转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family,查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中,并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因,不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif;应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引,可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card,点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
C2H2 1
MP00592
8519 9901 查靶基因
ARR-B 1
MP00010
8344 9778 查靶基因
NAC 1
MP00059
8333 9940 查靶基因
MYB 1
MP00296
8304 9873 查靶基因
MYB 1
MP00114
8151 9897 查靶基因
WRKY 1
MP00408
8149 9902 查靶基因
Nin-like 1
MP00449
8096 9453 查靶基因
WRKY 1
MP00209
8083 9910 查靶基因
MYB 1
MP00627
8075 9835 查靶基因
WRKY 1
MP00450
8044 9901 查靶基因
ERF 1
MP00558
8044 9762 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00096
8019 9914 查靶基因
MYB 1
MP00476
7981 9904 查靶基因
NAC 1
MP00221
7965 9903 查靶基因
WRKY 1
MP00069
7882 9917 查靶基因
MYB 1
MP00406
7839 9917 查靶基因
TALE 1
MP00670
7758 9906 查靶基因
SBP 1
MP00555
7648 9805 查靶基因
ARF 1
MP00021
7629 9812 查靶基因
MYB 1
MP00132
7583 9926 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00609
7575 9941 查靶基因
ERF 1
MP00529
7559 9247 查靶基因
MYB 1
MP00510
7526 9799 查靶基因
NAC 1
MP00058
7440 9855 查靶基因
bZIP 1
MP00303
7416 9868 查靶基因
MYB_related 1
MP00565
7412 9785 查靶基因
ERF 1
MP00026
7408 9854 查靶基因
WRKY 1
MP00071
7408 9764 查靶基因
ARF 1
MP00033
7406 9827 查靶基因
bHLH 1
MP00074
7396 9969 查靶基因
MYB 1
MP00216
7342 9832 查靶基因
WRKY 1
MP00539
7338 9848 查靶基因
ARF 1
MP00574
7302 9846 查靶基因
WRKY 1
MP00464
7299 9864 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00315
7291 9567 查靶基因
WRKY 1
MP00525
7235 9838 查靶基因
WRKY 1
MP00171
7182 9833 查靶基因
WRKY 1
MP00506
7173 9818 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00272
7172 9889 查靶基因
bZIP 1
MP00184
7147 9840 查靶基因
bZIP 1
MP00647
7133 9953 查靶基因
C2H2 1
MP00485
7130 8059 查靶基因
MYB 1
MP00134
7078 8676 查靶基因
ERF 1
MP00312
7006 8490 查靶基因
MYB 1
MP00564
6984 9893 查靶基因
G2-like 1
MP00022
6959 9720 查靶基因
bZIP 1
MP00040
6920 9919 查靶基因
ERF 1
MP00151
6907 9976 查靶基因
WRKY 1
MP00455
6900 9792 查靶基因
MYB 1
MP00482
6899 8940 查靶基因
bZIP 1
MP00291
6894 9321 查靶基因
SBP 1
MP00307
6893 9755 查靶基因
bHLH 1
MP00195
6878 9832 查靶基因
MYB 1
MP00388
6870 9774 查靶基因
bZIP 1
MP00318
6849 9413 查靶基因
SBP 1
MP00633
6833 8026 查靶基因
bHLH 1
MP00308
6805 9826 查靶基因
bHLH 1
MP00082
6784 9435 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00080
6766 9850 查靶基因
MYB 1
MP00028
6764 9024 查靶基因
MYB 1
MP00191
6736 9690 查靶基因
bHLH 1
MP00081
6729 9942 查靶基因
MYB 1
MP00500
6697 9681 查靶基因
ERF 1
MP00452
6671 7783 查靶基因
WRKY 1
MP00531
6663 9784 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00200
6661 9930 查靶基因
bHLH 1
MP00034
6653 9929 查靶基因
bHLH 1
MP00660
6653 9929 查靶基因
MYB 1
MP00055
6638 9685 查靶基因
SBP 1
MP00634
6619 7771 查靶基因
bHLH 1
MP00035
6618 9903 查靶基因
MYB_related 1
MP00568
6611 9696 查靶基因
bZIP 1
MP00039
6610 9936 查靶基因
WRKY 1
MP00284
6552 9774 查靶基因
WRKY 1
MP00422
6535 9791 查靶基因
ARF 1
MP00153
6534 9706 查靶基因
YABBY 1
MP00620
6504 9844 查靶基因
TCP 1
MP00169
6498 7295 查靶基因
G2-like 1
MP00252
6478 9780 查靶基因
NAC 1
MP00108
6458 9810 查靶基因
TCP 1
MP00062
6454 7249 查靶基因
RAV 1
MP00024
6450 9853 查靶基因
WRKY 1
MP00167
6439 9756 查靶基因
C2H2 1
MP00416
6433 9716 查靶基因
C2H2 1
MP00608
6398 9817 查靶基因
ERF 1
MP00240
6368 9978 查靶基因
MYB_related 1
MP00607
6362 9718 查靶基因
Dof 1
MP00402
6278 9875 查靶基因
bZIP 1
MP00409
6252 8429 查靶基因
GRAS 1
MP00611
6232 9807 查靶基因
bZIP 1
MP00648
6170 9939 查靶基因
ERF 1
MP00120
6144 7514 查靶基因
WRKY 1
MP00251
6140 9713 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00077
6125 9815 查靶基因
GATA 1
MP00130
6015 9821 查靶基因
MIKC_MADS 1
MP00508
5979 7481 查靶基因
WRKY 1
MP00260
5932 9706 查靶基因
HD-ZIP 1
MP00013
5927 9712 查靶基因
WRKY 1
MP00299
5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr02G003688; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00003637-RA_Salv SmilChr02G003688 MYB XP_057794248.1 MP00028 GGCTCAGCGCG

可能结合的靶基因

9024 个结合位点 6764 个候选靶基因 第 61 / 136 下载 TSV

上一页 61 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr05G000712 Chr05 NC_080391.1:5382513-5382523promoter 内 1894-1904 bp - 2097 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 5384620-5387561(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTA
SmilChr06G002589 Chr06 NC_080392.1:37098455-37098465promoter 内 1878-1888 bp + 2113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 37093838-37096342(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCT
SmilChr04G002922 Chr04 NC_080390.1:45485660-45485670promoter 内 1830-1840 bp - 2161 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 45478991-45483499(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCCCAGCGCG
SmilChr01G002457 Chr01 NC_080387.1:42183399-42183409promoter 内 1806-1816 bp - 2185 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 42185594-42186616(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr04G000878 Chr04 NC_080390.1:11129583-11129593promoter 内 1724-1734 bp - 2267 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11131860-11135369(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr07G000542 Chr07 NC_080393.1:3740795-3740805promoter 内 1694-1704 bp - 2297 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3735971-3738498(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAG
SmilChr01G004008 Chr01 NC_080387.1:58462745-58462755promoter 内 1641-1651 bp - 2350 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 58453702-58460395(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr07G000132 Chr07 NC_080393.1:789535-789545promoter 内 1638-1648 bp - 2353 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 785758-787182(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr03G004397 Chr03 NC_080389.1:62162685-62162695promoter 内 1488-1498 bp + 2503 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62165198-62168913(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr03G004385 Chr03 NC_080389.1:62058630-62058640promoter 内 1379-1389 bp + 2612 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 62061252-62064809(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr01G000915 Chr01 NC_080387.1:19369206-19369216promoter 内 1317-1327 bp + 2674 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 19361987-19366532(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTG
SmilChr02G000147 Chr02 NC_080388.1:1969049-1969059promoter 内 1311-1321 bp + 2680 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 1963212-1966369(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTA
SmilChr02G003204 Chr02 NC_080388.1:53185273-53185283promoter 内 1260-1270 bp + 2731 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 53180172-53182542(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCT
SmilChr03G002163 Chr03 NC_080389.1:33668824-33668834promoter 内 1177-1187 bp - 2814 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 33663530-33666010(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr03G000719 Chr03 NC_080389.1:8055722-8055732promoter 内 1143-1153 bp + 2848 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 8058580-8060311(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCACAGCGCG
SmilChr08G000859 Chr08 NC_080394.1:6369098-6369108promoter 内 1132-1142 bp + 2859 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 6371967-6374546(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGT
SmilChr04G001356 Chr04 NC_080390.1:22047061-22047071promoter 内 1112-1122 bp - 2879 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 22040387-22044182(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGT
SmilChr03G004350 Chr03 NC_080389.1:61759337-61759347promoter 内 1020-1030 bp + 2971 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 61754823-61756366(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGGGGT
SmilChr07G001787 Chr07 NC_080393.1:15210561-15210571promoter 内 980-990 bp - 3011 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 15205233-15207550(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGGT
SmilChr08G000513 Chr08 NC_080394.1:3735402-3735412promoter 内 878-888 bp + 3113 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 3738525-3738995(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr03G004551 Chr03 NC_080389.1:63475493-63475503promoter 内 838-848 bp - 3153 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 63478656-63481096(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr02G000859 Chr02 NC_080388.1:14759615-14759625promoter 内 692-702 bp - 3299 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14755255-14756316(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCACAGCGCG
SmilChr08G001326 Chr08 NC_080394.1:10610946-10610956promoter 内 679-689 bp - 3312 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10607562-10607634(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCTCAGCGAG
SmilChr02G002835 Chr02 NC_080388.1:48502934-48502944promoter 内 557-567 bp - 3434 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 48496202-48499500(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr04G001236 Chr04 NC_080390.1:19401796-19401806promoter 内 555-565 bp - 3436 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 19384480-19398360(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGGTCAGCGCA
SmilChr08G001163 Chr08 NC_080394.1:9293593-9293603promoter 内 543-553 bp + 3448 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9297051-9299492(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr08G002078 Chr08 NC_080394.1:18686582-18686592promoter 内 412-422 bp - 3579 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 18678957-18683003(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TACTCAGCGGC
SmilChr06G001047 Chr06 NC_080392.1:10352473-10352483promoter 内 362-372 bp + 3629 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 10346112-10348844(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGC
SmilChr03G001171 Chr03 NC_080389.1:13469845-13469855promoter 内 307-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 13464853-13466161(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGCCCA
SmilChr04G001046 Chr04 NC_080390.1:14873491-14873501promoter 内 307-317 bp - 3684 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 14877185-14877936(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTA
SmilChr01G002765 Chr01 NC_080387.1:46054371-46054381promoter 内 231-241 bp + 3760 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 46045836-46050611(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGC
SmilChr07G001456 Chr07 NC_080393.1:11406142-11406152promoter 内 228-238 bp + 3763 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 11409915-11416249(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 AGCACAGCGCG
SmilChr05G003377 Chr05 NC_080391.1:44662092-44662102promoter 内 149-159 bp - 3842 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44665944-44677322(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr02G003034 Chr02 NC_080388.1:51051880-51051890promoter 内 148-158 bp - 3843 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51055733-51058690(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCCGCTGAGTA
SmilChr07G002016 Chr07 NC_080393.1:17988571-17988581promoter 内 134-144 bp + 3857 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 17981088-17984714(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGTG
SmilChr04G000062 Chr04 NC_080390.1:568046-568056promoter 内 117-127 bp - 3874 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 563072-564172(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCCCAGCGCG
SmilChr01G002602 Chr01 NC_080387.1:44224264-44224274promoter 内 38-48 bp + 3953 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 44219221-44220311(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCGCTGTGCT
SmilChr08G001211 Chr08 NC_080394.1:9802326-9802336promoter 内 36-46 bp + 3955 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 9789896-9798371(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 TGGGCTGAGCC
SmilChr08G004184 Chr08 NC_080394.1:51253960-51253970promoter 内 29-39 bp - 3962 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.3/ 100 1 51257932-51260383(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CTCGCTGAGGC
SmilChr06G002345 Chr06 NC_080392.1:34142418-34142428promoter 内 2569-2579 bp + 1422 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 3 34143850-34144551(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCTCAGGGCT
SmilChr06G001450 Chr06 NC_080392.1:15318997-15319007promoter 内 3790-3800 bp + 201 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 15313273-15318796(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 ACCGCTGAGGA
SmilChr05G002287 Chr05 NC_080391.1:24633866-24633876promoter 内 3730-3740 bp + 261 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 24634137-24641537(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTTCAGCGCC
SmilChr03G001377 Chr03 NC_080389.1:16302128-16302138promoter 内 3550-3560 bp + 441 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 16302579-16304191(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGCTCAGCACC
SmilChr07G002314 Chr07 NC_080393.1:21424232-21424242promoter 内 3534-3544 bp + 457 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 21418686-21423775(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGTG
SmilChr06G000500 Chr06 NC_080392.1:4112198-4112208promoter 内 2833-2843 bp - 1158 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 4102097-4111040(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CGTTCAGCGCC
SmilChr03G002169 Chr03 NC_080389.1:33741056-33741066promoter 内 2738-2748 bp - 1253 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 33738165-33739803(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 CACTCAGCGTC
SmilChr08G001670 Chr08 NC_080394.1:13936014-13936024promoter 内 2491-2501 bp + 1500 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 13930931-13934514(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GACGCTGAGGA
SmilChr07G000139 Chr07 NC_080393.1:835369-835379promoter 内 2427-2437 bp + 1564 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 831120-833805(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GCGGCTGAGCG
SmilChr08G004653 Chr08 NC_080394.1:56047108-56047118promoter 内 2262-2272 bp + 1729 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 56043115-56045379(-) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGG
SmilChr01G005271 Chr01 NC_080387.1:70147710-70147720promoter 内 1538-1548 bp - 2453 bp 位于靶基因 TSS 上游 93.2/ 100 2 70150173-70151000(+) SMil_00003637-RA_Salv MP00028 GGCGCTGACGG