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转录因子靶基因检索

输入丹参转录因子 ID、统一 Gene ID、LOC/GeneID、Protein ID、motif ID 或 TF family，查询该转录因子在全基因组 promoter 中的预计算潜在结合位点及对应靶基因。
257motifs
38157预生成 promoter
1892224预计算 TF 位点
257已建索引 TF/motif

候选靶基因的证据边界

靶基因列表来自预计算的 4 kb promoter motif 命中，并通过当前 TF/motif 对应关系检索。它表示 motif 支持的候选靶基因，不表示丹参中已经验证的直接调控关系。不同转录因子可共享相近 motif；应结合表达、遗传和结合实验进行确认。

可用转录因子列表

下表来自当前丹参 TF motif 与靶基因预计算索引，可按 TF family、标准 Gene ID、旧 ID、NCBI/GeneID、Protein ID 或 motif ID 检索。点击任意基因/蛋白 ID 可跳转到 Gene Card，点击“查靶基因”可直接进入候选靶基因结果页。

示例
100 / 257 个 TF 条目 阈值 0.90 1892224 预计算位点
转录因子 ID Family Motifs 候选靶基因 候选位点 操作
SmilChr04G003117 XP_057809539.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr04G003114 XP_057809538.1
C2H2 1
MP00592
 8519 9901 查靶基因
SmilChr01G005298 XP_057788621.1
ARR-B 1
MP00010
 8344 9778 查靶基因
SmilChr03G003924 XP_057798851.1
NAC 1
MP00059
 8333 9940 查靶基因
SmilChr01G005344 XP_057788686.1
MYB 1
MP00296
 8304 9873 查靶基因
SmilChr08G004408 XP_057780613.1
MYB 1
MP00114
 8151 9897 查靶基因
SmilChr04G001094 XP_057804404.1
WRKY 1
MP00408
 8149 9902 查靶基因
SmilChr07G003597 XP_057773587.1
Nin-like 1
MP00449
 8096 9453 查靶基因
SmilChr02G005433 XP_057792682.1
WRKY 1
MP00209
 8083 9910 查靶基因
SmilChr04G004136 XP_057806072.1
MYB 1
MP00627
 8075 9835 查靶基因
SmilChr01G003955 XP_057779712.1
WRKY 1
MP00450
 8044 9901 查靶基因
SmilChr03G003685 XP_057798538.1
ERF 1
MP00558
 8044 9762 查靶基因
SmilChr07G002937 XP_057777490.1
MIKC_MADS 1
MP00096
 8019 9914 查靶基因
SmilChr02G003833 XP_057794421.1
MYB 1
MP00476
 7981 9904 查靶基因
SmilChr07G002803 XP_057777238.1
NAC 1
MP00221
 7965 9903 查靶基因
SmilChr05G002364 XP_057809766.1
WRKY 1
MP00069
 7882 9917 查靶基因
SmilChr08G003267 XP_057779249.1
MYB 1
MP00406
 7839 9917 查靶基因
SmilChr02G005012 XP_057792191.1
TALE 1
MP00670
 7758 9906 查靶基因
SmilChr07G001978 XP_057776996.1
SBP 1
MP00555
 7648 9805 查靶基因
SmilChr05G000741 XP_057764423.1
ARF 1
MP00021
 7629 9812 查靶基因
SmilChr01G004579 XP_057787263.1
MYB 1
MP00132
 7583 9926 查靶基因
SmilChr05G000593 XP_057764223.1
MIKC_MADS 1
MP00609
 7575 9941 查靶基因
SmilChr03G004518 XP_057799834.1
ERF 1
MP00529
 7559 9247 查靶基因
SmilChr06G001829 XP_057766988.1
MYB 1
MP00510
 7526 9799 查靶基因
SmilChr05G000830 XP_057764550.1
NAC 1
MP00058
 7440 9855 查靶基因
SmilChr08G002543 XP_057778423.1
bZIP 1
MP00303
 7416 9868 查靶基因
SmilChr01G002743 XP_057765725.1
MYB_related 1
MP00565
 7412 9785 查靶基因
SmilChr04G002704 XP_057807081.1
ERF 1
MP00026
 7408 9854 查靶基因
SmilChr05G001395 XP_057765344.1
WRKY 1
MP00071
 7408 9764 查靶基因
SmilChr04G002953 XP_057809314.1
ARF 1
MP00033
 7406 9827 查靶基因
SmilChr01G004199 XP_057782208.1
bHLH 1
MP00074
 7396 9969 查靶基因
SmilChr05G004009 XP_057810662.1
MYB 1
MP00216
 7342 9832 查靶基因
SmilChr03G001606 XP_057802772.1
WRKY 1
MP00539
 7338 9848 查靶基因
SmilChr02G004600 XP_057791481.1
ARF 1
MP00574
 7302 9846 查靶基因
SmilChr03G004179 XP_057799230.1
WRKY 1
MP00464
 7299 9864 查靶基因
SmilChr04G003805 XP_057805691.1
MIKC_MADS 1
MP00315
 7291 9567 查靶基因
SmilChr03G003761 XP_057798625.1
WRKY 1
MP00525
 7235 9838 查靶基因
SmilChr01G001885 XP_057806790.1
WRKY 1
MP00171
 7182 9833 查靶基因
SmilChr05G004392 XP_057811204.1
WRKY 1
MP00506
 7173 9818 查靶基因
SmilChr04G002757 XP_057807158.1
MIKC_MADS 1
MP00272
 7172 9889 查靶基因
SmilChr01G003404 XP_057773670.1
bZIP 1
MP00184
 7147 9840 查靶基因
SmilChr03G002335 XP_057801256.1
bZIP 1
MP00647
 7133 9953 查靶基因
SmilChr07G002075 XP_057773918.1
C2H2 1
MP00485
 7130 8059 查靶基因
SmilChr04G000162 XP_057807467.1
MYB 1
MP00134
 7078 8676 查靶基因
SmilChr04G000040 XP_057808382.1
ERF 1
MP00312
 7006 8490 查靶基因
SmilChr08G001896 XP_057783815.1
MYB 1
MP00564
 6984 9893 查靶基因
SmilChr02G005217 XP_057792502.1
G2-like 1
MP00022
 6959 9720 查靶基因
SmilChr05G000260 XP_057763683.1
bZIP 1
MP00040
 6920 9919 查靶基因
SmilChr01G002885 XP_057767601.1
ERF 1
MP00151
 6907 9976 查靶基因
SmilChr05G001518 XP_057765511.1
WRKY 1
MP00455
 6900 9792 查靶基因
SmilChr03G002503 XP_057801356.1
MYB 1
MP00482
 6899 8940 查靶基因
SmilChr03G001252 XP_057802461.1
bZIP 1
MP00291
 6894 9321 查靶基因
SmilChr06G001365 XP_057768799.1
SBP 1
MP00307
 6893 9755 查靶基因
SmilChr03G003439 XP_057798243.1
bHLH 1
MP00195
 6878 9832 查靶基因
SmilChr06G001111 XP_057768512.1
MYB 1
MP00388
 6870 9774 查靶基因
SmilChr02G000949 XP_057795176.1
bZIP 1
MP00318
 6849 9413 查靶基因
SmilChr01G000025 XP_057790305.1
SBP 1
MP00633
 6833 8026 查靶基因
SmilChr01G004313 XP_057783598.1
bHLH 1
MP00308
 6805 9826 查靶基因
SmilChr02G005502 XP_057792768.1
bHLH 1
MP00082
 6784 9435 查靶基因
SmilChr03G004274 XP_057799397.1
MIKC_MADS 1
MP00080
 6766 9850 查靶基因
SmilChr02G003688 XP_057794248.1
MYB 1
MP00028
 6764 9024 查靶基因
SmilChr04G003367 XP_057804957.1
MYB 1
MP00191
 6736 9690 查靶基因
SmilChr04G000157 XP_057807462.1
bHLH 1
MP00081
 6729 9942 查靶基因
SmilChr07G002147 XP_057774045.1
MYB 1
MP00500
 6697 9681 查靶基因
SmilChr05G002277 XP_057809665.1
ERF 1
MP00452
 6671 7783 查靶基因
SmilChr07G004480 XP_057776222.1
WRKY 1
MP00531
 6663 9784 查靶基因
SmilChr02G004447 XP_057797242.1
HD-ZIP 1
MP00200
 6661 9930 查靶基因
SmilChr04G000070 XP_057807324.1
bHLH 1
MP00034
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G002039 XP_057808459.1
bHLH 1
MP00660
 6653 9929 查靶基因
SmilChr01G005851 XP_057789306.1
MYB 1
MP00055
 6638 9685 查靶基因
SmilChr02G005238 XP_057792594.1
SBP 1
MP00634
 6619 7771 查靶基因
SmilChr06G002048 XP_057770293.1
bHLH 1
MP00035
 6618 9903 查靶基因
SmilChr07G000836 XP_057772437.1
MYB_related 1
MP00568
 6611 9696 查靶基因
SmilChr04G003119 XP_057809542.1
bZIP 1
MP00039
 6610 9936 查靶基因
SmilChr01G004114 XP_057781125.1
WRKY 1
MP00284
 6552 9774 查靶基因
SmilChr08G004246 XP_057780410.1
WRKY 1
MP00422
 6535 9791 查靶基因
SmilChr05G001980 XP_057766076.1
ARF 1
MP00153
 6534 9706 查靶基因
SmilChr04G000094 XP_057807365.1
YABBY 1
MP00620
 6504 9844 查靶基因
SmilChr02G002534 XP_057797741.1
TCP 1
MP00169
 6498 7295 查靶基因
SmilChr05G001269 XP_057765199.1
G2-like 1
MP00252
 6478 9780 查靶基因
SmilChr07G003441 XP_057773618.1
NAC 1
MP00108
 6458 9810 查靶基因
SmilChr02G001791 XP_057795933.1
TCP 1
MP00062
 6454 7249 查靶基因
SmilChr05G003285 XP_057810127.1
RAV 1
MP00024
 6450 9853 查靶基因
SmilChr05G000619 XP_057764205.1
WRKY 1
MP00167
 6439 9756 查靶基因
SmilChr04G003745 XP_057809144.1
C2H2 1
MP00416
 6433 9716 查靶基因
SmilChr02G004607 XP_057791470.1
C2H2 1
MP00608
 6398 9817 查靶基因
SmilChr02G003399 XP_057793859.1
ERF 1
MP00240
 6368 9978 查靶基因
SmilChr01G004920 XP_057788125.1
MYB_related 1
MP00607
 6362 9718 查靶基因
SmilChr06G001059 XP_057768449.1
Dof 1
MP00402
 6278 9875 查靶基因
SmilChr01G004552 XP_057786668.1
bZIP 1
MP00409
 6252 8429 查靶基因
SmilChr01G006187 XP_057798078.1
GRAS 1
MP00611
 6232 9807 查靶基因
SmilChr01G001516 XP_057803325.1
bZIP 1
MP00648
 6170 9939 查靶基因
SmilChr04G003955 XP_057805828.1
ERF 1
MP00120
 6144 7514 查靶基因
SmilChr01G004708 XP_057787833.1
WRKY 1
MP00251
 6140 9713 查靶基因
SmilChr05G001961 XP_057766054.1
MIKC_MADS 1
MP00077
 6125 9815 查靶基因
SmilChr08G000478 XP_057781809.1
GATA 1
MP00130
 6015 9821 查靶基因
SmilChr01G000943 XP_057790035.1
MIKC_MADS 1
MP00508
 5979 7481 查靶基因
SmilChr05G004106 XP_057810779.1
WRKY 1
MP00260
 5932 9706 查靶基因
SmilChr04G003973 XP_057805857.1
HD-ZIP 1
MP00013
 5927 9712 查靶基因
SmilChr03G002207 XP_057801109.1
WRKY 1
MP00299
 5919 9699 查靶基因

匹配到的 TF / motif

输入: SmilChr06G001059; 匹配 1 motifs; 阈值: 0.90

TF ID新 Gene ID家族ProteinMotif共识序列
SMil_00014491-RA_Salv SmilChr06G001059 Dof XP_057768449.1 MP00402 TTTTTTTTTTTTTTACTTTTT

可能结合的靶基因

9875 个结合位点 6278 个候选靶基因 第 68 / 126 下载 TSV

上一页 68 下一页 每页最多 50 个靶基因
靶基因 染色体 最佳结合位点 链方向 靶基因上游距离 结合可能性 启动子命中位点 基因区间 TF Motif 匹配序列
SmilChr02G002658 Chr02 NC_080388.1:46010615-46010635promoter 内 1090-1110 bp - 2891 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 46013526-46016442(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAGAATAAATAAAG
SmilChr03G000430 Chr03 NC_080389.1:4671169-4671189promoter 内 1075-1095 bp + 2906 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 4666578-4668263(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAGAAAAATAAAAAT
SmilChr02G005014 Chr02 NC_080388.1:71921620-71921640promoter 内 1059-1079 bp - 2922 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 71924562-71926068(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAGGTGAATAA
SmilChr01G001444 Chr01 NC_080387.1:28140741-28140761promoter 内 1040-1060 bp - 2941 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 28136280-28137800(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CATTTTTCATACCTACTTTTT
SmilChr03G000889 Chr03 NC_080389.1:10165966-10165986promoter 内 870-890 bp + 3111 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 10157737-10162855(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AGAAAGTAAAAGAAACAAAAT
SmilChr01G000006 Chr01 NC_080387.1:147655-147675promoter 内 784-804 bp - 3197 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 150872-154321(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAGAATAAATAAAG
SmilChr02G004648 Chr02 NC_080388.1:68908465-68908485promoter 内 744-764 bp - 3237 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 68911722-68913135(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TAAAAGTAGTAAAAGAAGACT
SmilChr02G003076 Chr02 NC_080388.1:51680457-51680477promoter 内 717-737 bp - 3264 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 51683741-51687524(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAGAATAAATAAAG
SmilChr02G001205 Chr02 NC_080388.1:22220074-22220094promoter 内 701-721 bp - 3280 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 22223374-22227993(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAGGTGAATAA
SmilChr03G000526 Chr03 NC_080389.1:5637570-5637590promoter 内 693-713 bp + 3288 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5640878-5642924(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTATTCACCTTTTCACTTTTT
SmilChr01G001304 Chr01 NC_080387.1:25981881-25981901promoter 内 689-709 bp - 3292 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 25985193-25986678(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAAGTAAGGGGTGGAAGAG
SmilChr02G005174 Chr02 NC_080388.1:73038311-73038331promoter 内 587-607 bp + 3394 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 73041725-73043570(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAGTTTAGCTTTCTACTTTTC
SmilChr03G000583 Chr03 NC_080389.1:6504313-6504333promoter 内 584-604 bp - 3397 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6500139-6500916(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTTCCGCGTTAGTTACTTTTC
SmilChr02G003848 Chr02 NC_080388.1:60215287-60215307promoter 内 433-453 bp + 3548 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 60218855-60219814(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CCATATTTTCGTCTACTTTTC
SmilChr01G005686 Chr01 NC_080387.1:73109429-73109449promoter 内 427-447 bp - 3554 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 73113003-73117631(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTAAAATAATAAATAA
SmilChr02G001917 Chr02 NC_080388.1:34503957-34503977promoter 内 415-435 bp + 3566 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 34507543-34508333(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGCTCTATCAGTCTACTTTTT
SmilChr03G000314 Chr03 NC_080389.1:3582103-3582123promoter 内 389-409 bp - 3592 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 3575411-3578511(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CCCAATTTCCTTTTACTTTTA
SmilChr01G000343 Chr01 NC_080387.1:7001029-7001049promoter 内 286-306 bp - 3695 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 7004744-7008154(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAGGTGAATAA
SmilChr01G004852 Chr01 NC_080387.1:66687377-66687397promoter 内 282-302 bp + 3699 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 66682128-66683678(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTAAAGTAAAAAAAAAACTGT
SmilChr03G000508 Chr03 NC_080389.1:5479994-5480014promoter 内 246-266 bp + 3735 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 5483749-5488480(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTTTTTATATTACCTTTAT
SmilChr03G000556 Chr03 NC_080389.1:6011214-6011234promoter 内 233-253 bp + 3748 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 6014982-6020144(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTATTCACCTTTTCACTTTTT
SmilChr01G004320 Chr01 NC_080387.1:61368769-61368789promoter 内 198-218 bp + 3783 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 61372572-61375018(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ACGCATCACTTTCAACTTTTT
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SmilChr01G003940 Chr01 NC_080387.1:57746261-57746281promoter 内 125-145 bp - 3856 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 57740197-57742405(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTATCATTTTTTTTACTTTAT
SmilChr02G004462 Chr02 NC_080388.1:67041814-67041834promoter 内 7-27 bp + 3974 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.2/ 100 1 67036686-67037840(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGTAAGAATAAATAAAG
SmilChr02G004477 Chr02 NC_080388.1:67166943-67166963promoter 内 708-728 bp + 3273 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 4 67170236-67180519(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AATTTTTTTTCGTAACTTTTT
SmilChr02G001123 Chr02 NC_080388.1:20329279-20329299promoter 内 3776-3796 bp + 205 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 20326082-20329074(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGGCCAAAAAAAAAAAA
SmilChr01G003141 Chr01 NC_080387.1:50247189-50247209promoter 内 3727-3747 bp - 254 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 50247463-50250725(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTTGAAAATTCAGGAC
SmilChr01G005368 Chr01 NC_080387.1:70895475-70895495promoter 内 3500-3520 bp + 481 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 70892558-70894994(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAAAAATGAATAC
SmilChr02G003411 Chr02 NC_080388.1:55274282-55274302promoter 内 3376-3396 bp + 605 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 55274907-55280014(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATTAACTTTTTTCCACTTTTT
SmilChr02G004589 Chr02 NC_080388.1:68380676-68380696promoter 内 3133-3153 bp - 848 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 68377213-68379828(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ACCGTTCTCTTTAAACTTTTT
SmilChr01G001464 Chr01 NC_080387.1:28442127-28442147promoter 内 2476-2496 bp - 1505 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 28438186-28440622(-) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TGCTTGTGTTATTTACTTTAT
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SmilChr01G002820 Chr01 NC_080387.1:46757861-46757881promoter 内 1489-1509 bp - 2492 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 46760373-46763928(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 AAAAAGTGAAATAGTAATAGA
SmilChr01G003989 Chr01 NC_080387.1:58311408-58311428promoter 内 1202-1222 bp + 2779 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 58314207-58315187(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 ATACCTTTTGCTCCACTTTTT
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SmilChr01G004198 Chr01 NC_080387.1:60449515-60449535promoter 内 639-659 bp + 3342 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 3 60452877-60464940(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 TTTTATCTTCATTTACTTTAT
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SmilChr02G005046 Chr02 NC_080388.1:72196419-72196439promoter 内 3772-3792 bp - 209 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 72196648-72208636(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GAAAAGGCCAAAAAAAAAAAA
SmilChr02G002716 Chr02 NC_080388.1:47008335-47008355promoter 内 3750-3770 bp - 231 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 47008586-47011369(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CTAAAGTAAAAATAAAAATAA
SmilChr02G002957 Chr02 NC_080388.1:50101232-50101252promoter 内 3652-3672 bp - 329 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 50101581-50105146(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 CAAAGGGGAAAGAAAAAAAAA
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SmilChr03G000075 Chr03 NC_080389.1:920138-920158promoter 内 3337-3357 bp + 644 bp 位于靶基因 TSS 上游 92.1/ 100 2 920802-925292(+) SMil_00014491-RA_Salv MP00402 GTGATTTCCTTTTTACTTTTA