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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 59 / 144 下载 TSV

上一页 59 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G000905 Chr02 NC_080388.1:15620224-15620236promoter 内 3913-3925 bp - 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 15619672-15620148(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACAGTCAACCCG
SmilChr03G000153 Chr03 NC_080389.1:1654007-1654019promoter 内 3913-3925 bp + 76 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1654095-1654571(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACAGTCAACCCG
SmilChr02G001000 Chr02 NC_080388.1:17628804-17628816promoter 内 3875-3887 bp - 114 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 17628930-17629774(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGTGTTGACTGTT
SmilChr01G004564 Chr01 NC_080387.1:63720095-63720107promoter 内 3851-3863 bp - 138 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63717788-63719957(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAAAGAC
SmilChr01G002634 Chr01 NC_080387.1:44626668-44626680promoter 内 3815-3827 bp - 174 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 44621596-44626494(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTGGTCAACGCA
SmilChr02G003298 Chr02 NC_080388.1:54250711-54250723promoter 内 3792-3804 bp + 197 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 54248813-54250514(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACTGCA
SmilChr04G001492 Chr04 NC_080390.1:24376596-24376608promoter 内 3648-3660 bp + 341 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 24375866-24376255(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGGGTTGACTTAA
SmilChr02G004158 Chr02 NC_080388.1:63901125-63901137promoter 内 3618-3630 bp - 371 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 63901508-63904482(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCATTGACTTTT
SmilChr01G006090 Chr01 NC_080387.1:76391025-76391037promoter 内 3597-3609 bp - 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 76391429-76392488(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATTGTTGACTTCT
SmilChr04G001005 Chr04 NC_080390.1:14006515-14006527promoter 内 3592-3604 bp + 397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 14006924-14011746(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACATG
SmilChr02G003314 Chr02 NC_080388.1:54397057-54397069promoter 内 3581-3593 bp + 408 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 54397477-54399615(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAATGAT
SmilChr02G004502 Chr02 NC_080388.1:67540887-67540899promoter 内 3547-3559 bp - 442 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 67528523-67540445(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CCAAGTCAACCCG
SmilChr04G000992 Chr04 NC_080390.1:13605217-13605229promoter 内 3538-3550 bp + 451 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 13605680-13610438(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACATG
SmilChr02G002310 Chr02 NC_080388.1:40712680-40712692promoter 内 3432-3444 bp + 557 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 40713249-40717348(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACAAT
SmilChr01G001333 Chr01 NC_080387.1:26527123-26527135promoter 内 3409-3421 bp - 580 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 26527715-26528434(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATTGTTGACTTCT
SmilChr01G000414 Chr01 NC_080387.1:8385385-8385397promoter 内 3358-3370 bp - 631 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 8382448-8384754(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTAAGTCAACAAC
SmilChr03G002499 Chr03 NC_080389.1:39811351-39811363promoter 内 3340-3352 bp - 649 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 39808289-39810702(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAAAACC
SmilChr01G003092 Chr01 NC_080387.1:49734367-49734379promoter 内 3281-3293 bp + 708 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 49735087-49740054(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACAGTCAACCCG
SmilChr01G003477 Chr01 NC_080387.1:53312813-53312825promoter 内 3263-3275 bp + 726 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 53313551-53320360(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAACATG
SmilChr01G004163 Chr01 NC_080387.1:60126303-60126315promoter 内 3248-3260 bp - 741 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 60127056-60131519(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCGTTGACCACC
SmilChr02G003417 Chr02 NC_080388.1:55402020-55402032promoter 内 3224-3236 bp + 765 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 55402797-55406595(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAAGTCAACCGA
SmilChr03G002718 Chr03 NC_080389.1:43203153-43203165promoter 内 3051-3063 bp + 938 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 43200851-43202215(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTGTG
SmilChr01G000307 Chr01 NC_080387.1:6000742-6000754promoter 内 3002-3014 bp + 987 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5996885-5999755(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACCACC
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SmilChr01G004293 Chr01 NC_080387.1:61139135-61139147promoter 内 2890-2902 bp - 1099 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 61135024-61138036(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AACAGTCAACAGT
SmilChr02G000088 Chr02 NC_080388.1:1145327-1145339promoter 内 2802-2814 bp - 1187 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 1143230-1144140(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAAAGAA
SmilChr04G000269 Chr04 NC_080390.1:2459836-2459848promoter 内 2742-2754 bp - 1247 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 2461095-2498487(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTCTTTGACTTTA
SmilChr04G000795 Chr04 NC_080390.1:9826368-9826380promoter 内 2715-2727 bp + 1274 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 9827654-9829547(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTGAGTCAACGGA
SmilChr01G001219 Chr01 NC_080387.1:24470069-24470081promoter 内 2574-2586 bp - 1415 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 24471496-24475714(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTTGTTGACTTAG
SmilChr01G001334 Chr01 NC_080387.1:26527123-26527135promoter 内 2537-2549 bp - 1452 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 26528587-26530877(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATTGTTGACTTCT
SmilChr03G002131 Chr03 NC_080389.1:33184108-33184120promoter 内 2533-2545 bp - 1456 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 33181393-33182652(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TAAAGTCAAAGAA
SmilChr01G002448 Chr01 NC_080387.1:42069382-42069394promoter 内 2500-2512 bp - 1489 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 42070883-42073649(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATTGTTGACTTCT
SmilChr02G002052 Chr02 NC_080388.1:36931422-36931434promoter 内 2484-2496 bp + 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 36932939-36935810(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACAAGTCAAAGCT
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SmilChr03G001554 Chr03 NC_080389.1:19582613-19582625promoter 内 2419-2431 bp + 1570 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 19584195-19587310(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACAAGTCAAAGCT
SmilChr03G003740 Chr03 NC_080389.1:56457199-56457211promoter 内 2355-2367 bp + 1634 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 56458845-56460661(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAATGAT
SmilChr03G003916 Chr03 NC_080389.1:58251168-58251180promoter 内 2345-2357 bp - 1644 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 58252824-58256515(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCTTTTGACTTTG
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SmilChr01G002206 Chr01 NC_080387.1:38387830-38387842promoter 内 2299-2311 bp + 1690 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 38389532-38392060(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACAAGTCAAAGCT
SmilChr01G000288 Chr01 NC_080387.1:5647782-5647794promoter 内 2243-2255 bp + 1746 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 5649540-5652649(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACAAT
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SmilChr01G004727 Chr01 NC_080387.1:65453847-65453859promoter 内 2003-2015 bp + 1986 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 65449517-65451861(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ATCATTGACTTTT
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SmilChr02G003099 Chr02 NC_080388.1:51887042-51887054promoter 内 1804-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.7/ 100 1 51889239-51889311(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TGCGTTGACCACC