转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G003404; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00027732-RA_Salv SmilChr01G003404 bZIP XP_057773670.1 MP00184 TTGACAGCTGTA

可能结合的靶基因

9840 个结合位点 7147 个候选靶基因 第 49 / 143 下载 TSV

上一页 49 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr06G000924 Chr06 NC_080392.1:8775241-8775252promoter 内 3741-3752 bp - 249 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 8775501-8781510(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr01G001671 Chr01 NC_080387.1:30819374-30819385promoter 内 3710-3721 bp - 280 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 30819665-30820468(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr04G000278 Chr04 NC_080390.1:2547742-2547753promoter 内 3682-3693 bp + 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2548061-2548459(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGAT
SmilChr02G001987 Chr02 NC_080388.1:35886138-35886149promoter 内 3648-3659 bp + 342 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 35885164-35885796(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr01G001724 Chr01 NC_080387.1:32917499-32917510promoter 内 3625-3636 bp + 365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 31775044-32917134(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr05G000175 Chr05 NC_080391.1:1380299-1380310promoter 内 3556-3567 bp + 434 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1376826-1379865(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCCA
SmilChr07G003300 Chr07 NC_080393.1:34869520-34869531promoter 内 3550-3561 bp - 440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 34865948-34869080(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCTG
SmilChr07G000337 Chr07 NC_080393.1:2278928-2278939promoter 内 3521-3532 bp + 469 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 2279408-2283615(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTG
SmilChr07G002163 Chr07 NC_080393.1:19798038-19798049promoter 内 3232-3243 bp + 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 19793471-19797280(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTCAGCTGTCCA
SmilChr01G000410 Chr01 NC_080387.1:8345717-8345728promoter 内 3218-3229 bp + 772 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 8341498-8344945(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGT
SmilChr06G002036 Chr06 NC_080392.1:26616614-26616625promoter 内 3109-3120 bp - 881 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 26617506-26618147(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr04G001707 Chr04 NC_080390.1:28201317-28201328promoter 内 3066-3077 bp - 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 28202252-28203307(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCTA
SmilChr07G004695 Chr07 NC_080393.1:59870186-59870197promoter 内 3059-3070 bp + 931 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 59865259-59869255(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTCAGCTGTCCC
SmilChr04G000155 Chr04 NC_080390.1:1352074-1352085promoter 内 3025-3036 bp + 965 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1353050-1359412(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTG
SmilChr06G003250 Chr06 NC_080392.1:45173954-45173965promoter 内 2969-2980 bp + 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 45174986-45177201(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAG
SmilChr01G005509 Chr01 NC_080387.1:71947379-71947390promoter 内 2945-2956 bp - 1045 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 71948435-71949956(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr04G000368 Chr04 NC_080390.1:3705357-3705368promoter 内 2875-2886 bp - 1115 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3706483-3707097(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CTGAGCTGTCAA
SmilChr03G001459 Chr03 NC_080389.1:17433424-17433435promoter 内 2816-2827 bp - 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 17430410-17432250(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTT
SmilChr07G003801 Chr07 NC_080393.1:46817481-46817492promoter 内 2798-2809 bp - 1192 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 46818684-46819596(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr05G000554 Chr05 NC_080391.1:4178765-4178776promoter 内 2513-2524 bp - 1477 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4180253-4181336(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAC
SmilChr04G000154 Chr04 NC_080390.1:1352074-1352085promoter 内 2410-2421 bp + 1580 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1349669-1350494(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr03G003307 Chr03 NC_080389.1:51277100-51277111promoter 内 2354-2365 bp - 1636 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 51278747-51280247(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATCAGCTGTCTC
SmilChr04G003523 Chr04 NC_080390.1:51603182-51603193promoter 内 2350-2361 bp + 1640 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 51604833-51607438(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTATC
SmilChr03G002490 Chr03 NC_080389.1:39583538-39583549promoter 内 2291-2302 bp - 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 39585248-39588954(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGT
SmilChr01G004183 Chr01 NC_080387.1:60276636-60276647promoter 内 2195-2206 bp + 1795 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 60274033-60274841(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr02G001935 Chr02 NC_080388.1:34768315-34768326promoter 内 2182-2193 bp + 1808 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 34765933-34766507(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAC
SmilChr06G000443 Chr06 NC_080392.1:3618132-3618143promoter 内 2159-2170 bp - 1831 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3613709-3616301(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ACGACAGCTCTG
SmilChr04G000535 Chr04 NC_080390.1:5941289-5941300promoter 内 2149-2160 bp - 1841 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 5943141-5955004(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr07G000572 Chr07 NC_080393.1:3887040-3887051promoter 内 2105-2116 bp - 1885 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3888936-3890019(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GATAGCTGTCGA
SmilChr01G003379 Chr01 NC_080387.1:52472031-52472042promoter 内 2068-2079 bp - 1922 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52466624-52470109(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTG
SmilChr04G000932 Chr04 NC_080390.1:12162586-12162597promoter 内 2024-2035 bp - 1966 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 12158815-12160620(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TTGACAGCTCAG
SmilChr07G000145 Chr07 NC_080393.1:880807-880818promoter 内 1984-1995 bp + 2006 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 872390-878801(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr01G001800 Chr01 NC_080387.1:32917499-32917510promoter 内 1971-1982 bp + 2019 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 32914803-32915480(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr01G001723 Chr01 NC_080387.1:31776814-31776825promoter 内 1967-1978 bp + 2023 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 31774114-31774791(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr04G000432 Chr04 NC_080390.1:4595662-4595673promoter 内 1924-1935 bp + 2066 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4597739-4598868(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTT
SmilChr07G000182 Chr07 NC_080393.1:1166999-1167010promoter 内 1914-1925 bp + 2076 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 1157766-1164923(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 ATGAGCTGTCAC
SmilChr07G000149 Chr07 NC_080393.1:893382-893393promoter 内 1902-1913 bp + 2088 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 888198-891294(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr06G000446 Chr06 NC_080392.1:3618132-3618143promoter 内 1744-1755 bp - 2246 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 3620389-3625451(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CAGAGCTGTCGT
SmilChr07G000146 Chr07 NC_080393.1:880807-880818promoter 内 1689-1700 bp + 2301 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 875844-878506(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr04G001323 Chr04 NC_080390.1:21310215-21310226promoter 内 1625-1636 bp - 2365 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 21312591-21329516(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GTTAGCTGTCAC
SmilChr02G003109 Chr02 NC_080388.1:52071334-52071345promoter 内 1616-1627 bp + 2374 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 52073719-52074792(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TGGACAGCTGAA
SmilChr03G000454 Chr03 NC_080389.1:4840976-4840987promoter 内 1615-1626 bp + 2375 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 4843362-4844382(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTG
SmilChr07G000150 Chr07 NC_080393.1:897062-897073promoter 内 1601-1612 bp + 2389 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 891921-894673(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr01G002203 Chr01 NC_080387.1:38358899-38358910promoter 内 1531-1542 bp + 2459 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 38350947-38356440(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 CACAGCTGGAGC
SmilChr02G003772 Chr02 NC_080388.1:59411947-59411958promoter 内 1519-1530 bp - 2471 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 59408949-59409476(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTT
SmilChr07G000147 Chr07 NC_080393.1:885343-885354promoter 内 1481-1492 bp + 2509 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 879402-882834(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 AAGAGCTGTCGA
SmilChr07G000162 Chr07 NC_080393.1:961620-961631promoter 内 1418-1429 bp + 2572 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 964203-966755(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TCGACAGCTCTT
SmilChr04G003207 Chr04 NC_080390.1:48933326-48933337promoter 内 1368-1379 bp - 2622 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 48927984-48930704(-) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 TAGACAGCTGAG
SmilChr05G004281 Chr05 NC_080391.1:56603994-56604005promoter 内 1309-1320 bp + 2681 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 56606686-56609506(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GAGACAGCTGAT
SmilChr03G003515 Chr03 NC_080389.1:53746059-53746070promoter 内 1295-1306 bp + 2695 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.9/ 100 1 53748765-53751784(+) SMil_00027732-RA_Salv MP00184 GCTCCAGCTGTG