转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G000260; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00013647-RA_Salv SmilChr05G000260 bZIP XP_057763683.1 MP00040 TGCTGACGTGGC

可能结合的靶基因

9919 个结合位点 6920 个候选靶基因 第 35 / 139 下载 TSV

上一页 35 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G002941 Chr03 NC_080389.1:46122846-46122857promoter 内 929-940 bp - 3061 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 46125918-46129920(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACCACGTCTGCA
SmilChr03G003730 Chr03 NC_080389.1:56328565-56328576promoter 内 825-836 bp + 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 56331741-56336354(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCATCACGTGGC
SmilChr05G000279 Chr05 NC_080391.1:2172434-2172445promoter 内 3552-3563 bp + 438 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 2169076-2171996(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGACGT
SmilChr01G000702 Chr01 NC_080387.1:15746744-15746755promoter 内 3404-3415 bp + 586 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 15745337-15746158(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr01G000339 Chr01 NC_080387.1:6938238-6938249promoter 内 3366-3377 bp + 624 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 6938873-6941858(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGGACACGTGGC
SmilChr05G000277 Chr05 NC_080391.1:2151190-2151201promoter 内 3356-3367 bp - 634 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 2151835-2153768(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCCC
SmilChr02G004301 Chr02 NC_080388.1:65382079-65382090promoter 内 3331-3342 bp - 659 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 65382749-65386575(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGACGT
SmilChr03G003220 Chr03 NC_080389.1:49835978-49835989promoter 内 3297-3308 bp + 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49833183-49835285(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCCC
SmilChr05G000257 Chr05 NC_080391.1:1975990-1976001promoter 内 3297-3308 bp - 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 1971415-1975297(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGGACACGTGGC
SmilChr04G002094 Chr04 NC_080390.1:33766465-33766476promoter 内 3241-3252 bp + 749 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 33767225-33771228(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GTGTCACGTGGC
SmilChr01G000778 Chr01 NC_080387.1:16979981-16979992promoter 内 3231-3242 bp - 759 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 16980751-16982877(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr03G002805 Chr03 NC_080389.1:44517455-44517466promoter 内 3213-3224 bp - 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44518243-44519190(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr01G005529 Chr01 NC_080387.1:72153920-72153931promoter 内 3103-3114 bp - 887 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72149820-72153033(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGACACGTGGC
SmilChr04G000485 Chr04 NC_080390.1:5236462-5236473promoter 内 2769-2780 bp - 1221 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 5233806-5235241(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTTCACGTGGC
SmilChr03G004519 Chr03 NC_080389.1:63264258-63264269promoter 内 2649-2660 bp - 1341 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 63265610-63268258(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGAAGG
SmilChr01G002540 Chr01 NC_080387.1:43449016-43449027promoter 内 2524-2535 bp - 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 43450493-43453062(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr04G002297 Chr04 NC_080390.1:37229923-37229934promoter 内 2242-2253 bp - 1748 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 37224694-37228175(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGACACGTGGC
SmilChr01G005134 Chr01 NC_080387.1:69143081-69143092promoter 内 2215-2226 bp + 1775 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 69141234-69141306(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TCCACGTCTGCA
SmilChr03G003567 Chr03 NC_080389.1:54324675-54324686promoter 内 2181-2192 bp - 1809 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 54326495-54328615(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TACACGTCAGCG
SmilChr01G005647 Chr01 NC_080387.1:72874759-72874770promoter 内 2162-2173 bp - 1828 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72869032-72872931(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCTTCACGTGGC
SmilChr05G000280 Chr05 NC_080391.1:2172434-2172445promoter 内 2122-2133 bp + 1868 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 2174313-2180007(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 ACGTCACGTGGC
SmilChr03G002803 Chr03 NC_080389.1:44517455-44517466promoter 内 2004-2015 bp - 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 44513519-44515469(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 TGCAGACGTGGA
SmilChr04G000491 Chr04 NC_080390.1:5337852-5337863promoter 内 1821-1832 bp + 2169 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 5340032-5340947(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGACACGTGGC
SmilChr01G000788 Chr01 NC_080387.1:17145756-17145767promoter 内 1819-1830 bp - 2171 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 17141217-17143585(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AGCTGACGTGTG
