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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G002277; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003292-RA_Salv SmilChr05G002277 ERF XP_057809665.1 MP00452 TCTTTGCCGACATCA

可能结合的靶基因

7783 个结合位点 6671 个候选靶基因 第 27 / 134 下载 TSV

上一页 27 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G000497 Chr07 NC_080393.1:3459874-3459888promoter 内 569-583 bp - 3418 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 3463306-3471702(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGTGTCGGCGCCGC
SmilChr02G003907 Chr02 NC_080388.1:61123625-61123639promoter 内 506-520 bp - 3481 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 61127120-61129344(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TAATGTCGGCGTCGA
SmilChr01G000864 Chr01 NC_080387.1:18545105-18545119promoter 内 436-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 18540699-18541554(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTCTCGCCGACAACA
SmilChr01G000866 Chr01 NC_080387.1:18548956-18548970promoter 内 436-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 18544550-18545405(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTCTCGCCGACAACA
SmilChr07G004033 Chr07 NC_080393.1:51507495-51507509promoter 内 310-324 bp + 3677 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 51511186-51512423(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCGTTGCCGACACAG
SmilChr05G003193 Chr05 NC_080391.1:40832222-40832236promoter 内 308-322 bp - 3679 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 40827707-40828543(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAATCACCGACATAA
SmilChr02G004922 Chr02 NC_080388.1:71246858-71246872promoter 内 257-271 bp - 3730 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 71241643-71243128(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TTGTTGCCGACGTCG
SmilChr07G000738 Chr07 NC_080393.1:5143291-5143305promoter 内 89-103 bp - 3898 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.5/ 100 1 5138830-5139393(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CTATGGCCGACATTG
SmilChr07G003301 Chr07 NC_080393.1:34868651-34868665promoter 内 3456-3470 bp - 531 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 3 34869196-34874379(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCATGTCGGCTATGA
SmilChr01G000960 Chr01 NC_080387.1:20315954-20315968promoter 内 3708-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 20316247-20317386(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CAATGTCGGCCCCGC
SmilChr07G003819 Chr07 NC_080393.1:47173668-47173682promoter 内 3519-3533 bp - 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 47171743-47173200(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCATAGCCGACATGG
SmilChr02G003711 Chr02 NC_080388.1:58688915-58688929promoter 内 3409-3423 bp + 578 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 58689507-58689580(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCGCCGCCGACAAAT
SmilChr08G004765 Chr08 NC_080394.1:57007488-57007502promoter 内 3087-3101 bp - 900 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 57005684-57006588(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGTCGCCGACAAGA
SmilChr08G004286 Chr08 NC_080394.1:52554943-52554957promoter 内 2340-2354 bp - 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 52556604-52557877(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCTTGTCGGCGACGC
SmilChr08G004216 Chr08 NC_080394.1:51549503-51549517promoter 内 2135-2149 bp + 1852 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 51544308-51547651(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CGGTGTCGGCACTGG
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SmilChr05G003120 Chr05 NC_080391.1:39821791-39821805promoter 内 869-883 bp - 3118 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 39818191-39818673(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 GCGTCGCCGACAAGA
SmilChr02G000168 Chr02 NC_080388.1:2169818-2169832promoter 内 136-150 bp - 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 2173683-2177646(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGATGTCGGTGCTTG
SmilChr02G002296 Chr02 NC_080388.1:40498893-40498907promoter 内 28-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 40502866-40506043(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 AGATGGCCGACATAG
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SmilChr04G000491 Chr04 NC_080390.1:5339987-5340001promoter 内 3956-3970 bp - 31 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5340032-5340947(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TGGTGTCGGCAGAAG
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SmilChr02G001453 Chr02 NC_080388.1:27193489-27193503promoter 内 3830-3844 bp + 157 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 27193660-27194373(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CATCGGCCGACATAT
SmilChr03G000675 Chr03 NC_080389.1:7549016-7549030promoter 内 3755-3769 bp - 232 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 7546223-7548784(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CATCCACCGACATTA
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SmilChr07G002586 Chr07 NC_080393.1:24741417-24741431promoter 内 3524-3538 bp + 463 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 24741894-24742828(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 CCAATACCGACATCC
SmilChr08G004019 Chr08 NC_080394.1:48628693-48628707promoter 内 3519-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 48629175-48630323(+) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 TCATAGCCGACATGG
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SmilChr07G000795 Chr07 NC_080393.1:5619186-5619200promoter 内 2312-2326 bp + 1675 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 5616209-5617511(-) SMil_00003292-RA_Salv MP00452 ATTTGTCGGCGGCGG