52541585-52541598promoter 内 1644-1657 bp - 2344 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 4 52543942-52546964(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACTCCTC
SmilChr01G003498 Chr01 NC_080387.1:53583920-53583933promoter 内 3276-3289 bp - 712 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 53580587-53583208(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAGGCCACGTGG
SmilChr01G003497 Chr01 NC_080387.1:53573724-53573737promoter 内 3275-3288 bp - 713 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.9/ 100 3 53570372-53573011(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AAGAGGCCACGTGG