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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 4 / 133 下载 TSV

上一页 4 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G005231 Chr02 NC_080388.1:73508955-73508969promoter 内 3307-3321 bp + 680 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 73504800-73508275(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAATCTTATCCATT
SmilChr03G001638 Chr03 NC_080389.1:21126455-21126469promoter 内 1534-1548 bp - 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 3 21128922-21131369(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAATCTTATCCATT
SmilChr03G000196 Chr03 NC_080389.1:2222807-2222821promoter 内 3885-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 2 2222923-2228958(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAATCTTATCCATT
SmilChr02G002237 Chr02 NC_080388.1:39721946-39721960promoter 内 2744-2758 bp - 1243 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 39715606-39720703(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAAGATTGT
SmilChr01G002909 Chr01 NC_080387.1:47800793-47800807promoter 内 2682-2696 bp - 1305 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 47802112-47805860(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACAATCTTATCCATT
SmilChr03G001388 Chr03 NC_080389.1:16426095-16426109promoter 内 2450-2464 bp - 1537 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 16427646-16428575(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACAGCCTTATCCAAA
SmilChr01G002908 Chr01 NC_080387.1:47800793-47800807promoter 内 1619-1633 bp - 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 47797201-47798425(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAAGATTGT
SmilChr02G000145 Chr02 NC_080388.1:1935341-1935355promoter 内 933-947 bp - 3054 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 1938409-1944296(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACCACCTTATCCATT
SmilChr02G003227 Chr02 NC_080388.1:53530409-53530423promoter 内 226-240 bp - 3761 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.2/ 100 1 53534184-53541115(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACCACCTTATCCATT
SmilChr02G003367 Chr02 NC_080388.1:54796124-54796138promoter 内 3617-3631 bp - 370 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 54788150-54795754(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGATTAA
SmilChr02G000767 Chr02 NC_080388.1:12596045-12596059promoter 内 2694-2708 bp - 1293 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 12589035-12594752(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGATTAA
SmilChr01G000201 Chr01 NC_080387.1:3464545-3464559promoter 内 1603-1617 bp - 2384 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 3466943-3469274(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCAACCTTATCCGGA
SmilChr02G001018 Chr02 NC_080388.1:17953650-17953664promoter 内 253-267 bp + 3734 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 3 17957398-17959035(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGATTGA
SmilChr01G001494 Chr01 NC_080387.1:28769871-28769885promoter 内 3500-3514 bp + 487 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 28770372-28774508(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGAATGG
SmilChr01G000317 Chr01 NC_080387.1:6168691-6168705promoter 内 1080-1094 bp + 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 2 6163128-6165784(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCAATCTTATCCAAT
SmilChr02G000621 Chr02 NC_080388.1:9175157-9175171promoter 内 3713-3727 bp - 274 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 9172242-9174883(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGGATAAGATTAA
SmilChr02G004894 Chr02 NC_080388.1:70965399-70965413promoter 内 3650-3664 bp - 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 70965750-70969187(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCAATCTTATCCAAT
SmilChr02G003795 Chr02 NC_080388.1:59598167-59598181promoter 内 2840-2854 bp + 1147 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 59592143-59597020(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTGACCTTATCCAAA
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SmilChr02G001238 Chr02 NC_080388.1:22749016-22749030promoter 内 2687-2701 bp + 1300 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 22750330-22751232(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGAGGATAAGAATGG
SmilChr01G002766 Chr01 NC_080387.1:46057896-46057910promoter 内 2432-2446 bp - 1555 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 46051009-46056341(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TCCGGATAAGGTTAG
SmilChr02G001816 Chr02 NC_080388.1:33026343-33026357promoter 内 1886-1900 bp - 2101 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 33020235-33024242(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAGAATTG
SmilChr01G003790 Chr01 NC_080387.1:56284796-56284810promoter 内 344-358 bp + 3643 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.1/ 100 1 56288453-56290831(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGATTGA
SmilChr03G000070 Chr03 NC_080389.1:829971-829985promoter 内 3575-3589 bp - 412 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 6 828588-829559(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAAGGATTA
SmilChr01G001464 Chr01 NC_080387.1:28442500-28442514promoter 内 2109-2123 bp + 1878 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 4 28438186-28440622(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAACCTTATCCCTT
SmilChr02G001226 Chr02 NC_080388.1:22544017-22544031promoter 内 3230-3244 bp - 757 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 22542391-22543260(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGCGGATAAGGTGGG
SmilChr01G000555 Chr01 NC_080387.1:11574477-11574491promoter 内 3203-3217 bp - 784 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 11571615-11573693(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGGGATAAGGTTTT
SmilChr03G000258 Chr03 NC_080389.1:3017154-3017168promoter 内 1750-1764 bp - 2237 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 3019405-3042594(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTTACCTTATCCAAA
SmilChr02G001357 Chr02 NC_080388.1:25349933-25349947promoter 内 731-745 bp - 3256 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 25353203-25354734(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTTCCTTATCCAAA
SmilChr02G000853 Chr02 NC_080388.1:14526790-14526804promoter 内 641-655 bp - 3346 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 3 14530150-14530911(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAACCTTATCCCTT
SmilChr01G002823 Chr01 NC_080387.1:46768436-46768450promoter 内 2945-2959 bp - 1042 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 46769492-46771782(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CCAACCTTATCTCCA
SmilChr02G003842 Chr02 NC_080388.1:60155012-60155026promoter 内 2879-2893 bp - 1108 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 60149380-60153904(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAAGATAAT
SmilChr01G004233 Chr01 NC_080387.1:60705354-60705368promoter 内 2767-2781 bp - 1220 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 60701894-60704134(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGCGGATAAGGTTCG
SmilChr03G001178 Chr03 NC_080389.1:13531235-13531249promoter 内 2524-2538 bp + 1463 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 13528672-13529772(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTAGCCTTATCCATT
SmilChr02G000888 Chr02 NC_080388.1:15294989-15295003promoter 内 2336-2350 bp + 1651 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 15289653-15293338(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAACCTTATCCCTT
SmilChr03G000257 Chr03 NC_080389.1:3015997-3016011promoter 内 2237-2251 bp - 1750 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 3011617-3014247(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGGTAAC
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SmilChr01G005965 Chr01 NC_080387.1:75367674-75367688promoter 内 85-99 bp + 3902 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 2 75371590-75371663(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATAGATAAGGTTAT
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SmilChr03G000256 Chr03 NC_080389.1:3003087-3003101promoter 内 2094-2108 bp - 1893 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 3004994-3009642(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GTTACCTTATCCAAA
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SmilChr03G001489 Chr03 NC_080389.1:17957436-17957450promoter 内 1649-1663 bp - 2338 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 17953517-17955098(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAGGATAAGGTGAC
SmilChr01G001141 Chr01 NC_080387.1:23359647-23359661promoter 内 1641-1655 bp + 2346 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 23355771-23357301(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTATCTTATCCACA
SmilChr03G000115 Chr03 NC_080389.1:1281722-1281736promoter 内 1511-1525 bp - 2476 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1276406-1279246(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAAGGTAAC
SmilChr03G000126 Chr03 NC_080389.1:1380462-1380476promoter 内 1383-1397 bp - 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1375998-1377858(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATGGATAAGGCTAA
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SmilChr01G003894 Chr01 NC_080387.1:57231307-57231321promoter 内 266-280 bp - 3721 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 57235042-57237492(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAACCTTATCCCTT