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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr04G000040; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00000579-RA_Salv SmilChr04G000040 ERF XP_057808382.1 MP00312 AATTGTCGGTGGAGT

可能结合的靶基因

8490 个结合位点 7006 个候选靶基因 第 6 / 141 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr08G003437 Chr08 NC_080394.1:36660319-36660333promoter 内 630-644 bp - 3357 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 36663690-36664259(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCAGCACCGACACCA
SmilChr06G002991 Chr06 NC_080392.1:42745156-42745170promoter 内 104-118 bp - 3883 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.4/ 100 1 42731329-42741273(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAGCGTCGGTGGTGT
SmilChr02G003604 Chr02 NC_080388.1:57297781-57297795promoter 内 2083-2097 bp + 1904 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 3 57284584-57295877(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAACA
SmilChr07G002639 Chr07 NC_080393.1:25516056-25516070promoter 内 2707-2721 bp + 1280 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 2 25517350-25518243(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr02G002614 Chr02 NC_080388.1:45316177-45316191promoter 内 3929-3943 bp - 58 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 45310224-45316119(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GAGCGTCGGTGGAGG
SmilChr07G002535 Chr07 NC_080393.1:24045486-24045500promoter 内 3654-3668 bp + 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 24045833-24045924(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGTGTCGGTGGTTG
SmilChr07G002539 Chr07 NC_080393.1:24080812-24080826promoter 内 3654-3668 bp - 333 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 24080388-24080479(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AAGTGTCGGTGGTTG
SmilChr06G002799 Chr06 NC_080392.1:40681365-40681379promoter 内 3224-3238 bp - 763 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 40682142-40689564(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCCGCCGACAACA
SmilChr06G002797 Chr06 NC_080392.1:40672177-40672191promoter 内 3059-3073 bp - 928 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 40669882-40671249(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr06G002798 Chr06 NC_080392.1:40681365-40681379promoter 内 3052-3066 bp - 935 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 40679069-40680430(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr05G003432 Chr05 NC_080391.1:45580893-45580907promoter 内 3036-3050 bp - 951 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 45578811-45579942(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr06G002547 Chr06 NC_080392.1:36577543-36577557promoter 内 2966-2980 bp + 1021 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 36578578-36579775(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr06G002548 Chr06 NC_080392.1:36586677-36586691promoter 内 2964-2978 bp + 1023 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 36587714-36588911(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGCGGCGA
SmilChr01G001270 Chr01 NC_080387.1:25379847-25379861promoter 内 2826-2840 bp - 1161 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 25381022-25384673(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAACA
SmilChr03G003337 Chr03 NC_080389.1:51632562-51632576promoter 内 2824-2838 bp - 1163 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 51633739-51639024(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCGGCACCGACAGCT
SmilChr07G003626 Chr07 NC_080393.1:42777101-42777115promoter 内 1490-1504 bp - 2497 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 42779612-42780088(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAGCCACCGACGCCT
SmilChr04G003356 Chr04 NC_080390.1:50155472-50155486promoter 内 1089-1103 bp + 2898 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 50158384-50167188(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCTGTCGGTGCCGG
SmilChr08G000538 Chr08 NC_080394.1:3916550-3916564promoter 内 964-978 bp - 3023 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3919587-3928432(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTCCGCCGACAACC
SmilChr02G000632 Chr02 NC_080388.1:9509175-9509189promoter 内 758-772 bp + 3229 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 9512418-9513257(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGTTGTCGGTGCCGG
SmilChr02G001890 Chr02 NC_080388.1:34187703-34187717promoter 内 643-657 bp - 3344 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 34191061-34193024(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCACCACCGACAGCT
SmilChr08G003767 Chr08 NC_080394.1:43137198-43137212promoter 内 614-628 bp - 3373 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 43140585-43141480(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TCGCCGCCGACAACA
SmilChr02G000268 Chr02 NC_080388.1:3471479-3471493promoter 内 576-590 bp + 3411 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 3474904-3475671(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CATCGTCGGTGGGGG
SmilChr06G001528 Chr06 NC_080392.1:16513422-16513436promoter 内 454-468 bp - 3533 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 16505408-16509889(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CTCTGTCGGTGGGGA
SmilChr02G001889 Chr02 NC_080388.1:34187703-34187717promoter 内 334-348 bp - 3653 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.3/ 100 1 34183245-34184050(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGCTGTCGGTGGTGA
SmilChr01G005571 Chr01 NC_080387.1:72478387-72478401promoter 内 3425-3439 bp - 562 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 72478963-72481254(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGACGACG
SmilChr03G003174 Chr03 NC_080389.1:49203131-49203145promoter 内 1881-1895 bp - 2106 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 49198344-49201025(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TTGTGTCGGTGGATG
SmilChr04G002126 Chr04 NC_080390.1:34260334-34260348promoter 内 1537-1551 bp + 2450 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 34262798-34264532(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGGCGTCGGTGGAGC
SmilChr03G000250 Chr03 NC_080389.1:2941739-2941753promoter 内 1504-1518 bp - 2483 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 2944236-2951268(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCACCGCCGACAAGG
SmilChr02G004537 Chr02 NC_080388.1:67965142-67965156promoter 内 638-652 bp - 3349 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 2 67957432-67961793(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGTCGTCGGTGGTGG
SmilChr08G003979 Chr08 NC_080394.1:47873506-47873520promoter 内 3963-3977 bp + 24 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 47873544-47881074(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CACTGTCGGTGGTAG
SmilChr03G000345 Chr03 NC_080389.1:3896777-3896791promoter 内 3939-3953 bp + 48 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 3896839-3897761(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CGCTGTCGGTGCTGG
SmilChr01G000988 Chr01 NC_080387.1:20887241-20887255promoter 内 3897-3911 bp - 90 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 20879571-20887151(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAGTGTCGGTGGACT
SmilChr04G004163 Chr04 NC_080390.1:56300364-56300378promoter 内 3774-3788 bp + 213 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 56300591-56302912(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTTGTCGGTGGAGA
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SmilChr04G002809 Chr04 NC_080390.1:44037208-44037222promoter 内 3355-3369 bp + 632 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 44036052-44036576(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CCTTCACCGACGCCG
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SmilChr01G004246 Chr01 NC_080387.1:60768765-60768779promoter 内 3089-3103 bp - 898 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 60765462-60767867(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GTGTGTCGGTGGGGA
SmilChr03G002956 Chr03 NC_080389.1:46312830-46312844promoter 内 2928-2942 bp - 1059 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 46307575-46311771(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 TGGCGTCGGTGGAGT
SmilChr02G004811 Chr02 NC_080388.1:70275009-70275023promoter 内 2618-2632 bp - 1369 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 70271070-70273640(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 GGTTGTCGGTGGTGT
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SmilChr02G000596 Chr02 NC_080388.1:8602836-8602850promoter 内 1691-1705 bp - 2296 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 8605146-8607318(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 CAGCCACCGACGACG
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SmilChr01G005572 Chr01 NC_080387.1:72478387-72478401promoter 内 771-785 bp - 3216 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 72481617-72483066(+) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 ACTCCACCGACGACG
SmilChr04G001522 Chr04 NC_080390.1:25137942-25137956promoter 内 682-696 bp - 3305 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.2/ 100 1 25133386-25134637(-) SMil_00000579-RA_Salv MP00312 AGTCGTCGGTGGTGG