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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G003955; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00019539-RA_Salv SmilChr04G003955 ERF XP_057805828.1 MP00120 GATATTGTCGGTGGT

可能结合的靶基因

7514 个结合位点 6144 个候选靶基因 第 4 / 123 下载 TSV

上一页 4 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G002477 Chr06 NC_080392.1:35605629-35605643promoter 内 2563-2577 bp + 1424 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 35600335-35604205(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACATCTCC
SmilChr06G002956 Chr06 NC_080392.1:42367032-42367046promoter 内 2332-2346 bp - 1655 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 42364787-42365377(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GACGGTGTCGGTGAC
SmilChr02G001324 Chr02 NC_080388.1:24728188-24728202promoter 内 1562-1576 bp + 2425 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 24730627-24732489(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGTGATGTCGGTGGA
SmilChr08G002482 Chr08 NC_080394.1:23725104-23725118promoter 内 2429-2443 bp - 1558 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 23726676-23730900(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCCTGC
SmilChr06G001432 Chr06 NC_080392.1:15135956-15135970promoter 内 2638-2652 bp - 1349 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 15137319-15143468(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGAAGCC
SmilChr06G000926 Chr06 NC_080392.1:8786080-8786094promoter 内 1389-1403 bp + 2598 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 8788692-8797229(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCGGTGTCGGTGCC
SmilChr03G004671 Chr03 NC_080389.1:64166482-64166496promoter 内 3924-3938 bp + 63 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 64166559-64168856(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TGTGTTGTCGGTGGC
SmilChr03G004670 Chr03 NC_080389.1:64166482-64166496promoter 内 3784-3798 bp + 203 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 64163545-64166279(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACAACACA
SmilChr06G001152 Chr06 NC_080392.1:11661162-11661176promoter 内 2932-2946 bp - 1055 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 11662231-11664586(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCCTGC
SmilChr08G002341 Chr08 NC_080394.1:22098156-22098170promoter 内 2728-2742 bp + 1259 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 22092171-22096897(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCCTGC
SmilChr07G000183 Chr07 NC_080393.1:1164527-1164541promoter 内 2619-2633 bp - 1368 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1165909-1169363(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 TCCACCGACGCCTCC
SmilChr02G000403 Chr02 NC_080388.1:4997241-4997255promoter 内 2571-2585 bp - 1416 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 4998671-5001508(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACACCAAG
SmilChr01G000978 Chr01 NC_080387.1:20682216-20682230promoter 内 2345-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 20678587-20680574(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCCTGC
SmilChr01G000649 Chr01 NC_080387.1:14486198-14486212promoter 内 1906-1920 bp + 2081 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 14481123-14484117(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCCTGC
SmilChr08G002761 Chr08 NC_080394.1:27240576-27240590promoter 内 1711-1725 bp - 2276 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 27242866-27245239(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACGCCTGC
SmilChr05G004239 Chr05 NC_080391.1:56216953-56216967promoter 内 1685-1699 bp - 2302 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 56209447-56214651(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTGGCGTCGGTGGC
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SmilChr08G000979 Chr08 NC_080394.1:7351712-7351726promoter 内 959-973 bp - 3028 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 7345181-7348684(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAATTGTCGGTGGT
SmilChr01G005276 Chr01 NC_080387.1:70177020-70177034promoter 内 743-757 bp + 3244 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 70180278-70183704(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GATGATGTCGGTGGC
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SmilChr01G002308 Chr01 NC_080387.1:40010599-40010613promoter 内 312-326 bp + 3675 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 40014288-40021864(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCAGCGTCGGTGGA
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SmilChr06G002593 Chr06 NC_080392.1:37151527-37151541promoter 内 3310-3324 bp + 677 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 37152218-37153747(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTGCTGTCGGTGGT
SmilChr05G003638 Chr05 NC_080391.1:48769394-48769408promoter 内 2774-2788 bp - 1213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 48767218-48768181(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTGCTGTCGGTGGT
SmilChr03G001124 Chr03 NC_080389.1:12931306-12931320promoter 内 739-753 bp + 3248 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 12934568-12937249(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAAGGCGTCGGTGGC
SmilChr03G003507 Chr03 NC_080389.1:53666918-53666932promoter 内 369-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 53670550-53673864(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTGCTGTCGGTGGT
SmilChr02G002056 Chr02 NC_080388.1:37006193-37006207promoter 内 3861-3875 bp - 126 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 37004239-37006067(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTGCTGTCGGTGGT
SmilChr01G001668 Chr01 NC_080387.1:30779447-30779461promoter 内 3576-3590 bp - 411 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 30777945-30779036(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGGAGTGTCGGTGAC
SmilChr04G003725 Chr04 NC_080390.1:53579704-53579718promoter 内 3336-3350 bp - 651 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 53580369-53590344(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACATAACC
SmilChr06G002592 Chr06 NC_080392.1:37146951-37146965promoter 内 3309-3323 bp + 678 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 37147643-37149172(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCTGCTGTCGGTGGT
SmilChr01G001358 Chr01 NC_080387.1:26845829-26845843promoter 内 3097-3111 bp + 890 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 26842068-26844939(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCACCGACACCTCC
SmilChr01G002293 Chr01 NC_080387.1:39773035-39773049promoter 内 2781-2795 bp - 1206 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 39762061-39771829(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGGACTGTCGGTGGT
SmilChr06G000634 Chr06 NC_080392.1:5599259-5599273promoter 内 2257-2271 bp + 1730 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 5601003-5601076(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GACAATGTCGGTGGC
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SmilChr08G004408 Chr08 NC_080394.1:53761232-53761246promoter 内 1780-1794 bp + 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 53757596-53759025(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCACCGACACTGCC
SmilChr01G005303 Chr01 NC_080387.1:70303300-70303314promoter 内 1752-1766 bp + 2235 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 70305549-70306130(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CGAGCTGTCGGTGGC
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SmilChr03G001354 Chr03 NC_080389.1:15905990-15906004promoter 内 1362-1376 bp - 2625 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 15901754-15903365(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GTCGGCGTCGGTGGC
SmilChr02G003505 Chr02 NC_080388.1:56237633-56237647promoter 内 1044-1058 bp - 2943 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 56240590-56243338(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 AGCACCGACACCTCC
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SmilChr03G003214 Chr03 NC_080389.1:49749579-49749593promoter 内 704-718 bp - 3283 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 49752876-49754132(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 CCCACCGACACTACT
SmilChr06G000633 Chr06 NC_080392.1:5599259-5599273promoter 内 664-678 bp + 3323 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 5595075-5595936(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACATTGTC
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SmilChr04G000220 Chr04 NC_080390.1:1910379-1910393promoter 内 626-640 bp + 3361 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 1913754-1916737(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGACTTGTCGGTGGT
SmilChr02G001889 Chr02 NC_080388.1:34187705-34187719promoter 内 332-346 bp - 3655 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 34183245-34184050(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCAGCTGTCGGTGGT
SmilChr02G003151 Chr02 NC_080388.1:52540471-52540485promoter 内 2635-2649 bp - 1352 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 4 52541837-52543643(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 ACCACCGACGCATCC
SmilChr06G001481 Chr06 NC_080392.1:15785838-15785852promoter 内 2953-2967 bp + 1034 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 15786886-15789414(+) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GAATTTGTCGGTGGA
SmilChr02G003604 Chr02 NC_080388.1:57297779-57297793promoter 内 2085-2099 bp + 1902 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 57284584-57295877(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GGCACCGACAACACC
SmilChr05G003331 Chr05 NC_080391.1:43703532-43703546promoter 内 1109-1123 bp + 2878 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 43699371-43700654(-) SMil_00019539-RA_Salv MP00120 GCCACCGACACTAAT