转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 46 / 143 下载 TSV

上一页 46 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000230 Chr06 NC_080392.1:1544853-1544864promoter 内 2343-2354 bp + 1647 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 1546511-1548697(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCAG
SmilChr01G001912 Chr01 NC_080387.1:34265163-34265174promoter 内 2250-2261 bp + 1740 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 34266914-34268749(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CGGACAGCTGGG
SmilChr03G001488 Chr03 NC_080389.1:17951958-17951969promoter 内 2195-2206 bp - 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17948018-17950163(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GGGACAGCTGAA
SmilChr07G002663 Chr07 NC_080393.1:25842098-25842109promoter 内 2169-2180 bp - 1821 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 25843930-25846169(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGC
SmilChr03G002723 Chr03 NC_080389.1:43235569-43235580promoter 内 2091-2102 bp + 1899 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43237479-43237874(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGT
SmilChr01G000189 Chr01 NC_080387.1:3237152-3237163promoter 内 2086-2097 bp - 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3239067-3240349(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAC
SmilChr03G003888 Chr03 NC_080389.1:57957736-57957747promoter 内 2028-2039 bp + 1962 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57959709-57961036(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATT
SmilChr03G001892 Chr03 NC_080389.1:26426632-26426643promoter 内 1992-2003 bp - 1998 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 26428641-26428979(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAG
SmilChr03G002035 Chr03 NC_080389.1:30711159-30711170promoter 内 1873-1884 bp - 2117 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 30713287-30715139(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGC
SmilChr03G000266 Chr03 NC_080389.1:3081642-3081653promoter 内 1806-1817 bp + 2184 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3077461-3079458(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr04G001625 Chr04 NC_080390.1:27010479-27010490promoter 内 1735-1746 bp + 2255 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 27012745-27017117(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCAG
SmilChr08G001882 Chr08 NC_080394.1:16340563-16340574promoter 内 1593-1604 bp + 2397 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 16342971-16343671(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGACAGCTGAG
SmilChr05G001105 Chr05 NC_080391.1:9180833-9180844promoter 内 1517-1528 bp - 2473 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9177029-9178360(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGACAGCTATT
SmilChr03G000836 Chr03 NC_080389.1:9576072-9576083promoter 内 1511-1522 bp - 2479 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 9578562-9582344(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCGC
SmilChr03G004646 Chr03 NC_080389.1:64022579-64022590promoter 内 1480-1491 bp + 2510 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 64019175-64020069(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGA
SmilChr07G001873 Chr07 NC_080393.1:16213129-16213140promoter 内 1336-1347 bp + 2654 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 16205718-16210475(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAG
SmilChr05G001576 Chr05 NC_080391.1:14430114-14430125promoter 内 1322-1333 bp - 2668 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 14432793-14434284(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGC
SmilChr07G004565 Chr07 NC_080393.1:58460366-58460377promoter 内 1257-1268 bp - 2733 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 58456040-58457633(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGG
SmilChr05G000249 Chr05 NC_080391.1:1906674-1906685promoter 内 1253-1264 bp + 2737 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 1899138-1903937(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr07G004603 Chr07 NC_080393.1:58837562-58837573promoter 内 1058-1069 bp + 2932 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 58840505-58844564(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGG
SmilChr02G004743 Chr02 NC_080388.1:69650986-69650997promoter 内 996-1007 bp + 2994 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 69644540-69647992(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CCGAGCTGTCGA
SmilChr05G000513 Chr05 NC_080391.1:3958728-3958739promoter 内 981-992 bp - 3009 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 3952999-3955719(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCTT
SmilChr05G003950 Chr05 NC_080391.1:53250173-53250184promoter 内 899-910 bp + 3091 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 53245626-53247082(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr06G000529 Chr06 NC_080392.1:4334968-4334979promoter 内 873-884 bp + 3117 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4338096-4341021(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAA
SmilChr02G004744 Chr02 NC_080388.1:69650986-69650997promoter 内 782-793 bp + 3208 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 69654205-69656876(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGG
SmilChr02G001579 Chr02 NC_080388.1:29475328-29475339promoter 内 773-784 bp - 3217 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 29470400-29472111(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTGACAGCTCAG
SmilChr01G003930 Chr01 NC_080387.1:57584915-57584926promoter 内 732-743 bp - 3258 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57588184-57590043(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr06G000525 Chr06 NC_080392.1:4313297-4313308promoter 内 692-703 bp + 3298 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 4316606-4319297(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAA
SmilChr05G003773 Chr05 NC_080391.1:51094618-51094629promoter 内 670-681 bp - 3320 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 51097949-51098654(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGAGCTGTCAA
SmilChr03G002719 Chr03 NC_080389.1:43210988-43210999promoter 内 643-654 bp + 3347 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 43214346-43215872(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGT
SmilChr02G004094 Chr02 NC_080388.1:63261552-63261563promoter 内 541-552 bp + 3449 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 63253781-63258103(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCAG
SmilChr02G001460 Chr02 NC_080388.1:27304789-27304800promoter 内 483-494 bp - 3507 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 27299186-27301282(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTCGT
SmilChr07G003849 Chr07 NC_080393.1:47740406-47740417promoter 内 415-426 bp - 3575 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 47733886-47736831(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATTACAGCTGTT
SmilChr03G003887 Chr03 NC_080389.1:57957736-57957747promoter 内 130-141 bp + 3860 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 57952358-57953876(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAT
SmilChr03G001490 Chr03 NC_080389.1:17951958-17951969promoter 内 117-128 bp - 3873 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 17955842-17956975(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCCC
SmilChr02G005190 Chr02 NC_080388.1:73185726-73185737promoter 内 96-107 bp - 3894 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.1/ 100 1 73189631-73193461(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AATAGCTGTCAT
SmilChr02G003482 Chr02 NC_080388.1:56098370-56098381promoter 内 1093-1104 bp - 2897 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 56095078-56095473(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTG
SmilChr05G001053 Chr05 NC_080391.1:8723880-8723891promoter 内 393-404 bp + 3597 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 3 8718649-8720283(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCGA
SmilChr07G003055 Chr07 NC_080393.1:31931197-31931208promoter 内 3949-3960 bp + 41 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 31931249-31934097(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGT
SmilChr07G000397 Chr07 NC_080393.1:2741090-2741101promoter 内 3372-3383 bp - 618 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 2741719-2747399(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAGA
SmilChr02G000336 Chr02 NC_080388.1:4253689-4253700promoter 内 3221-3232 bp + 769 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 4249585-4252920(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGAGCTGTCGA
SmilChr05G000351 Chr05 NC_080391.1:2634349-2634360promoter 内 1981-1992 bp - 2009 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 2630799-2632340(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGAG
SmilChr01G000960 Chr01 NC_080387.1:20313979-20313990promoter 内 1733-1744 bp - 2257 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 20316247-20317386(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAAG
SmilChr01G000626 Chr01 NC_080387.1:14045349-14045360promoter 内 1628-1639 bp - 2362 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 14042541-14042987(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCGACAGCTATC
SmilChr01G000284 Chr01 NC_080387.1:5584173-5584184promoter 内 1595-1606 bp - 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 5576383-5581778(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTTCCAGCTGTG
SmilChr07G003056 Chr07 NC_080393.1:31931197-31931208promoter 内 983-994 bp + 3007 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 31934215-31935231(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCGT
SmilChr01G003884 Chr01 NC_080387.1:57161129-57161140promoter 内 919-930 bp + 3071 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 57164211-57166340(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGACAGCTGAA
SmilChr05G000353 Chr05 NC_080391.1:2634349-2634360promoter 内 896-907 bp - 3094 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 2637454-2639308(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCTC
SmilChr05G003607 Chr05 NC_080391.1:48146957-48146968promoter 内 803-814 bp + 3187 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 48140225-48143770(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TACAGCTGGAGA
SmilChr04G000964 Chr04 NC_080390.1:12839509-12839520promoter 内 736-747 bp - 3254 bp 位于靶基因 TSS 上游 95.0/ 100 2 12835629-12836255(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCTCCAGCTGTA