转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 55 / 136 下载 TSV

上一页 55 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G002325 Chr08 NC_080394.1:21934115-21934125promoter 内 1499-1509 bp - 2492 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21929435-21931623(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGTCAGCGCG
SmilChr05G000421 Chr05 NC_080391.1:3192607-3192617promoter 内 1446-1456 bp - 2545 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 3189057-3190062(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G002456 Chr01 NC_080387.1:42187975-42187985promoter 内 1405-1415 bp + 2586 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 42184695-42185389(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr01G005005 Chr01 NC_080387.1:68102625-68102635promoter 内 1380-1390 bp - 2611 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 68105246-68107456(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr03G001148 Chr03 NC_080389.1:13249493-13249503promoter 内 1345-1355 bp + 2646 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 13245752-13246847(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGC
SmilChr03G002785 Chr03 NC_080389.1:44342558-44342568promoter 内 1274-1284 bp + 2717 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 44337958-44339841(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr07G001022 Chr07 NC_080393.1:7428228-7428238promoter 内 1242-1252 bp - 2749 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7430987-7436146(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr05G002502 Chr05 NC_080391.1:27755935-27755945promoter 内 1225-1235 bp - 2766 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 27749861-27753169(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G003449 Chr01 NC_080387.1:53046392-53046402promoter 内 1211-1221 bp - 2780 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 53049182-53054468(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr07G001021 Chr07 NC_080393.1:7428228-7428238promoter 内 1184-1194 bp - 2807 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 7420753-7425421(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G003102 Chr03 NC_080389.1:48106578-48106588promoter 内 1180-1190 bp + 2811 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 48101971-48103767(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr08G001910 Chr08 NC_080394.1:16619856-16619866promoter 内 1169-1179 bp + 2822 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16622688-16626133(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr05G001942 Chr05 NC_080391.1:19782725-19782735promoter 内 1161-1171 bp - 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 19778249-19779895(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCG
SmilChr08G003845 Chr08 NC_080394.1:44793085-44793095promoter 内 1142-1152 bp - 2849 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 44795944-44796384(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGG
SmilChr04G001329 Chr04 NC_080390.1:21467025-21467035promoter 内 1132-1142 bp - 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 21460731-21464166(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G003888 Chr03 NC_080389.1:57956792-57956802promoter 内 1084-1094 bp + 2907 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 57959709-57961036(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G003887 Chr03 NC_080389.1:57956792-57956802promoter 内 1075-1085 bp + 2916 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 57952358-57953876(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr01G001171 Chr01 NC_080387.1:23765723-23765733promoter 内 1061-1071 bp + 2930 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 23768663-23770963(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTA
SmilChr01G002589 Chr01 NC_080387.1:44020341-44020351promoter 内 1047-1057 bp - 2944 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 44016632-44017397(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTA
SmilChr06G002705 Chr06 NC_080392.1:39055304-39055314promoter 内 1013-1023 bp + 2978 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 39058292-39063063(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr04G002750 Chr04 NC_080390.1:43174989-43174999promoter 内 979-989 bp - 3012 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 43178011-43179407(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCA
SmilChr04G002051 Chr04 NC_080390.1:33242285-33242295promoter 内 958-968 bp + 3033 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 33245328-33252843(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr07G001952 Chr07 NC_080393.1:16984134-16984144promoter 内 912-922 bp - 3079 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 16987223-16987303(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGC
SmilChr05G002847 Chr05 NC_080391.1:33951538-33951548promoter 内 898-908 bp + 3093 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 33948373-33948445(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr01G001710 Chr01 NC_080387.1:31572015-31572025promoter 内 884-894 bp - 3107 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 31575132-31576792(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGCA
SmilChr06G000336 Chr06 NC_080392.1:2522244-2522254promoter 内 882-892 bp + 3109 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2525363-2527050(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr04G003508 Chr04 NC_080390.1:51456084-51456094promoter 内 852-862 bp - 3139 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51452872-51452945(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G005070 Chr01 NC_080387.1:68588511-68588521promoter 内 849-859 bp - 3142 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 68583423-68585369(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCTCAGCCCG
SmilChr01G000088 Chr01 NC_080387.1:1633154-1633164promoter 内 819-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 1619640-1629982(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACGCTGAGGG
SmilChr03G002685 Chr03 NC_080389.1:42722332-42722342promoter 内 769-779 bp + 3222 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 42725564-42725637(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr04G003507 Chr04 NC_080390.1:51456084-51456094promoter 内 699-709 bp - 3292 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51452705-51452792(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr01G000698 Chr01 NC_080387.1:15670613-15670623promoter 内 673-683 bp - 3318 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 15673941-15675703(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr04G003640 Chr04 NC_080390.1:52881698-52881708promoter 内 532-542 bp - 3459 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52876039-52878239(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr03G002438 Chr03 NC_080389.1:38720542-38720552promoter 内 530-540 bp + 3461 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 38716641-38717081(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGAAGC
SmilChr04G001358 Chr04 NC_080390.1:22054117-22054127promoter 内 490-500 bp + 3501 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 22057628-22062615(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CCCTCAGCGTA
SmilChr01G004326 Chr01 NC_080387.1:61418461-61418471promoter 内 488-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 61412236-61414958(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCACAGCGCG
SmilChr04G003506 Chr04 NC_080390.1:51456084-51456094promoter 内 488-498 bp - 3503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 51452498-51452581(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr07G000135 Chr07 NC_080393.1:804551-804561promoter 内 444-454 bp - 3547 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 808108-809797(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACGCTGAGGC
SmilChr08G001132 Chr08 NC_080394.1:8876687-8876697promoter 内 410-420 bp - 3581 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 8871788-8873106(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGCCCAGCGCG
SmilChr08G004850 Chr08 NC_080394.1:57718055-57718065promoter 内 382-392 bp + 3609 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 57721674-57723930(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr05G001236 Chr05 NC_080391.1:10481486-10481496promoter 内 364-374 bp - 3627 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 10474775-10477859(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr07G001684 Chr07 NC_080393.1:14283257-14283267promoter 内 349-359 bp - 3642 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 14274175-14279615(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr02G000224 Chr02 NC_080388.1:2907193-2907203promoter 内 338-348 bp + 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 2900591-2903540(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr02G002213 Chr02 NC_080388.1:39371106-39371116promoter 内 326-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 39374781-39375809(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGTT
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SmilChr02G003122 Chr02 NC_080388.1:52223975-52223985promoter 内 266-276 bp - 3725 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 52227710-52229707(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT
SmilChr08G003673 Chr08 NC_080394.1:40814500-40814510promoter 内 245-255 bp - 3746 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 40807357-40810754(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr06G000089 Chr06 NC_080392.1:631536-631546promoter 内 243-253 bp + 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 635294-636451(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AACTCAGCGCT
SmilChr06G001970 Chr06 NC_080392.1:24831034-24831044promoter 内 199-209 bp + 3792 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 24825118-24827242(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGGGCTGAGCA
SmilChr05G003571 Chr05 NC_080391.1:47683799-47683809promoter 内 139-149 bp + 3852 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.5/ 100 1 47678449-47679947(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCGCTGAGTT