转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr01G004199; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00010571-RA_Salv SmilChr01G004199 bHLH XP_057782208.1 MP00074 AGAAGGTCACGTGG

可能结合的靶基因

9969 个结合位点 7396 个候选靶基因 第 49 / 148 下载 TSV

上一页 49 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr01G002534 Chr01 NC_080387.1:43362149-43362162promoter 内 2392-2405 bp - 1596 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 43343102-43360553(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GATATGCCACGTGG
SmilChr05G002776 Chr05 NC_080391.1:32322649-32322662promoter 内 1850-1863 bp + 2138 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 32324800-32325667(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TACATGCCACGTGG
SmilChr06G000637 Chr06 NC_080392.1:5634723-5634736promoter 内 1562-1575 bp + 2426 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 5637162-5637936(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCAACTCACGTGC
SmilChr03G002314 Chr03 NC_080389.1:36416796-36416809promoter 内 1250-1263 bp - 2738 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 36410888-36414058(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TTCAGCACACGTGG
SmilChr01G001779 Chr01 NC_080387.1:32683964-32683977promoter 内 1189-1202 bp - 2799 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 32686776-32690199(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCATATC
SmilChr01G002687 Chr01 NC_080387.1:45083697-45083710promoter 内 663-676 bp - 3325 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 45087035-45090326(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCGTATT
SmilChr02G001238 Chr02 NC_080388.1:22746945-22746958promoter 内 616-629 bp - 3372 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 22750330-22751232(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCATGTA
SmilChr03G000452 Chr03 NC_080389.1:4839395-4839408promoter 内 578-591 bp - 3410 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 4831555-4835985(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AATACGGCACGTGG
SmilChr05G000369 Chr05 NC_080391.1:2743008-2743021promoter 内 137-150 bp + 3851 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 2 2746872-2748741(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGGCAACACGTGG
SmilChr03G003178 Chr03 NC_080389.1:49239886-49239899promoter 内 3878-3891 bp + 110 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 49240009-49241631(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGAATCTCACGTGG
SmilChr01G002443 Chr01 NC_080387.1:42009920-42009933promoter 内 3853-3866 bp - 135 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 42010068-42015034(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACGTGAA
SmilChr07G000481 Chr07 NC_080393.1:3357233-3357246promoter 内 3815-3828 bp - 173 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 3357419-3363559(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACGAGTC
SmilChr01G004251 Chr01 NC_080387.1:60803765-60803778promoter 内 3536-3549 bp - 452 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60804230-60806045(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGATGCT
SmilChr03G000748 Chr03 NC_080389.1:8549670-8549683promoter 内 3295-3308 bp - 693 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 8546752-8548977(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGCGGTCACGTGA
SmilChr05G002086 Chr05 NC_080391.1:21841931-21841944promoter 内 3250-3263 bp - 738 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 21838022-21841193(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAGAGTCACGTGT
SmilChr01G002157 Chr01 NC_080387.1:37582376-37582389promoter 内 3173-3186 bp + 815 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37583204-37586022(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGCTTCACGTGC
SmilChr01G002767 Chr01 NC_080387.1:46067825-46067838promoter 内 2829-2842 bp + 1159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 46068997-46071935(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTGCGGTCACGTGA
SmilChr03G004214 Chr03 NC_080389.1:60727972-60727985promoter 内 2762-2775 bp + 1226 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60723482-60726746(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCTTATC
SmilChr07G001521 Chr07 NC_080393.1:12197716-12197729promoter 内 2665-2678 bp + 1323 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 12193365-12196393(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACTAGCC
SmilChr01G004624 Chr01 NC_080387.1:64262925-64262938promoter 内 2575-2588 bp - 1413 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 64264351-64266280(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAGTCACA
SmilChr07G004659 Chr07 NC_080393.1:59504594-59504607promoter 内 2573-2586 bp + 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59503098-59503179(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCAACAC
SmilChr04G004079 Chr04 NC_080390.1:55856106-55856119promoter 内 2548-2561 bp - 1440 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 55848981-55854666(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGCAGATCACGTGG
SmilChr03G001948 Chr03 NC_080389.1:27809470-27809483promoter 内 2522-2535 bp - 1466 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 27810949-27815999(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCACAAG
SmilChr05G003011 Chr05 NC_080391.1:37339464-37339477promoter 内 2501-2514 bp + 1487 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37337077-37337977(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGATGCT
SmilChr06G002644 Chr06 NC_080392.1:38222573-38222586promoter 内 2351-2364 bp + 1637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 38216960-38220936(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGATCTGCA
SmilChr07G004658 Chr07 NC_080393.1:59504594-59504607promoter 内 2351-2364 bp + 1637 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 59497297-59502957(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCAACAC
SmilChr06G001946 Chr06 NC_080392.1:24006464-24006477promoter 内 2265-2278 bp - 1723 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 24008200-24026207(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTCTTCC
SmilChr07G003422 Chr07 NC_080393.1:37390730-37390743promoter 内 2013-2026 bp - 1975 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37388165-37388755(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGCACTACACGTGG
SmilChr06G000026 Chr06 NC_080392.1:277353-277366promoter 内 1872-1885 bp - 2116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 279482-284022(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACCTTAT
SmilChr08G000611 Chr08 NC_080394.1:4555329-4555342promoter 内 1807-1820 bp - 2181 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4551421-4553148(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGGGCTTCACGTGC
SmilChr05G003010 Chr05 NC_080391.1:37339464-37339477promoter 内 1593-1606 bp + 2395 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 37335707-37337069(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGATGCT
SmilChr01G004252 Chr01 NC_080387.1:60803765-60803778promoter 内 1383-1396 bp - 2605 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60806383-60807910(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGAGATGCT
SmilChr03G001204 Chr03 NC_080389.1:13875734-13875747promoter 内 1345-1358 bp + 2643 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 13878390-13879761(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCTGTCACGTGG
SmilChr03G001317 Chr03 NC_080389.1:15453535-15453548promoter 内 1269-1282 bp - 2719 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 15449509-15450816(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCCTGTCACGTGG
SmilChr06G000559 Chr06 NC_080392.1:4773663-4773676promoter 内 1260-1273 bp + 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4776404-4777609(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGTGCCGCACGTGG
SmilChr02G002771 Chr02 NC_080388.1:47768652-47768665promoter 内 749-762 bp + 3239 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 47763997-47765413(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGAAACGAC
SmilChr05G000571 Chr05 NC_080391.1:4301580-4301593promoter 内 382-395 bp - 3606 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4297118-4297974(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTACTGACACGTGG
SmilChr06G002034 Chr06 NC_080392.1:26535149-26535162promoter 内 365-378 bp - 3623 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 26531420-26531526(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GTCGTTTCACGTGG
SmilChr08G001556 Chr08 NC_080394.1:12778158-12778171promoter 内 154-167 bp + 3834 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 12769949-12774324(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGCTAGCA
SmilChr03G000454 Chr03 NC_080389.1:4839395-4839408promoter 内 34-47 bp - 3954 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 4843362-4844382(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGCCGTATT
SmilChr01G003815 Chr01 NC_080387.1:56528269-56528282promoter 内 27-40 bp + 3961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 56522984-56524308(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 GCACGTGACGAGTC
SmilChr01G004250 Chr01 NC_080387.1:60803765-60803778promoter 内 14-27 bp - 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.4/ 100 1 60798950-60799791(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 AGCATCTCACGTGC
SmilChr02G003466 Chr02 NC_080388.1:55959056-55959069promoter 内 3927-3940 bp + 61 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 55959130-55961909(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 ATCTCGCCACGTGG
SmilChr01G005821 Chr01 NC_080387.1:74211499-74211512promoter 内 3327-3340 bp - 661 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 74207215-74210838(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTGTGTCACGTGA
SmilChr07G002362 Chr07 NC_080393.1:21934424-21934437promoter 内 2594-2607 bp - 1394 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 21935831-21937736(+) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGTCCGCA
SmilChr01G001677 Chr01 NC_080387.1:30966209-30966222promoter 内 1657-1670 bp + 2331 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 30962534-30963878(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGTCAGTCG
SmilChr01G000826 Chr01 NC_080387.1:17805254-17805267promoter 内 437-450 bp - 3551 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 17795788-17801703(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TGTTGGCCACGTGG
SmilChr01G002538 Chr01 NC_080387.1:43445605-43445618promoter 内 135-148 bp - 3853 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 3 43439739-43441752(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CGAAGCTCACGTGC
SmilChr03G003277 Chr03 NC_080389.1:50733469-50733482promoter 内 3949-3962 bp + 39 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 50732186-50733430(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 TCACGTGACCCAAT
SmilChr04G001692 Chr04 NC_080390.1:27965427-27965440promoter 内 3829-3842 bp + 159 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.3/ 100 2 27958312-27965268(-) SMil_00010571-RA_Salv MP00074 CCACGTGGGATGAC