SmilChr01G001480 Chr01 NC_080387.1:28575720-28575731promoter 内 1776-1787 bp + 2214 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 28572686-28573506(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGACGTCAGGG
SmilChr01G000604 Chr01 NC_080387.1:13154133-13154144promoter 内 1556-1567 bp + 2434 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 13148705-13151699(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCCC
SmilChr01G006172 Chr01 NC_080387.1:77237167-77237178promoter 内 1195-1206 bp - 2795 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 77239973-77247195(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGACAG
SmilChr04G002075 Chr04 NC_080390.1:33497128-33497139promoter 内 1145-1156 bp + 2845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 33487235-33494283(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAGCG
SmilChr01G000609 Chr01 NC_080387.1:13465980-13465991promoter 内 1109-1120 bp + 2881 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 13460631-13463099(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAGCC
SmilChr03G003209 Chr03 NC_080389.1:49688768-49688779promoter 内 1035-1046 bp - 2955 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 49681917-49685813(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTGTT
SmilChr03G003022 Chr03 NC_080389.1:47121997-47122008promoter 内 982-993 bp + 3008 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 47115833-47118989(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGTCCC
SmilChr04G003997 Chr04 NC_080390.1:55339737-55339748promoter 内 869-880 bp + 3121 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 55342869-55345759(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGGACACGTGGC
SmilChr01G005299 Chr01 NC_080387.1:70294238-70294249promoter 内 692-703 bp - 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 70289908-70290940(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CTGTCACGTGGC
SmilChr01G005985 Chr01 NC_080387.1:75487681-75487692promoter 内 577-588 bp + 3413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 75482810-75484268(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACACGTCAGCC
SmilChr02G005477 Chr02 NC_080388.1:74998828-74998839promoter 内 528-539 bp + 3462 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 75002301-75004018(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCTTCACGTGGC
SmilChr02G000632 Chr02 NC_080388.1:9508624-9508635promoter 内 207-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 9512418-9513257(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGACACGTGGC
SmilChr01G005558 Chr01 NC_080387.1:72402153-72402164promoter 内 36-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 72395385-72398199(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GGGACACGTGGC
SmilChr03G001852 Chr03 NC_080389.1:25511948-25511959promoter 内 30-41 bp + 3960 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 1 25507883-25507988(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGACTC
SmilChr01G000172 Chr01 NC_080387.1:2832456-2832467promoter 内 2989-3000 bp + 1001 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 6 2833468-2836431(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGCCACGTGGC
SmilChr01G000173 Chr01 NC_080387.1:2832456-2832467promoter 内 20-31 bp + 3970 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 5 2836437-2840730(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CCGCCACGTGGC
SmilChr03G003212 Chr03 NC_080389.1:49743353-49743364promoter 内 3935-3946 bp - 55 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 49743419-49745671(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAT
SmilChr04G004002 Chr04 NC_080390.1:55370552-55370563promoter 内 3930-3941 bp - 60 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 55365419-55370492(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCGCCACGTGGC
SmilChr02G004391 Chr02 NC_080388.1:66257888-66257899promoter 内 3921-3932 bp - 69 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 66257968-66258586(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGCGC
SmilChr01G000345 Chr01 NC_080387.1:7038747-7038758promoter 内 3827-3838 bp + 163 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 7035909-7038584(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGCGC
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SmilChr02G005384 Chr02 NC_080388.1:74496205-74496216promoter 内 3795-3806 bp + 195 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 74494794-74496010(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGCGC
SmilChr01G002090 Chr01 NC_080387.1:36932243-36932254promoter 内 2785-2796 bp + 1205 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 36929651-36931038(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTCGGAT
SmilChr02G000256 Chr02 NC_080388.1:3288731-3288742promoter 内 2694-2705 bp - 1296 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 3290038-3292845(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 GCCACGTGGCGC
SmilChr03G001305 Chr03 NC_080389.1:15282911-15282922promoter 内 2432-2443 bp - 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 15280207-15281353(-) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 AACCGACGTGGC
SmilChr03G004008 Chr03 NC_080389.1:59085236-59085247promoter 内 2114-2125 bp + 1876 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.7/ 100 3 59087123-59088281(+) SMil_00013647-RA_Salv MP00040 CGCTGACGTCGA