转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 34 / 148 下载 TSV

上一页 34 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G003922 Chr02 NC_080388.1:61289366-61289379promoter 内 1271-1284 bp - 2717 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 61292096-61295382(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr05G000074 Chr05 NC_080391.1:378088-378101promoter 内 1132-1145 bp + 2856 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 374250-375232(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr04G003767 Chr04 NC_080390.1:53895670-53895683promoter 内 1095-1108 bp + 2893 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 53898576-53900830(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CTCGTGCCACGTGG
SmilChr08G000641 Chr08 NC_080394.1:4767588-4767601promoter 内 1060-1073 bp - 2928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 4770529-4787827(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr01G005877 Chr01 NC_080387.1:74708430-74708443promoter 内 1032-1045 bp - 2956 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 74711399-74715640(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAATGCC
SmilChr05G003072 Chr05 NC_080391.1:38656150-38656163promoter 内 994-1007 bp + 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 38651653-38653156(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr02G003591 Chr02 NC_080388.1:57124984-57124997promoter 内 950-963 bp + 3038 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 57117669-57121946(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr07G000669 Chr07 NC_080393.1:4533016-4533029promoter 内 845-858 bp + 3143 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 4536172-4538600(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
SmilChr07G001358 Chr07 NC_080393.1:10524049-10524062promoter 内 814-827 bp + 3174 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 10527236-10531327(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATGCGACACGTGG
SmilChr06G001465 Chr06 NC_080392.1:15501458-15501471promoter 内 769-782 bp - 3219 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 15504690-15511861(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr02G003801 Chr02 NC_080388.1:59642222-59642235promoter 内 717-730 bp + 3271 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 59636699-59638951(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr02G002874 Chr02 NC_080388.1:49000255-49000268promoter 内 679-692 bp + 3309 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 48993750-48996946(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGGTGCA
SmilChr05G001232 Chr05 NC_080391.1:10418497-10418510promoter 内 546-559 bp - 3442 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 10407889-10415055(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
SmilChr03G003877 Chr03 NC_080389.1:57877554-57877567promoter 内 539-552 bp + 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 57881016-57883408(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGTCGCCACGTGG
SmilChr04G000692 Chr04 NC_080390.1:8061881-8061894promoter 内 533-546 bp - 3455 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 8065349-8070174(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr07G002948 Chr07 NC_080393.1:29873056-29873069promoter 内 468-481 bp + 3520 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 29876589-29879014(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
SmilChr08G001151 Chr08 NC_080394.1:9093941-9093954promoter 内 390-403 bp - 3598 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 9088431-9090343(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
SmilChr04G000691 Chr04 NC_080390.1:8041739-8041752promoter 内 352-365 bp - 3636 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 8045388-8050027(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr05G000388 Chr05 NC_080391.1:2922803-2922816promoter 内 332-345 bp - 3656 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 2915053-2919147(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
SmilChr02G004093 Chr02 NC_080388.1:63223772-63223785promoter 内 82-95 bp - 3906 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 63216526-63219866(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
SmilChr04G001877 Chr04 NC_080390.1:30643832-30643845promoter 内 60-73 bp - 3928 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 2 30647773-30649053(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr01G004951 Chr01 NC_080387.1:67592999-67593012promoter 内 3921-3934 bp + 67 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 67590086-67592932(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ACACGTGACTCACC
SmilChr07G001370 Chr07 NC_080393.1:10630914-10630927promoter 内 3919-3932 bp + 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 10629835-10630845(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCATT
SmilChr08G001191 Chr08 NC_080394.1:9561528-9561541promoter 内 3863-3876 bp - 125 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 9561666-9566749(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCATCAT
SmilChr06G002214 Chr06 NC_080392.1:30948709-30948722promoter 内 3760-3773 bp - 228 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 30948950-30949426(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCATCAT
SmilChr02G003242 Chr02 NC_080388.1:53699373-53699386promoter 内 3672-3685 bp - 316 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 53699702-53702986(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCATAAC
SmilChr07G000814 Chr07 NC_080393.1:5743412-5743425promoter 内 3659-3672 bp + 329 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5741070-5743083(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCATCAT
SmilChr06G000054 Chr06 NC_080392.1:436420-436433promoter 内 3608-3621 bp + 380 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 436813-439893(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGGTCGTCACGTGA
SmilChr02G002306 Chr02 NC_080388.1:40683849-40683862promoter 内 3605-3618 bp + 383 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 40684245-40687671(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGGTTGACACGTGG
SmilChr05G004247 Chr05 NC_080391.1:56271797-56271810promoter 内 3601-3614 bp + 387 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 56272197-56273003(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTGATGACACGTGG
SmilChr04G003731 Chr04 NC_080390.1:53625521-53625534promoter 内 3233-3246 bp - 755 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 53626289-53630182(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACACTTC
SmilChr04G003000 Chr04 NC_080390.1:46404953-46404966promoter 内 3173-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 46401567-46404138(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCATT
SmilChr05G001359 Chr05 NC_080391.1:12094940-12094953promoter 内 3016-3029 bp - 972 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 12095925-12100864(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCATT
SmilChr05G002854 Chr05 NC_080391.1:34042428-34042441promoter 内 2982-2995 bp + 1006 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 34043447-34045370(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGATGGACACGTGG
SmilChr03G002207 Chr03 NC_080389.1:34771476-34771489promoter 内 2834-2847 bp - 1154 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 34772643-34776230(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATC
SmilChr07G000927 Chr07 NC_080393.1:6619260-6619273promoter 内 2764-2777 bp - 1224 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 6613962-6618036(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATGATGGCACGTGG
SmilChr07G003973 Chr07 NC_080393.1:50583532-50583545promoter 内 2721-2734 bp - 1267 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 50572345-50582265(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
SmilChr08G000221 Chr08 NC_080394.1:1498943-1498956promoter 内 2705-2718 bp - 1283 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1500239-1502572(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGATCCCCC
SmilChr04G000217 Chr04 NC_080390.1:1906789-1906802promoter 内 2523-2536 bp + 1465 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 1903660-1905324(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCGCTGCG
SmilChr04G003216 Chr04 NC_080390.1:48988380-48988393promoter 内 2414-2427 bp - 1574 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 48989967-48992451(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCGCATT
SmilChr06G002600 Chr06 NC_080392.1:37370974-37370987promoter 内 2198-2211 bp + 1790 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 37367679-37369184(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACGTA
SmilChr07G001376 Chr07 NC_080393.1:10692738-10692751promoter 内 1842-1855 bp - 2146 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 10678577-10690592(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTTATGACACGTGG
SmilChr04G003542 Chr04 NC_080390.1:51775291-51775304promoter 内 1757-1770 bp - 2231 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 51769028-51773060(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCACCCCACGTGG
SmilChr06G000634 Chr06 NC_080392.1:5598664-5598677promoter 内 1662-1675 bp + 2326 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5601003-5601076(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GGAGGAACACGTGG
SmilChr04G001348 Chr04 NC_080390.1:21860214-21860227promoter 内 1569-1582 bp + 2419 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 21862646-21872150(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATACGCCACGTGG
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SmilChr02G003531 Chr02 NC_080388.1:56468336-56468349promoter 内 1388-1401 bp + 2600 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 56460525-56465736(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTGTCCCA
SmilChr06G000633 Chr06 NC_080392.1:5598664-5598677promoter 内 1260-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 5595075-5595936(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTTCCTCC
SmilChr01G005233 Chr01 NC_080387.1:69909460-69909473promoter 内 1161-1174 bp - 2827 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 69912300-69919203(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCATCAT
SmilChr01G005449 Chr01 NC_080387.1:71556026-71556039promoter 内 929-942 bp - 3059 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.3/ 100 1 71559098-71562935(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCCATCT