转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 27 / 143 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G002171 Chr04 NC_080390.1:35064574-35064585promoter 内 3053-3064 bp - 937 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 35059452-35063637(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTG
SmilChr05G002411 Chr05 NC_080391.1:26623329-26623340promoter 内 2945-2956 bp - 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 26620663-26622284(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGTG
SmilChr02G002865 Chr02 NC_080388.1:48818050-48818061promoter 内 2886-2897 bp + 1104 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 48813301-48816946(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCTT
SmilChr02G002567 Chr02 NC_080388.1:44667382-44667393promoter 内 2817-2828 bp + 1173 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 44668566-44675433(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGGG
SmilChr03G003270 Chr03 NC_080389.1:50647991-50648002promoter 内 2760-2771 bp - 1230 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 50645629-50646761(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCGT
SmilChr08G001361 Chr08 NC_080394.1:10883680-10883691promoter 内 2471-2482 bp - 1519 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 10882086-10882161(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTG
SmilChr08G001967 Chr08 NC_080394.1:17352062-17352073promoter 内 2436-2447 bp + 1554 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 17353627-17353710(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTCGG
SmilChr08G001806 Chr08 NC_080394.1:15248019-15248030promoter 内 2303-2314 bp - 1687 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 15249717-15253031(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAC
SmilChr04G000984 Chr04 NC_080390.1:13311070-13311081promoter 内 2178-2189 bp - 1812 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 13312893-13392871(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCCA
SmilChr08G001888 Chr08 NC_080394.1:16397298-16397309promoter 内 2101-2112 bp - 1889 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 16389058-16395409(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGGG
SmilChr08G000929 Chr08 NC_080394.1:6877514-6877525promoter 内 1971-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 6879544-6879969(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTGAT
SmilChr07G000578 Chr07 NC_080393.1:3923683-3923694promoter 内 1752-1763 bp + 2238 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 3925932-3927849(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTG
SmilChr02G002244 Chr02 NC_080388.1:39860150-39860161promoter 内 1680-1691 bp + 2310 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 39856971-39857840(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAC
SmilChr08G001360 Chr08 NC_080394.1:10883680-10883691promoter 内 1034-1045 bp - 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 10878565-10880724(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTG
SmilChr04G000616 Chr04 NC_080390.1:6956967-6956978promoter 内 924-935 bp + 3066 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 6960044-6962334(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGGG
SmilChr06G000673 Chr06 NC_080392.1:5960103-5960114promoter 内 452-463 bp + 3538 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 5963652-5967204(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGTG
SmilChr08G000848 Chr08 NC_080394.1:6292043-6292054promoter 内 184-195 bp - 3806 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 6285638-6288237(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGGG
SmilChr08G001891 Chr08 NC_080394.1:16397298-16397309promoter 内 83-94 bp - 3907 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.1/ 100 1 16401216-16403091(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCCAGCTGTCCA
SmilChr03G000014 Chr03 NC_080389.1:142792-142803promoter 内 3204-3215 bp - 786 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 6 143589-147616(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G001309 Chr03 NC_080389.1:15382641-15382652promoter 内 3830-3841 bp - 160 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 15382812-15388809(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G003578 Chr01 NC_080387.1:54365285-54365296promoter 内 3513-3524 bp - 477 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 54365773-54368215(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G002359 Chr01 NC_080387.1:40760106-40760117promoter 内 2966-2977 bp - 1024 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 40761141-40763492(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr06G002452 Chr06 NC_080392.1:35294427-35294438promoter 内 2526-2537 bp - 1464 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 35292440-35292963(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTCCAGCTGTT
SmilChr08G000127 Chr08 NC_080394.1:792466-792477promoter 内 2519-2530 bp + 1471 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 793948-796125(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr06G000691 Chr06 NC_080392.1:6126539-6126550promoter 内 2440-2451 bp + 1550 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 6123519-6124989(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr08G002798 Chr08 NC_080394.1:27716041-27716052promoter 内 2163-2174 bp + 1827 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 27709117-27714214(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr06G000692 Chr06 NC_080392.1:6126740-6126751promoter 内 1995-2006 bp - 1995 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 6128746-6132215(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G003467 Chr02 NC_080388.1:55970474-55970485promoter 内 1681-1692 bp - 2309 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 55972794-55975525(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G004010 Chr01 NC_080387.1:58510524-58510535promoter 内 855-866 bp - 3135 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 58513670-58514897(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr07G000957 Chr07 NC_080393.1:6891336-6891347promoter 内 830-841 bp - 3160 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 6894507-6896271(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G003577 Chr01 NC_080387.1:54364931-54364942promoter 内 546-557 bp + 3444 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 54360728-54361487(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G002525 Chr01 NC_080387.1:43221264-43221275promoter 内 434-445 bp - 3556 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 43224831-43231129(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr08G000302 Chr08 NC_080394.1:2121596-2121607promoter 内 404-415 bp + 3586 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 2114067-2118010(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G000489 Chr03 NC_080389.1:5240143-5240154promoter 内 102-113 bp - 3888 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 4 5244042-5245091(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AACAGCTGTCTA
SmilChr06G000052 Chr06 NC_080392.1:423522-423533promoter 内 3978-3989 bp - 12 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 423545-428023(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAA
SmilChr04G002819 Chr04 NC_080390.1:44252229-44252240promoter 内 3878-3889 bp + 112 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 44250277-44252117(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G002127 Chr01 NC_080387.1:37279145-37279156promoter 内 3855-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 37279291-37283213(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G003267 Chr02 NC_080388.1:53936669-53936680promoter 内 3791-3802 bp - 199 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 53936879-53938637(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr03G004001 Chr03 NC_080389.1:59043278-59043289promoter 内 3765-3776 bp + 225 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 59038436-59043053(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G003093 Chr02 NC_080388.1:51792864-51792875promoter 内 3524-3535 bp - 466 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 51789092-51792398(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr08G000092 Chr08 NC_080394.1:566694-566705promoter 内 3338-3349 bp - 652 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 567357-569880(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr05G001123 Chr05 NC_080391.1:9362373-9362384promoter 内 3143-3154 bp + 847 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 9361403-9361526(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCGA
SmilChr06G001472 Chr06 NC_080392.1:15631637-15631648promoter 内 3106-3117 bp + 884 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 15628100-15630753(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr01G004396 Chr01 NC_080387.1:62111345-62111356promoter 内 3073-3084 bp - 917 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 62112273-62113970(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGCTG
SmilChr05G001127 Chr05 NC_080391.1:9414473-9414484promoter 内 3044-3055 bp - 946 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 9415430-9416966(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr02G003074 Chr02 NC_080388.1:51641981-51641992promoter 内 2842-2853 bp - 1148 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 51643140-51644435(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr04G000158 Chr04 NC_080390.1:1383240-1383251promoter 内 2735-2746 bp - 1255 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 1379306-1381985(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr07G001225 Chr07 NC_080393.1:9384852-9384863promoter 内 2700-2711 bp + 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 9386153-9387172(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTATC
SmilChr03G003320 Chr03 NC_080389.1:51433917-51433928promoter 内 2292-2303 bp + 1698 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 51430424-51432219(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA
SmilChr08G001482 Chr08 NC_080394.1:11944751-11944762promoter 内 2185-2196 bp - 1805 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.0/ 100 3 11946567-11952822(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCAA