转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr05G004392; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00022653-RA_Salv SmilChr05G004392 WRKY XP_057811204.1 MP00506 AAAAGTCAACGAC

可能结合的靶基因

9818 个结合位点 7173 个候选靶基因 第 6 / 144 下载 TSV

上一页 6 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G000112 Chr03 NC_080389.1:1256223-1256235promoter 内 2406-2418 bp + 1583 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 1241646-1254640(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGTTGACTCTT
SmilChr01G004229 Chr01 NC_080387.1:60671426-60671438promoter 内 1921-1933 bp + 2068 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 60673506-60674711(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAAGTCAACGGC
SmilChr03G002533 Chr03 NC_080389.1:40395524-40395536promoter 内 1631-1643 bp + 2358 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 40387035-40393166(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTTGC
SmilChr01G005661 Chr01 NC_080387.1:72944712-72944724promoter 内 1385-1397 bp + 2604 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 72947328-72949283(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCAAGTCAACGCC
SmilChr01G002832 Chr01 NC_080387.1:46930406-46930418promoter 内 824-836 bp - 3165 bp 位于靶基因 TSS 上游 97.0/ 100 1 46933583-46934074(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCGTTGACTTCT
SmilChr02G004565 Chr02 NC_080388.1:68169822-68169834promoter 内 1956-1968 bp + 2033 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 6 68171867-68762800(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACCCC
SmilChr03G002050 Chr03 NC_080389.1:31050019-31050031promoter 内 1159-1171 bp + 2830 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 3 31041157-31047189(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGTTGACTTAG
SmilChr01G005736 Chr01 NC_080387.1:73488821-73488833promoter 内 3597-3609 bp - 392 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 73489225-73490124(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACTTCT
SmilChr02G002973 Chr02 NC_080388.1:50271730-50271742promoter 内 3018-3030 bp - 971 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 50267587-50270759(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACGAC
SmilChr04G000611 Chr04 NC_080390.1:6900583-6900595promoter 内 2699-2711 bp - 1290 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 6897804-6899293(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CTAAGTCAACGCC
SmilChr02G002885 Chr02 NC_080388.1:49163887-49163899promoter 内 1460-1472 bp + 2529 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 49159389-49161358(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACTATT
SmilChr02G002975 Chr02 NC_080388.1:50271730-50271742promoter 内 1415-1427 bp - 2574 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 2 50274316-50276218(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACTATT
SmilChr04G000031 Chr04 NC_080390.1:312867-312879promoter 内 3933-3945 bp - 56 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 312935-317187(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGTTGACTGTG
SmilChr04G000030 Chr04 NC_080390.1:312867-312879promoter 内 1470-1482 bp - 2519 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 302397-310348(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CACAGTCAACGCC
SmilChr01G005738 Chr01 NC_080387.1:73504289-73504301promoter 内 1063-1075 bp - 2926 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 73507227-73507982(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACTTCT
SmilChr01G004432 Chr01 NC_080387.1:62429492-62429504promoter 内 683-695 bp + 3306 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 62424756-62426186(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TCCGTTGACTTCT
SmilChr01G004434 Chr01 NC_080387.1:62429492-62429504promoter 内 8-20 bp + 3981 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.9/ 100 1 62433485-62434688(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGAAGTCAACGGA
SmilChr01G001681 Chr01 NC_080387.1:31010478-31010490promoter 内 2954-2966 bp + 1035 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 4 31008781-31009443(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACTTCG
SmilChr01G001682 Chr01 NC_080387.1:31010478-31010490promoter 内 1188-1200 bp + 2801 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 4 31013291-31016406(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGAAGTCAACGTC
SmilChr01G001680 Chr01 NC_080387.1:31010478-31010490promoter 内 817-829 bp + 3172 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 3 31005862-31007306(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACTTCG
SmilChr01G005301 Chr01 NC_080387.1:70295626-70295638promoter 内 1261-1273 bp - 2728 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 2 70298366-70299252(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GACGTTGACTTCG
SmilChr02G000958 Chr02 NC_080388.1:16670986-16670998promoter 内 3352-3364 bp + 637 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 16671635-16675520(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAGGTCAACGCG
SmilChr01G002085 Chr01 NC_080387.1:36821744-36821756promoter 内 2138-2150 bp + 1851 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.8/ 100 1 36818949-36819893(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGCGTTGACCTCT
SmilChr02G002923 Chr02 NC_080388.1:49632033-49632045promoter 内 2414-2426 bp + 1575 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 3 49629524-49630458(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCGGTTGACTTTG
SmilChr03G003343 Chr03 NC_080389.1:51767698-51767710promoter 内 1717-1729 bp - 2272 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 2 51757803-51765426(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAGAGTCAACGCC
SmilChr03G001845 Chr03 NC_080389.1:25347854-25347866promoter 内 3286-3298 bp - 703 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 25348569-25351888(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTGTC
SmilChr02G002704 Chr02 NC_080388.1:46888813-46888825promoter 内 2871-2883 bp + 1118 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 46882839-46887695(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGCGTTGACTTCT
SmilChr01G001917 Chr01 NC_080387.1:34312248-34312260promoter 内 2865-2877 bp - 1124 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 34313384-34317252(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACTTGT
SmilChr01G001873 Chr01 NC_080387.1:33755556-33755568promoter 内 2829-2841 bp - 1160 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 33756728-33760494(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACTTGT
SmilChr01G002879 Chr01 NC_080387.1:47397898-47397910promoter 内 2287-2299 bp - 1702 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 47394962-47396196(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACGTC
SmilChr02G002705 Chr02 NC_080388.1:46907576-46907588promoter 内 1906-1918 bp - 2083 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 46898764-46905493(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AATAGTCAACGTC
SmilChr04G001393 Chr04 NC_080390.1:22659590-22659602promoter 内 1728-1740 bp - 2261 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 22661863-22663866(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTGTC
SmilChr01G000707 Chr01 NC_080387.1:15844907-15844919promoter 内 1621-1633 bp - 2368 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 15847287-15848716(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCCGTTGACTGTC
SmilChr02G000619 Chr02 NC_080388.1:9065796-9065808promoter 内 1467-1479 bp - 2522 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 9068330-9069128(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCGTTGACTTCG
SmilChr01G001686 Chr01 NC_080387.1:31093527-31093539promoter 内 31-43 bp + 3958 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.7/ 100 1 31086192-31089569(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GTCGTTGACTTGT
SmilChr03G002439 Chr03 NC_080389.1:38736991-38737003promoter 内 1951-1963 bp - 2038 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 12 38739041-38739967(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACTTCG
SmilChr03G002440 Chr03 NC_080389.1:38736991-38737003promoter 内 727-739 bp - 3262 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 11 38740265-38741618(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACTTCG
SmilChr03G002323 Chr03 NC_080389.1:36577780-36577792promoter 内 2347-2359 bp + 1642 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 6 36579434-36582596(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CGAAGTCAACGCT
SmilChr02G001204 Chr02 NC_080388.1:22201393-22201405promoter 内 2209-2221 bp + 1780 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 5 22198792-22199613(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AGCGTTGACTTCG
SmilChr03G004045 Chr03 NC_080389.1:59438748-59438760promoter 内 1472-1484 bp - 2517 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 3 59432094-59436231(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACCCC
SmilChr01G003508 Chr01 NC_080387.1:53665719-53665731promoter 内 3292-3304 bp + 697 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 53666428-53671839(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACACC
SmilChr01G003969 Chr01 NC_080387.1:58138829-58138841promoter 内 3156-3168 bp - 833 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 58134832-58137996(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACAGC
SmilChr03G001170 Chr03 NC_080389.1:13457456-13457468promoter 内 2185-2197 bp - 1804 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 13459272-13460810(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 ACCGTTGACTATT
SmilChr03G004066 Chr03 NC_080389.1:59621854-59621866promoter 内 2143-2155 bp + 1846 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 2 59612079-59620008(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GGTGTTGACTTTT
SmilChr04G001608 Chr04 NC_080390.1:26774598-26774610promoter 内 3987-3999 bp + 2 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 26771724-26774596(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCTGTTGACTTTT
SmilChr03G001609 Chr03 NC_080389.1:20474950-20474962promoter 内 3936-3948 bp - 53 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 20473082-20474897(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 CAAAGTCAACCCC
SmilChr03G003889 Chr03 NC_080389.1:57964059-57964071promoter 内 3548-3560 bp + 441 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 57961116-57963618(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GCTGTTGACTTTT
SmilChr01G001998 Chr01 NC_080387.1:35477772-35477784promoter 内 2678-2690 bp - 1311 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.6/ 100 1 35470632-35476461(-) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 AAAAGTCAACACC
SmilChr01G004125 Chr01 NC_080387.1:59734580-59734592promoter 内 152-164 bp - 3837 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 3 59738429-59750632(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 TTCGTTGACCTTT
SmilChr01G002734 Chr01 NC_080387.1:45691837-45691849promoter 内 3008-3020 bp + 981 bp 位于靶基因 TSS 上游 96.5/ 100 1 45692830-45692988(+) SMil_00022653-RA_Salv MP00506 GAGAGTCAACGGC