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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr08G002543; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00020892-RA_Salv SmilChr08G002543 bZIP XP_057778423.1 MP00303 ACCAGCTGTCA

可能结合的靶基因

9868 个结合位点 7416 个候选靶基因 第 55 / 149 下载 TSV

上一页 55 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr07G001225 Chr07 NC_080393.1:9384853-9384863promoter 内 2701-2711 bp - 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 9386153-9387172(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr04G001982 Chr04 NC_080390.1:32094133-32094143promoter 内 2429-2439 bp - 1562 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 32090842-32092571(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001725 Chr05 NC_080391.1:16559595-16559605promoter 内 2408-2418 bp + 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 16561188-16563669(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G003320 Chr03 NC_080389.1:51433918-51433928promoter 内 2292-2302 bp - 1699 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 51430424-51432219(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001481 Chr05 NC_080391.1:13589700-13589710promoter 内 2022-2032 bp - 1969 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 13586828-13587731(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G003031 Chr03 NC_080389.1:47231026-47231036promoter 内 1877-1887 bp - 2114 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 47225785-47228912(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G004002 Chr03 NC_080389.1:59043537-59043547promoter 内 1808-1818 bp + 2183 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 59045730-59048398(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr02G003229 Chr02 NC_080388.1:53564536-53564546promoter 内 1784-1794 bp + 2207 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 53558021-53562329(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr05G002762 Chr05 NC_080391.1:31962215-31962225promoter 内 1644-1654 bp + 2347 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 31964572-31966382(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G004519 Chr01 NC_080387.1:63310417-63310427promoter 内 1457-1467 bp + 2534 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 63312961-63315870(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G005476 Chr01 NC_080387.1:71752212-71752222promoter 内 1375-1385 bp - 2616 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 71741721-71749596(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001482 Chr05 NC_080391.1:13589888-13589898promoter 内 1240-1250 bp + 2751 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 13592649-13593918(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G002264 Chr07 NC_080393.1:20855477-20855487promoter 内 1199-1209 bp - 2792 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 20848924-20852685(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G004010 Chr01 NC_080387.1:58510524-58510534promoter 内 855-865 bp + 3136 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 58513670-58514897(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G001983 Chr04 NC_080390.1:32094469-32094479promoter 内 439-449 bp + 3552 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 32098031-32108776(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G004756 Chr03 NC_080389.1:64656020-64656030promoter 内 178-188 bp - 3813 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 3 64659843-64659949(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CTCCAGCTGGG
SmilChr03G003396 Chr03 NC_080389.1:52358332-52358342promoter 内 3875-3885 bp + 116 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 52358458-52363774(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G000439 Chr04 NC_080390.1:4647812-4647822promoter 内 3839-3849 bp + 152 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 4647974-4659034(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr02G002851 Chr02 NC_080388.1:48680180-48680190promoter 内 3830-3840 bp + 161 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 48680351-48684323(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr06G000879 Chr06 NC_080392.1:8329382-8329392promoter 内 3743-3753 bp + 248 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 8329640-8335570(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G002182 Chr03 NC_080389.1:33895606-33895616promoter 内 3733-3743 bp - 258 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 33894567-33895348(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr05G001749 Chr05 NC_080391.1:17033751-17033761promoter 内 3731-3741 bp + 260 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 17034021-17036216(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 AACAGCTGTCT
SmilChr01G004471 Chr01 NC_080387.1:62805055-62805065promoter 内 3712-3722 bp - 279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 62801628-62804776(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr02G003968 Chr02 NC_080388.1:61824720-61824730promoter 内 3689-3699 bp - 302 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 61823186-61824418(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr07G000343 Chr07 NC_080393.1:2321250-2321260promoter 内 3683-3693 bp - 308 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 2319208-2320942(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G006011 Chr01 NC_080387.1:75669493-75669503promoter 内 3654-3664 bp + 337 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 75669840-75713567(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G002344 Chr04 NC_080390.1:37802401-37802411promoter 内 3552-3562 bp + 439 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 37802850-37807900(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G002958 Chr03 NC_080389.1:46349625-46349635promoter 内 3526-3536 bp + 465 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 46350100-46352683(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G002760 Chr01 NC_080387.1:46001241-46001251promoter 内 3495-3505 bp + 496 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 46001747-46006775(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G001821 Chr01 NC_080387.1:33150095-33150105promoter 内 3366-3376 bp - 625 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 33147058-33149470(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr03G003395 Chr03 NC_080389.1:52358131-52358141promoter 内 3325-3335 bp - 666 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 52355585-52357465(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr02G001827 Chr02 NC_080388.1:33293200-33293210promoter 内 3290-3300 bp - 701 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 33289039-33292499(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G000325 Chr01 NC_080387.1:6538803-6538813promoter 内 3148-3158 bp - 843 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 6539656-6559465(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
SmilChr01G006013 Chr01 NC_080387.1:75721359-75721369promoter 内 3127-3137 bp - 864 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 75719970-75720495(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G001192 Chr01 NC_080387.1:24057425-24057435promoter 内 3084-3094 bp + 907 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 24058342-24059483(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G003197 Chr01 NC_080387.1:50739941-50739951promoter 内 3067-3077 bp - 924 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 50734261-50739017(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
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SmilChr05G001862 Chr05 NC_080391.1:18652302-18652312promoter 内 3030-3040 bp + 961 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 18653273-18658004(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
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SmilChr06G002830 Chr06 NC_080392.1:41077965-41077975promoter 内 2966-2976 bp - 1025 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 41070167-41076940(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr04G000159 Chr04 NC_080390.1:1383240-1383250promoter 内 2933-2943 bp + 1058 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 1384308-1388081(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 GATAGCTGTCA
SmilChr01G001748 Chr01 NC_080387.1:32220217-32220227promoter 内 2817-2827 bp - 1174 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 32221401-32235748(+) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
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SmilChr02G002605 Chr02 NC_080388.1:45195171-45195181promoter 内 2389-2399 bp + 1602 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 45191483-45193569(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC
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SmilChr03G001748 Chr03 NC_080389.1:23724426-23724436promoter 内 2229-2239 bp + 1762 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 23719198-23722664(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 CGACAGCTTGA
SmilChr06G000877 Chr06 NC_080392.1:8297949-8297959promoter 内 2227-2237 bp + 1764 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.8/ 100 2 8294575-8296185(-) SMil_00020892-RA_Salv MP00303 TGACAGCTATC