转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G002743; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022510-RA_Salv SmilChr01G002743 MYB_related XP_057765725.1 MP00565 AACCTTATCCATAAA

可能结合的靶基因

9785 个结合位点 7412 个候选靶基因 第 48 / 149 下载 TSV

上一页 48 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G001912 Chr02 NC_080388.1:34422890-34422904promoter 内 2407-2421 bp - 1580 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 34419529-34421310(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTCT
SmilChr03G003313 Chr03 NC_080389.1:51372788-51372802promoter 内 2295-2309 bp + 1692 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 51370311-51371096(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTTTGGATAATATA
SmilChr04G003741 Chr04 NC_080390.1:53720167-53720181promoter 内 2223-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 53716410-53718403(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAACAGGATAAGGAT
SmilChr02G001913 Chr02 NC_080388.1:34422890-34422904promoter 内 2065-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 34424826-34426167(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGAATGGATAATATT
SmilChr02G002840 Chr02 NC_080388.1:48522947-48522961promoter 内 2065-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 48515692-48521025(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAACTTATCCATTTT
SmilChr01G003824 Chr01 NC_080387.1:56569075-56569089promoter 内 2035-2049 bp + 1952 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 56571041-56574573(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTCT
SmilChr01G005491 Chr01 NC_080387.1:71836341-71836355promoter 内 1566-1580 bp - 2421 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 71833093-71833920(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTATTATCCACATC
SmilChr03G003608 Chr03 NC_080389.1:54713846-54713860promoter 内 1470-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 54716377-54722312(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTTTGGATAATATA
SmilChr04G003079 Chr04 NC_080390.1:47404159-47404173promoter 内 1371-1385 bp - 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 47399044-47401543(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCCTCGTC
SmilChr02G004589 Chr02 NC_080388.1:68382726-68382740promoter 内 1089-1103 bp + 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 68377213-68379828(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ATTTTGGATAATATA
SmilChr04G002864 Chr04 NC_080390.1:44749580-44749594promoter 内 876-890 bp + 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 44752705-44755034(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGCCTTATCTACTAC
SmilChr04G002991 Chr04 NC_080390.1:46337556-46337570promoter 内 326-340 bp + 3661 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 46341231-46342816(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAGTTTATCCATATC
SmilChr02G002818 Chr02 NC_080388.1:48278499-48278513promoter 内 262-276 bp + 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 48282238-48285778(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTCTTATCCTTTTC
SmilChr01G003839 Chr01 NC_080387.1:56734919-56734933promoter 内 183-197 bp - 3804 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 56738737-56743534(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGAATGGATAATATT
SmilChr01G000968 Chr01 NC_080387.1:20522271-20522285promoter 内 33-47 bp + 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 20515673-20518317(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATGTGGATAAGTTC
SmilChr01G005157 Chr01 NC_080387.1:69340480-69340494promoter 内 3964-3978 bp + 23 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69340517-69346912(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GACCTTATCCAAGTG
SmilChr02G004327 Chr02 NC_080388.1:65555352-65555366promoter 内 3938-3952 bp + 49 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 65555415-65558922(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TACCTCATCCATACG
SmilChr01G004851 Chr01 NC_080387.1:66663662-66663676promoter 内 3884-3898 bp - 103 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 66662766-66663559(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GGCGTTATCCATTAA
SmilChr01G000205 Chr01 NC_080387.1:3552685-3552699promoter 内 3858-3872 bp + 129 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 3546780-3552556(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 CTATTGGATAAAATT
SmilChr02G004777 Chr02 NC_080388.1:69945965-69945979promoter 内 3811-3825 bp - 176 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 69943037-69945789(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTCTTATCCAATCT
SmilChr01G002647 Chr01 NC_080387.1:44793199-44793213promoter 内 3780-3794 bp - 207 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44793420-44798415(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTTATGGATAATAAT
SmilChr01G001724 Chr01 NC_080387.1:32917360-32917374promoter 内 3761-3775 bp - 226 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31775044-32917134(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCCTATCCATTTC
SmilChr04G004109 Chr04 NC_080390.1:56034056-56034070promoter 内 3682-3696 bp + 305 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56031789-56033751(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAAATGGATAATATA
SmilChr02G000020 Chr02 NC_080388.1:162750-162764promoter 内 3614-3628 bp + 373 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 161505-162377(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATAGATAAGGAA
SmilChr02G002586 Chr02 NC_080388.1:44958628-44958642promoter 内 3557-3571 bp + 430 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 44958127-44958198(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATGGATAATGAC
SmilChr04G000524 Chr04 NC_080390.1:5760433-5760447promoter 内 3537-3551 bp + 450 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 5756241-5759983(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGAATGGATAATATT
SmilChr02G002633 Chr02 NC_080388.1:45702770-45702784promoter 内 3519-3533 bp + 468 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 45702231-45702302(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATGGATAATGAC
SmilChr03G001462 Chr03 NC_080389.1:17462111-17462125promoter 内 3511-3525 bp - 476 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 17462601-17463092(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTAGTAGATAAGGTG
SmilChr03G002265 Chr03 NC_080389.1:35648598-35648612promoter 内 3494-3508 bp + 493 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35647641-35648105(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATATGGATAAAACT
SmilChr03G001250 Chr03 NC_080389.1:14414092-14414106promoter 内 3387-3401 bp + 600 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 14414706-14416735(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TAACTTATCCACTAG
SmilChr01G003499 Chr01 NC_080387.1:53590981-53590995promoter 内 3358-3372 bp - 629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 53588664-53590352(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AATATTATCCATTCT
SmilChr03G001834 Chr03 NC_080389.1:25178402-25178416promoter 内 3352-3366 bp + 635 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 25176699-25177767(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AGTTTAGATAAGGAT
SmilChr04G003914 Chr04 NC_080390.1:54860280-54860294promoter 内 3298-3312 bp - 689 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 54860983-54863021(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGATTGGATAATATT
SmilChr01G004024 Chr01 NC_080387.1:58649701-58649715promoter 内 3143-3157 bp - 844 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 58648182-58648857(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GATGTTATCCATATA
SmilChr04G003520 Chr04 NC_080390.1:51579114-51579128promoter 内 3080-3094 bp - 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 51576554-51578207(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AAGTTTATCCATAAC
SmilChr04G004110 Chr04 NC_080390.1:56034056-56034070promoter 内 3031-3045 bp + 956 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 56035026-56036923(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATATTATCCATTTA
SmilChr02G004115 Chr02 NC_080388.1:63458022-63458036promoter 内 2894-2908 bp + 1093 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 63455483-63456929(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 GAATTGGATAACAAT
SmilChr02G001777 Chr02 NC_080388.1:32545731-32545745promoter 内 2872-2886 bp - 1115 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 32538679-32544616(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 ACCATTATCCATATA
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SmilChr02G005536 Chr02 NC_080388.1:75399239-75399253promoter 内 2575-2589 bp - 1412 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 75400665-75404228(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TATTTGGATAAGTTG
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SmilChr04G002972 Chr04 NC_080390.1:46084897-46084911promoter 内 2219-2233 bp + 1768 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 46086679-46089185(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACTTTATCCATAGT
SmilChr04G003397 Chr04 NC_080390.1:50508329-50508343promoter 内 2175-2189 bp + 1812 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 50510155-50510932(+) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TGTCTTATCCTTTTC
SmilChr04G002202 Chr04 NC_080390.1:35650082-35650096promoter 内 2137-2151 bp - 1850 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 35642919-35648232(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 AACCTTATCCCCATT
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SmilChr01G001723 Chr01 NC_080387.1:31776674-31776688promoter 内 2104-2118 bp - 1883 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 1 31774114-31774791(-) SMil_00022510-RA_Salv MP00565 TTCCCTATCCATTTC