转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001829; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00004434-RA_Salv SmilChr06G001829 MYB XP_057766988.1 MP00510 TTTACCTACCTTT

可能结合的靶基因

9799 个结合位点 7526 个候选靶基因 第 57 / 151 下载 TSV

上一页 57 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr04G003269 Chr04 NC_080390.1:49399387-49399399promoter 内 3498-3510 bp + 491 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 49389698-49398896(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTACA
SmilChr04G001352 Chr04 NC_080390.1:21907558-21907570promoter 内 3212-3224 bp - 777 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 21908347-21909101(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTAAG
SmilChr03G003561 Chr03 NC_080389.1:54260973-54260985promoter 内 2930-2942 bp - 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 3 54255753-54259914(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TACACCTACCATT
SmilChr02G004858 Chr02 NC_080388.1:70721614-70721626promoter 内 2930-2942 bp + 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 70719282-70720555(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAATGTAGGTAAA
SmilChr04G003111 Chr04 NC_080390.1:47677967-47677979promoter 内 2895-2907 bp + 1094 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 47672424-47676873(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTATTAGGTAAC
SmilChr02G001310 Chr02 NC_080388.1:24338738-24338750promoter 内 2737-2749 bp - 1252 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 24340002-24340595(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TATGGTAGGTTGG
SmilChr01G002717 Chr01 NC_080387.1:45437088-45437100promoter 内 2655-2667 bp + 1334 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 45432075-45435754(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTAGTAGGTACG
SmilChr01G005351 Chr01 NC_080387.1:70758556-70758568promoter 内 2609-2621 bp + 1380 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 70754586-70757176(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATGGTAGGTGTA
SmilChr01G000949 Chr01 NC_080387.1:20117039-20117051promoter 内 2596-2608 bp + 1393 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 20107984-20115646(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTAGG
SmilChr05G000314 Chr05 NC_080391.1:2363167-2363179promoter 内 2588-2600 bp - 1401 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2364580-2367893(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGTG
SmilChr05G000309 Chr05 NC_080391.1:2338340-2338352promoter 内 2433-2445 bp - 1556 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2339908-2342613(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGTG
SmilChr04G003113 Chr04 NC_080390.1:47677967-47677979promoter 内 2229-2241 bp + 1760 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 47679739-47684114(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAATAAC
SmilChr01G000381 Chr01 NC_080387.1:7829142-7829154promoter 内 2193-2205 bp + 1796 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 7822624-7827346(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGAAGTAGGTAGT
SmilChr03G002964 Chr03 NC_080389.1:46392335-46392347promoter 内 2063-2075 bp - 1926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 46394273-46397932(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AGAAGTAGGTACA
SmilChr03G002078 Chr03 NC_080389.1:31894931-31894943promoter 内 1438-1450 bp - 2551 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 31897494-31903418(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTGGTAGGTTGG
SmilChr05G000317 Chr05 NC_080391.1:2374870-2374882promoter 内 1340-1352 bp + 2649 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2377531-2379708(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACACCTACCTTA
SmilChr05G000283 Chr05 NC_080391.1:2194972-2194984promoter 内 1315-1327 bp + 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2188993-2192298(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGTG
SmilChr05G000344 Chr05 NC_080391.1:2559990-2560002promoter 内 1226-1238 bp + 2763 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2554007-2557227(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGTG
SmilChr03G000327 Chr03 NC_080389.1:3730950-3730962promoter 内 1084-1096 bp + 2905 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 3733867-3734983(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTAATAGC
SmilChr03G003003 Chr03 NC_080389.1:46877159-46877171promoter 内 1047-1059 bp + 2942 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 46880113-46883906(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATGAT
SmilChr05G000318 Chr05 NC_080391.1:2379315-2379327promoter 内 958-970 bp - 3031 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 2382358-2385653(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGTG
SmilChr01G003891 Chr01 NC_080387.1:57217942-57217954promoter 内 901-913 bp + 3088 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 57213067-57214854(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAGGTAGGTGCC
SmilChr02G001309 Chr02 NC_080388.1:24338738-24338750promoter 内 842-854 bp - 3147 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 24321846-24335591(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CCAACCTACCATA
SmilChr05G001272 Chr05 NC_080391.1:10876323-10876335promoter 内 825-837 bp - 3164 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 10871737-10873159(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACTAAC
SmilChr05G000929 Chr05 NC_080391.1:7445286-7445298promoter 内 795-807 bp - 3194 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 7448492-7450287(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AACGGTAGGTAAT
SmilChr05G000046 Chr05 NC_080391.1:224663-224675promoter 内 710-722 bp - 3279 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 220170-221384(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACACCTACCTTA
SmilChr04G000125 Chr04 NC_080390.1:1070076-1070088promoter 内 640-652 bp + 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 1063140-1066727(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AAAAGTAGGTACA
SmilChr01G003422 Chr01 NC_080387.1:52867531-52867543promoter 内 639-651 bp - 3350 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 52862402-52864181(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CGTACCTACCCGT
SmilChr03G003992 Chr03 NC_080389.1:58963141-58963153promoter 内 175-187 bp + 3814 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 58957357-58959327(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTGATTAGGTAAG
SmilChr02G004860 Chr02 NC_080388.1:70721614-70721626promoter 内 144-156 bp + 3845 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 2 70725471-70736174(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TTTACCTACATTC
SmilChr02G003937 Chr02 NC_080388.1:61450704-61450716promoter 内 3898-3910 bp + 91 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 61449314-61450613(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GCAATTAGGTAAA
SmilChr01G000559 Chr01 NC_080387.1:11646082-11646094promoter 内 3897-3909 bp + 92 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 11644323-11645990(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATTGTAGGTAGG
SmilChr05G000775 Chr05 NC_080391.1:6034322-6034334promoter 内 3887-3899 bp - 102 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 6034436-6038754(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAGTTAGGTAAT
SmilChr02G002372 Chr02 NC_080388.1:41545933-41545945promoter 内 3807-3819 bp - 182 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 41546127-41552236(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GAAAGTAGGTAGT
SmilChr02G005306 Chr02 NC_080388.1:73983127-73983139promoter 内 3792-3804 bp - 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 73980373-73982930(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGTACCTACTTTT
SmilChr01G006053 Chr01 NC_080387.1:76019568-76019580promoter 内 3612-3624 bp - 377 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 76018001-76019191(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCGTA
SmilChr03G001325 Chr03 NC_080389.1:15516946-15516958promoter 内 3567-3579 bp - 422 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 15517380-15519261(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATAGTAGGTACA
SmilChr03G001422 Chr03 NC_080389.1:16836774-16836786promoter 内 3552-3564 bp + 437 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 16834462-16836337(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 AATAGTAGGTACA
SmilChr05G001114 Chr05 NC_080391.1:9292170-9292182promoter 内 3538-3550 bp - 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 9290405-9291719(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ATCACCTACCCGC
SmilChr02G001707 Chr02 NC_080388.1:31394387-31394399promoter 内 3473-3485 bp - 516 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 31389619-31393871(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCGCT
SmilChr03G001484 Chr03 NC_080389.1:17905729-17905741promoter 内 3231-3243 bp - 758 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 17891288-17904971(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GTTACCTAACGTG
SmilChr03G002566 Chr03 NC_080389.1:40850242-40850254promoter 内 3134-3146 bp + 855 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40851109-40856192(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGTACCTACCGCC
SmilChr03G002167 Chr03 NC_080389.1:33714165-33714177promoter 内 3077-3089 bp - 912 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 33707549-33713253(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CACACCTACCTTA
SmilChr03G002565 Chr03 NC_080389.1:40850242-40850254promoter 内 3063-3075 bp + 926 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 40848369-40849316(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 GGCGGTAGGTACC
SmilChr01G003791 Chr01 NC_080387.1:56298223-56298235promoter 内 3054-3066 bp - 935 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 56291429-56297288(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 CTTACCTAATAAG
SmilChr01G000420 Chr01 NC_080387.1:8462357-8462369promoter 内 2936-2948 bp - 1053 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 8458063-8461304(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCACG
SmilChr02G005527 Chr02 NC_080388.1:75341034-75341046promoter 内 2806-2818 bp + 1183 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 75338660-75339851(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TGCGGTAGGTGGT
SmilChr04G000681 Chr04 NC_080390.1:7903639-7903651promoter 内 2458-2470 bp + 1531 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 7905182-7906160(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACCGTT
SmilChr05G000315 Chr05 NC_080391.1:2366840-2366852promoter 内 2245-2257 bp - 1744 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 2368596-2372204(+) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 TAAGGTAGGTGTG
SmilChr01G005809 Chr01 NC_080387.1:74123699-74123711promoter 内 2220-2232 bp - 1769 bp 位于靶基因 TSS 上游 94.6/ 100 1 74118972-74121930(-) SMil_00004434-RA_Salv MP00510 ACTACCTACTTCC