转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr07G000836; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00008579-RA_Salv SmilChr07G000836 MYB_related XP_057772437.1 MP00568 TATGGATAAGGTTAT

可能结合的靶基因

9696 个结合位点 6611 个候选靶基因 第 60 / 133 下载 TSV

上一页 60 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr03G001748 Chr03 NC_080389.1:23725696-23725710promoter 内 955-969 bp - 3032 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23719198-23722664(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr01G000585 Chr01 NC_080387.1:12631447-12631461promoter 内 952-966 bp - 3035 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12625330-12628412(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr01G000242 Chr01 NC_080387.1:4508347-4508361promoter 内 909-923 bp - 3078 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4501786-4505269(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr02G000130 Chr02 NC_080388.1:1760521-1760535promoter 内 833-847 bp - 3154 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 1756019-1757367(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GATGGATAAGAATTA
SmilChr02G000641 Chr02 NC_080388.1:9700181-9700195promoter 内 790-804 bp + 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 9703392-9706749(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr01G002712 Chr01 NC_080387.1:45364993-45365007promoter 内 783-797 bp - 3204 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 45368211-45371658(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AGAGCCTTATCCTTC
SmilChr01G001739 Chr01 NC_080387.1:32022783-32022797promoter 内 774-788 bp + 3213 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 32015658-32019570(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTAACTTATCCTGT
SmilChr02G001242 Chr02 NC_080388.1:22812294-22812308promoter 内 711-725 bp - 3276 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 22805990-22809018(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr02G003562 Chr02 NC_080388.1:56797043-56797057promoter 内 655-669 bp - 3332 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 56800389-56800970(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GAGGTCTTATCCATT
SmilChr02G000401 Chr02 NC_080388.1:4950986-4951000promoter 内 369-383 bp + 3618 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 4954618-4957897(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr01G003971 Chr01 NC_080387.1:58152046-58152060promoter 内 322-336 bp + 3665 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 58145638-58148381(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTATATTATCCACA
SmilChr02G000585 Chr02 NC_080388.1:8418051-8418065promoter 内 275-289 bp + 3712 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 8421777-8425584(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAAAGATAAGGGGGT
SmilChr01G003535 Chr01 NC_080387.1:53987234-53987248promoter 内 256-270 bp + 3731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 53979613-53983503(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACTACCTTATCTTTG
SmilChr01G000774 Chr01 NC_080387.1:16866350-16866364promoter 内 217-231 bp - 3770 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16859469-16862580(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr02G000453 Chr02 NC_080388.1:6036273-6036287promoter 内 188-202 bp - 3799 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 6028130-6032474(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGAGATAAGGCAAT
SmilChr03G001296 Chr03 NC_080389.1:15153472-15153486promoter 内 182-196 bp - 3805 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 15157291-15160121(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GATTTCTTATCCTGT
SmilChr03G001037 Chr03 NC_080389.1:12079776-12079790promoter 内 170-184 bp + 3817 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 12075024-12075959(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATAATATTATCCAAA
SmilChr01G002078 Chr01 NC_080387.1:36736606-36736620promoter 内 132-146 bp + 3855 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 36740475-36742331(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GAGAGATAAGGTTGT
SmilChr02G001121 Chr02 NC_080388.1:20212763-20212777promoter 内 124-138 bp - 3863 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 20206755-20208900(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGGATAATGCTTG
SmilChr01G004841 Chr01 NC_080387.1:66546130-66546144promoter 内 74-88 bp - 3913 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 66534842-66542217(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGAGATAAGGAGAA
SmilChr02G001288 Chr02 NC_080388.1:23725371-23725385promoter 内 43-57 bp + 3944 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 23720890-23721427(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CTTTCCTTATCTTCC
SmilChr01G001301 Chr01 NC_080387.1:25920753-25920767promoter 内 34-48 bp - 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 25924720-25928691(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACCCCCTTATCTTTT
SmilChr01G000733 Chr01 NC_080387.1:16296711-16296725promoter 内 28-42 bp + 3959 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 16289859-16292752(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CGGGTCTTATCCTTT
SmilChr01G005659 Chr01 NC_080387.1:72932644-72932658promoter 内 15-29 bp + 3972 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.1/ 100 1 72936630-72940415(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TATGGATAAGCGTTA
SmilChr02G000475 Chr02 NC_080388.1:6513691-6513705promoter 内 3710-3724 bp - 277 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 4 6509284-6513414(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAATGTAAA
SmilChr03G000879 Chr03 NC_080389.1:9986835-9986849promoter 内 3250-3264 bp - 737 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 9973574-9986098(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TGTGGATAATGGTAT
SmilChr01G002623 Chr01 NC_080387.1:44503274-44503288promoter 内 3042-3056 bp - 945 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 44504233-44507820(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 CATACCTTATCAAAA
SmilChr02G004715 Chr02 NC_080388.1:69416208-69416222promoter 内 2756-2770 bp + 1231 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 69409231-69414977(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTACCTTATCTTTC
SmilChr01G005835 Chr01 NC_080387.1:74366969-74366983promoter 内 2706-2720 bp - 1281 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 74361036-74365688(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATTGGATAACGGTAT
SmilChr01G002295 Chr01 NC_080387.1:39776451-39776465promoter 内 1738-1752 bp - 2249 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 39778714-39782298(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 TTTGCCTTATCTCTT
SmilChr03G001206 Chr03 NC_080389.1:13912852-13912866promoter 内 1130-1144 bp + 2857 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 13915723-13917553(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACAGGATAAGTTAGA
SmilChr03G001018 Chr03 NC_080389.1:11708066-11708080promoter 内 1029-1043 bp + 2958 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 3 11711038-11712571(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AAGAGATAAGGCAAA
SmilChr02G001035 Chr02 NC_080388.1:18395449-18395463promoter 内 3974-3988 bp - 13 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 18393809-18395436(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ACTGGATAAGTATTT
SmilChr03G001375 Chr03 NC_080389.1:16220867-16220881promoter 内 3623-3637 bp + 364 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 16221245-16224490(+) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 ATGGGATAAGAAAAC
SmilChr01G001140 Chr01 NC_080387.1:23274632-23274646promoter 内 3441-3455 bp - 546 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 23270547-23274086(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 GATGGATAAGATGTT
SmilChr01G004738 Chr01 NC_080387.1:65567914-65567928promoter 内 3330-3344 bp + 657 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.0/ 100 2 65563100-65567257(-) SMil_00008579-RA_Salv MP00568 AATACATTATCCAAA
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