转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 3 / 133 下载 TSV

上一页 3 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000125 Chr02 NC_080388.1:1702255-1702269promoter 内 970-984 bp + 3017 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 1705286-1708522(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGATTAT
SmilChr02G004659 Chr02 NC_080388.1:69002090-69002104promoter 内 894-908 bp + 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 68990617-68998997(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTAATCTTATCCTTT
SmilChr02G003852 Chr02 NC_080388.1:60294024-60294038promoter 内 687-701 bp - 3300 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 2 60290627-60290724(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTAAT
SmilChr02G003332 Chr02 NC_080388.1:54562564-54562578promoter 内 2712-2726 bp - 1275 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 54563853-54572590(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAATCTTATCCTCA
SmilChr02G001471 Chr02 NC_080388.1:27454269-27454283promoter 内 580-594 bp + 3407 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.5/ 100 1 27457690-27459733(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAAGATTAT
SmilChr02G002679 Chr02 NC_080388.1:46379547-46379561promoter 内 2185-2199 bp - 1802 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 3 46381363-46381773(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTACCTTATCCTAA
SmilChr01G005520 Chr01 NC_080387.1:72010902-72010916promoter 内 3116-3130 bp + 871 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 72007360-72010031(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATATCCTTATCCTAA
SmilChr01G003507 Chr01 NC_080387.1:53646517-53646531promoter 内 2903-2917 bp + 1084 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 53647615-53653795(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGGATAAGATTAG
SmilChr01G001120 Chr01 NC_080387.1:22824707-22824721promoter 内 2808-2822 bp - 1179 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 22825900-22826668(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATTCTTATCCACA
SmilChr01G001613 Chr01 NC_080387.1:30264910-30264924promoter 内 2771-2785 bp - 1216 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 30259574-30263694(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATCGGATAAGGTTGG
SmilChr02G005232 Chr02 NC_080388.1:73513158-73513172promoter 内 2104-2118 bp - 1883 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 73515055-73516164(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CAAATCTTATCCAAT
SmilChr02G005372 Chr02 NC_080388.1:74407605-74407619promoter 内 1301-1315 bp - 2686 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 74410305-74412582(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTAATCTTATCCTAT
SmilChr02G002845 Chr02 NC_080388.1:48591071-48591085promoter 内 733-747 bp + 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 48594339-48599625(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAGGGTAT
SmilChr01G003611 Chr01 NC_080387.1:54656981-54656995promoter 内 715-729 bp + 3272 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 2 54660267-54661448(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAGGATAAGATTAG
SmilChr01G003129 Chr01 NC_080387.1:50121720-50121734promoter 内 3252-3266 bp - 735 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 50118234-50120985(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGGATAT
SmilChr02G000589 Chr02 NC_080388.1:8445717-8445731promoter 内 3106-3120 bp + 881 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 8446612-8447289(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAGAATGG
SmilChr01G002876 Chr01 NC_080387.1:47345323-47345337promoter 内 3020-3034 bp - 967 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 47346304-47347005(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCATTCTTATCCACA
SmilChr02G004575 Chr02 NC_080388.1:68249839-68249853promoter 内 2803-2817 bp + 1184 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 68251037-68253803(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGATTAA
SmilChr02G002858 Chr02 NC_080388.1:48770504-48770518promoter 内 2783-2797 bp + 1204 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 48771722-48772641(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGATTTG
SmilChr02G002734 Chr02 NC_080388.1:47288618-47288632promoter 内 2537-2551 bp - 1450 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 47286408-47287168(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGATAA
SmilChr02G004574 Chr02 NC_080388.1:68249839-68249853promoter 内 1386-1400 bp + 2601 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 68246240-68247238(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAATCTTATCCAAA
SmilChr02G001148 Chr02 NC_080388.1:20883850-20883864promoter 内 1296-1310 bp + 2691 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 20878858-20881159(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCTTCCTTATCCACT
SmilChr02G002735 Chr02 NC_080388.1:47288618-47288632promoter 内 1171-1185 bp - 2816 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 47291448-47294412(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTATCCTTATCCAAT
SmilChr02G003863 Chr02 NC_080388.1:60578404-60578418promoter 内 873-887 bp + 3114 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 60574796-60575290(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATACCCTTATCCACA
SmilChr01G004571 Chr01 NC_080387.1:63764520-63764534promoter 内 719-733 bp + 3268 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 63767802-63779065(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTCGGATAAGGTTTG
SmilChr02G002640 Chr02 NC_080388.1:45795662-45795676promoter 内 618-632 bp - 3369 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45799045-45801818(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAATCCTTATCCTCT
SmilChr02G002595 Chr02 NC_080388.1:45097248-45097262promoter 内 587-601 bp - 3400 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 45100662-45103349(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TAATCCTTATCCTCT
SmilChr01G004640 Chr01 NC_080387.1:64443065-64443079promoter 内 522-536 bp - 3465 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.4/ 100 1 64446544-64447775(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CAAATCTTATCCATT
SmilChr03G000661 Chr03 NC_080389.1:7400369-7400383promoter 内 3420-3434 bp - 567 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 5 7396237-7399802(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr02G000002 Chr02 NC_080388.1:21439-21453promoter 内 3725-3739 bp - 262 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 4 18658-21177(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATAGATAAGGTTTG
SmilChr02G001322 Chr02 NC_080388.1:24561178-24561192promoter 内 3879-3893 bp + 108 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 24561300-24564946(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr01G001028 Chr01 NC_080387.1:21429693-21429707promoter 内 3802-3816 bp - 185 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 21425967-21429508(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr01G002426 Chr01 NC_080387.1:41796724-41796738promoter 内 3559-3573 bp - 428 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 41792986-41796296(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr03G001174 Chr03 NC_080389.1:13496965-13496979promoter 内 3191-3205 bp + 796 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 13497775-13500713(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr03G001173 Chr03 NC_080389.1:13486657-13486671promoter 内 3186-3200 bp + 801 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 13487472-13490429(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr03G001172 Chr03 NC_080389.1:13476348-13476362promoter 内 3184-3198 bp + 803 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 13477165-13480092(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr03G001543 Chr03 NC_080389.1:19360272-19360286promoter 内 3145-3159 bp + 842 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 19361128-19363921(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGTTCA
SmilChr02G002800 Chr02 NC_080388.1:48095457-48095471promoter 内 2439-2453 bp + 1548 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 3 48092925-48093909(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTATCCTTATCCTTA
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SmilChr03G000328 Chr03 NC_080389.1:3741916-3741930promoter 内 2123-2137 bp - 1864 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 3738629-3740052(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGGATAA
SmilChr01G003049 Chr01 NC_080387.1:49459205-49459219promoter 内 1882-1896 bp + 2105 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 49452411-49457100(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTATCCTTATCCTTA
SmilChr02G000628 Chr02 NC_080388.1:9452589-9452603promoter 内 1197-1211 bp - 2790 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 2 9455393-9456815(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCTACCTTATCCATT
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SmilChr02G004707 Chr02 NC_080388.1:69359662-69359676promoter 内 238-252 bp - 3749 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.3/ 100 1 69353201-69355913(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAAGGATTT
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SmilChr02G002701 Chr02 NC_080388.1:46843036-46843050promoter 内 1058-1072 bp - 2929 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 4 46845979-46850611(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAATCTTATCCTTA